RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489424.5

HDAC10-216, Transcript of histone deacetylase 10, human

TSL 5

Gene HDAC10, Length 759 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC10-216	ENST00000489424	CNOT10	Q9H9A5	744 aa	Known RBP	16.39	■□□□□ 0.21
HDAC10-216	ENST00000489424	CUEDC1	Q9NWM3	386 aa	Predicted RBP	16.39	■□□□□ 0.21
HDAC10-216	ENST00000489424	PSMC3IP	Q9P2W1	217 aa	Predicted RBP	16.39	■□□□□ 0.21
HDAC10-216	ENST00000489424	TRPC4	Q9UBN4	977 aa		16.39	■□□□□ 0.21
HDAC10-216	ENST00000489424	RNF112	Q9ULX5	631 aa		16.39	■□□□□ 0.21
HDAC10-216	ENST00000489424	LRRK2	Q5S007	2527 aa		16.38	■□□□□ 0.21
HDAC10-216	ENST00000489424	SYCE1L	A8MT33	242 aa		16.38	■□□□□ 0.21
HDAC10-216	ENST00000489424	CDK2AP1	O14519	115 aa		16.38	■□□□□ 0.21
HDAC10-216	ENST00000489424	C2	P06681	752 aa		16.38	■□□□□ 0.21
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC35E2B	P0CK96	405 aa		16.38	■□□□□ 0.21
HDAC10-216	ENST00000489424	COL6A2	P12110	1019 aa		16.38	■□□□□ 0.21
HDAC10-216	ENST00000489424	CD1D	P15813	335 aa		16.38	■□□□□ 0.21
HDAC10-216	ENST00000489424	CCR8	P51685	355 aa		16.38	■□□□□ 0.21
HDAC10-216	ENST00000489424	IFFO1	Q0D2I5	559 aa		16.38	■□□□□ 0.21
HDAC10-216	ENST00000489424	PWP1	Q13610	501 aa		16.38	■□□□□ 0.21
HDAC10-216	ENST00000489424	TSN	Q15631	228 aa	Known RBP	16.38	■□□□□ 0.21
HDAC10-216	ENST00000489424	PHKG1	Q16816	387 aa		16.38	■□□□□ 0.21
HDAC10-216	ENST00000489424	PLEKHN1	Q494U1	663 aa	Predicted RBP	16.38	■□□□□ 0.21
HDAC10-216	ENST00000489424	CDKL4	Q5MAI5	379 aa		16.38	■□□□□ 0.21
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM214	Q6NUQ4	689 aa	Known RBP	16.38	■□□□□ 0.21
HDAC10-216	ENST00000489424	RPUSD3	Q6P087	351 aa	Known RBP	16.38	■□□□□ 0.21
HDAC10-216	ENST00000489424	SBSN	Q6UWP8	590 aa		16.38	■□□□□ 0.21
HDAC10-216	ENST00000489424	VN1R4	Q7Z5H5	301 aa		16.38	■□□□□ 0.21
HDAC10-216	ENST00000489424	KBTBD2	Q8IY47	623 aa		16.38	■□□□□ 0.21
HDAC10-216	ENST00000489424	KIAA1191	Q96A73	305 aa		16.38	■□□□□ 0.21
HDAC10-216	ENST00000489424	WDR77	Q9BQA1	342 aa	Predicted RBP	16.38	■□□□□ 0.21
HDAC10-216	ENST00000489424	EPS8L2	Q9H6S3	715 aa		16.38	■□□□□ 0.21
HDAC10-216	ENST00000489424	RIC8B	Q9NVN3	520 aa		16.38	■□□□□ 0.21
HDAC10-216	ENST00000489424	RP1L1	Q8IWN7	2480 aa	Predicted RBP	16.37	■□□□□ 0.21
HDAC10-216	ENST00000489424	TRIM49D1	C9J1S8	452 aa		16.37	■□□□□ 0.21
HDAC10-216	ENST00000489424	KLHL2	O95198	593 aa		16.37	■□□□□ 0.21
HDAC10-216	ENST00000489424	BMP10	O95393	424 aa		16.37	■□□□□ 0.21
HDAC10-216	ENST00000489424	SERPINA7	P05543	415 aa		16.37	■□□□□ 0.21
HDAC10-216	ENST00000489424	HEXB	P07686	556 aa		16.37	■□□□□ 0.21
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC35G6	P0C7Q6	338 aa		16.37	■□□□□ 0.21
HDAC10-216	ENST00000489424	ATXN8OS	P0DMR3	200 aa		16.37	■□□□□ 0.21
HDAC10-216	ENST00000489424	TSFM	P43897	325 aa	Known RBP	16.37	■□□□□ 0.21
HDAC10-216	ENST00000489424	HERC3	Q15034	1050 aa		16.37	■□□□□ 0.21
HDAC10-216	ENST00000489424	ACAP2	Q15057	778 aa		16.37	■□□□□ 0.21
HDAC10-216	ENST00000489424	TSNAXIP1	Q2TAA8	658 aa		16.37	■□□□□ 0.21
HDAC10-216	ENST00000489424	VWA2	Q5GFL6	755 aa		16.37	■□□□□ 0.21
HDAC10-216	ENST00000489424	UBAP2	Q5T6F2	1119 aa	Known RBP	16.37	■□□□□ 0.21
HDAC10-216	ENST00000489424	ISLR2	Q6UXK2	745 aa		16.37	■□□□□ 0.21
HDAC10-216	ENST00000489424	SPATA6L	Q8N4H0	392 aa		16.37	■□□□□ 0.21
HDAC10-216	ENST00000489424	MFSD9	Q8NBP5	474 aa		16.37	■□□□□ 0.21
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC13A3	Q8WWT9	602 aa		16.37	■□□□□ 0.21
HDAC10-216	ENST00000489424	CAVIN3	Q969G5	261 aa		16.37	■□□□□ 0.21
HDAC10-216	ENST00000489424	SEC16B	Q96JE7	1060 aa		16.37	■□□□□ 0.21
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF700	Q9H0M5	742 aa		16.37	■□□□□ 0.21
HDAC10-216	ENST00000489424	ATG10	Q9H0Y0	220 aa		16.37	■□□□□ 0.21
HDAC10-216	ENST00000489424	SYNPO2L	Q9H987	977 aa		16.37	■□□□□ 0.21
HDAC10-216	ENST00000489424	CD274	Q9NZQ7	290 aa		16.37	■□□□□ 0.21
HDAC10-216	ENST00000489424	PRRC2C	Q9Y520	2896 aa	Known RBP	16.37	■□□□□ 0.21
HDAC10-216	ENST00000489424	PCSK5	Q92824	1860 aa		16.37	■□□□□ 0.21
HDAC10-216	ENST00000489424	SHANK1	Q9Y566	2161 aa		16.36	■□□□□ 0.21
HDAC10-216	ENST00000489424	IGHV1-45	A0A0A0MS14	117 aa		16.36	■□□□□ 0.21
HDAC10-216	ENST00000489424	NSG1	A0A0A6YYJ2	146 aa		16.36	■□□□□ 0.21
HDAC10-216	ENST00000489424	TRBC2	A0A5B9	178 aa		16.36	■□□□□ 0.21
HDAC10-216	ENST00000489424	ERLIN1	O75477	346 aa		16.36	■□□□□ 0.21
HDAC10-216	ENST00000489424	WISP3	O95389	354 aa	Predicted RBP	16.36	■□□□□ 0.21
HDAC10-216	ENST00000489424	RBP1	P09455	135 aa		16.36	■□□□□ 0.21
HDAC10-216	ENST00000489424	COX6A1	P12074	109 aa		16.36	■□□□□ 0.21
HDAC10-216	ENST00000489424	TFEB	P19484	476 aa		16.36	■□□□□ 0.21
HDAC10-216	ENST00000489424	AHR	P35869	848 aa		16.36	■□□□□ 0.21
HDAC10-216	ENST00000489424	HSD17B3	P37058	310 aa		16.36	■□□□□ 0.21
HDAC10-216	ENST00000489424	BCL6	P41182	706 aa		16.36	■□□□□ 0.21
HDAC10-216	ENST00000489424	MFAP5	Q13361	173 aa		16.36	■□□□□ 0.21
HDAC10-216	ENST00000489424	TGFBI	Q15582	683 aa		16.36	■□□□□ 0.21
HDAC10-216	ENST00000489424	PPP1R3A	Q16821	1122 aa		16.36	■□□□□ 0.21
HDAC10-216	ENST00000489424	SULT1C3	Q6IMI6	304 aa		16.36	■□□□□ 0.21
HDAC10-216	ENST00000489424	ASPG	Q86U10	573 aa		16.36	■□□□□ 0.21
HDAC10-216	ENST00000489424	LAPTM4B	Q86VI4	370 aa		16.36	■□□□□ 0.21
HDAC10-216	ENST00000489424	KLHDC8A	Q8IYD2	350 aa		16.36	■□□□□ 0.21
HDAC10-216	ENST00000489424	AEN	Q8WTP8	325 aa	Known RBP	16.36	■□□□□ 0.21
HDAC10-216	ENST00000489424	OR1F2P	Q96R84	312 aa		16.36	■□□□□ 0.21
HDAC10-216	ENST00000489424	TUBB6	Q9BUF5	446 aa		16.36	■□□□□ 0.21
HDAC10-216	ENST00000489424	CAPS2	Q9BXY5	557 aa		16.36	■□□□□ 0.21
HDAC10-216	ENST00000489424	PITHD1	Q9GZP4	211 aa	Predicted RBP	16.36	■□□□□ 0.21
HDAC10-216	ENST00000489424	RNF32	Q9H0A6	362 aa		16.36	■□□□□ 0.21
HDAC10-216	ENST00000489424	ILKAP	Q9H0C8	392 aa	Predicted RBP	16.36	■□□□□ 0.21
HDAC10-216	ENST00000489424	PELI2	Q9HAT8	420 aa		16.36	■□□□□ 0.21
HDAC10-216	ENST00000489424	ANKH	Q9HCJ1	492 aa		16.36	■□□□□ 0.21
HDAC10-216	ENST00000489424	DYRK1B	Q9Y463	629 aa		16.36	■□□□□ 0.21
HDAC10-216	ENST00000489424	MDC1	Q14676	2089 aa	Known RBP	16.36	■□□□□ 0.21
HDAC10-216	ENST00000489424	SPEN	Q96T58	3664 aa	Known RBP	16.35	■□□□□ 0.21
HDAC10-216	ENST00000489424		A0A0A6YYC8	382 aa	Predicted RBP	16.35	■□□□□ 0.21
HDAC10-216	ENST00000489424	HMX2	A2RU54	273 aa		16.35	■□□□□ 0.21
HDAC10-216	ENST00000489424	URAD	A6NGE7	173 aa		16.35	■□□□□ 0.21
HDAC10-216	ENST00000489424		I3L1I5	382 aa	Predicted RBP	16.35	■□□□□ 0.21
HDAC10-216	ENST00000489424	P2RX6	O15547	441 aa		16.35	■□□□□ 0.21
HDAC10-216	ENST00000489424	ALDOA	P04075	364 aa	Known RBP	16.35	■□□□□ 0.21
HDAC10-216	ENST00000489424	GSTM2	P28161	218 aa		16.35	■□□□□ 0.21
HDAC10-216	ENST00000489424	AGTR2	P50052	363 aa		16.35	■□□□□ 0.21
HDAC10-216	ENST00000489424	FOXL2	P58012	376 aa		16.35	■□□□□ 0.21
HDAC10-216	ENST00000489424	RAPSN	Q13702	412 aa		16.35	■□□□□ 0.21
HDAC10-216	ENST00000489424	TLR1	Q15399	786 aa		16.35	■□□□□ 0.21
HDAC10-216	ENST00000489424	ZXDC	Q2QGD7	858 aa	Predicted RBP	16.35	■□□□□ 0.21
HDAC10-216	ENST00000489424	FHL5	Q5TD97	284 aa		16.35	■□□□□ 0.21
HDAC10-216	ENST00000489424	MBOAT1	Q6ZNC8	495 aa		16.35	■□□□□ 0.21
HDAC10-216	ENST00000489424	TIFAB	Q6ZNK6	161 aa		16.35	■□□□□ 0.21

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