RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486978.5

CTDSPL-208, Transcript of CTD small phosphatase like, humanhuman

TSL 3

Gene CTDSPL, Length 609 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL-208ENST00000486978 FAR1Q8WVX9 515 aa6.1□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP6.1□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 ARSGQ96EG1 525 aa6.1□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 MVB12AQ96EY5 273 aa6.1□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa6.1□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 OR2A5Q96R48 311 aa6.1□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 OLFM1Q99784 485 aa6.1□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 HIST1H2AJQ99878 128 aa6.1□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 SLX1AQ9BQ83 275 aa6.1□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 H2AFJQ9BTM1 129 aa6.1□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 SGPP1Q9BX95 441 aa6.1□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 TRIM54Q9BYV2 358 aa6.1□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 LIME1Q9H400 295 aa6.1□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 SYNPO2LQ9H987 977 aa6.1□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 TMEM184CQ9NVA4 438 aa6.1□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 P4HTMQ9NXG6 502 aa6.1□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 ARL15Q9NXU5 204 aa6.1□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 GRHL1Q9NZI5 618 aa6.1□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 C5AR2Q9P296 337 aa6.1□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 CTSFQ9UBX1 484 aa6.1□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP6.1□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 ADAM21Q9UKJ8 722 aa6.1□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 CDC14AQ9UNH5 594 aa6.1□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 PSAT1Q9Y617 370 aa6.1□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 MAU2Q9Y6X3 613 aa6.1□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa6.09□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa6.09□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 H7BY64 318 aa6.09□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 SOCS6O14544 535 aa6.09□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 P2RX6O15547 441 aa6.09□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 KLHL41O60662 606 aa6.09□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 ZGLP1P0C6A0 271 aa6.09□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 SAT1P21673 171 aa6.09□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 TDGF1P3P51864 188 aa6.09□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 PGGT1BP53609 377 aa6.09□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 SOX8P57073 446 aa6.09□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 CSNK1G2P78368 415 aa6.09□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 CAV1Q03135 178 aa6.09□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 OCA2Q04671 838 aa6.09□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 FAM53BQ14153 422 aa6.09□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 MYBPC3Q14896 1274 aa6.09□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 RBBP7Q16576 425 aa6.09□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 NDUFA9Q16795 377 aa6.09□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 HKDC1Q2TB90 917 aa6.09□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 TUBB8Q3ZCM7 444 aa6.09□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa6.09□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 TMEM207Q6UWW9 146 aa6.09□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 CAPN12Q6ZSI9 719 aa6.09□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa6.09□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 TAOK1Q7L7X3 1001 aa6.09□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 PLD3Q8IV08 490 aa6.09□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 GALNT16Q8N428 558 aa6.09□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa6.09□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 ACBD4Q8NC06 268 aa6.09□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 STT3BQ8TCJ2 826 aa6.09□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 ATL1Q8WXF7 558 aa6.09□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 ANKRD7Q92527 254 aa6.09□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 CDKL2Q92772 493 aa6.09□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 MIEF2Q96C03 454 aa6.09□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 FBXL8Q96CD0 374 aa6.09□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 THAP11Q96EK4 314 aa6.09□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 VPS39Q96JC1 886 aa6.09□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 VPS50Q96JG6 964 aa6.09□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 PRAP1Q96NZ9 151 aa6.09□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 HAUS8Q9BT25 410 aa6.09□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 MCMBPQ9BTE3 642 aa6.09□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 CRB3Q9BUF7 120 aa6.09□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 PHACTR1Q9C0D0 580 aa6.09□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 DRC3Q9H069 523 aa6.09□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 RAB17Q9H0T7 212 aa6.09□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 ATG10Q9H0Y0 220 aa6.09□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 RHOJQ9H4E5 214 aa6.09□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 SAYSD1Q9NPB0 183 aa6.09□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa6.09□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa6.09□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 C14orf105Q9NVL8 296 aa6.09□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 CDC23Q9UJX2 597 aa6.09□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 FBXL4Q9UKA2 621 aa6.09□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa6.09□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa6.09□□□□□ -1.43
CTDSPL-208ENST00000486978 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa6.08□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 FEZF1A0PJY2 475 aa6.08□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa6.08□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
CTDSPL-208ENST00000486978 I3L1I5 382 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53 ms