RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483873.6

GTF3C4-202, Transcript of general transcription factor IIIC subunit 4, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene GTF3C4, Length 1,417 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C4-202ENST00000483873 CD63P08962 238 aa25.14■■□□□ 1.62
GTF3C4-202ENST00000483873 PYGBP11216 843 aa25.14■■□□□ 1.62
GTF3C4-202ENST00000483873 CXCR2P25025 360 aa25.14■■□□□ 1.62
GTF3C4-202ENST00000483873 CHIT1Q13231 466 aa25.14■■□□□ 1.62
GTF3C4-202ENST00000483873 PWP1Q13610 501 aa25.14■■□□□ 1.62
GTF3C4-202ENST00000483873 VWA2Q5GFL6 755 aa25.14■■□□□ 1.62
GTF3C4-202ENST00000483873 ADNP2Q6IQ32 1131 aa25.14■■□□□ 1.62
GTF3C4-202ENST00000483873 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa25.14■■□□□ 1.62
GTF3C4-202ENST00000483873 PDSS2Q86YH6 399 aa25.14■■□□□ 1.62
GTF3C4-202ENST00000483873 PRSS58Q8IYP2 241 aa25.14■■□□□ 1.62
GTF3C4-202ENST00000483873 IQCKQ8N0W5 287 aa25.14■■□□□ 1.62
GTF3C4-202ENST00000483873 STT3BQ8TCJ2 826 aa25.14■■□□□ 1.62
GTF3C4-202ENST00000483873 CREB3L4Q8TEY5 395 aa25.14■■□□□ 1.62
GTF3C4-202ENST00000483873 PHF21BQ96EK2 531 aa25.14■■□□□ 1.62
GTF3C4-202ENST00000483873 WDR34Q96EX3 536 aa25.14■■□□□ 1.62
GTF3C4-202ENST00000483873 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
GTF3C4-202ENST00000483873 YIPF2Q9BWQ6 316 aa25.14■■□□□ 1.62
GTF3C4-202ENST00000483873 AICDAQ9GZX7 198 aa25.14■■□□□ 1.62
GTF3C4-202ENST00000483873 EHD1Q9H4M9 534 aa25.14■■□□□ 1.62
GTF3C4-202ENST00000483873 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
GTF3C4-202ENST00000483873 TMEM216Q9P0N5 145 aa25.14■■□□□ 1.62
GTF3C4-202ENST00000483873 TRPC4Q9UBN4 977 aa25.14■■□□□ 1.62
GTF3C4-202ENST00000483873 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
GTF3C4-202ENST00000483873 SGK494L7N484 410 aa25.13■■□□□ 1.61
GTF3C4-202ENST00000483873 NSA2O95478 260 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
GTF3C4-202ENST00000483873 B3GALT4O96024 378 aa25.13■■□□□ 1.61
GTF3C4-202ENST00000483873 CCR10P46092 362 aa25.13■■□□□ 1.61
GTF3C4-202ENST00000483873 AVPR1BP47901 424 aa25.13■■□□□ 1.61
GTF3C4-202ENST00000483873 IRF8Q02556 426 aa25.13■■□□□ 1.61
GTF3C4-202ENST00000483873 RGS1Q08116 209 aa25.13■■□□□ 1.61
GTF3C4-202ENST00000483873 HYAL2Q12891 473 aa25.13■■□□□ 1.61
GTF3C4-202ENST00000483873 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP25.13■■□□□ 1.61
GTF3C4-202ENST00000483873 CPZQ66K79 652 aa25.13■■□□□ 1.61
GTF3C4-202ENST00000483873 KRT78Q8N1N4 520 aa25.13■■□□□ 1.61
GTF3C4-202ENST00000483873 TMEM151AQ8N4L1 468 aa25.13■■□□□ 1.61
GTF3C4-202ENST00000483873 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
GTF3C4-202ENST00000483873 THAP4Q8WY91 577 aa25.13■■□□□ 1.61
GTF3C4-202ENST00000483873 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
GTF3C4-202ENST00000483873 ZIM3Q96PE6 472 aa25.13■■□□□ 1.61
GTF3C4-202ENST00000483873 SEMA4CQ9C0C4 833 aa25.13■■□□□ 1.61
GTF3C4-202ENST00000483873 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
GTF3C4-202ENST00000483873 COPG2Q9UBF2 871 aa25.13■■□□□ 1.61
GTF3C4-202ENST00000483873 SCN2AQ99250 2005 aa25.13■■□□□ 1.61
GTF3C4-202ENST00000483873 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa25.12■■□□□ 1.61
GTF3C4-202ENST00000483873 ZGLP1P0C6A0 271 aa25.12■■□□□ 1.61
GTF3C4-202ENST00000483873 EPB42P16452 691 aa25.12■■□□□ 1.61
GTF3C4-202ENST00000483873 HNF4AP41235 474 aa25.12■■□□□ 1.61
GTF3C4-202ENST00000483873 POLE2P56282 527 aa25.12■■□□□ 1.61
GTF3C4-202ENST00000483873 CHAF1BQ13112 559 aa25.12■■□□□ 1.61
GTF3C4-202ENST00000483873 ATP1A4Q13733 1029 aa25.12■■□□□ 1.61
GTF3C4-202ENST00000483873 SSPNQ14714 243 aa25.12■■□□□ 1.61
GTF3C4-202ENST00000483873 RASA2Q15283 850 aa25.12■■□□□ 1.61
GTF3C4-202ENST00000483873 RAB43Q86YS6 212 aa25.12■■□□□ 1.61
GTF3C4-202ENST00000483873 TRPV3Q8NET8 790 aa25.12■■□□□ 1.61
GTF3C4-202ENST00000483873 ACMSDQ8TDX5 336 aa25.12■■□□□ 1.61
GTF3C4-202ENST00000483873 SLC6A16Q9GZN6 736 aa25.12■■□□□ 1.61
GTF3C4-202ENST00000483873 KLHL31Q9H511 634 aa25.12■■□□□ 1.61
GTF3C4-202ENST00000483873 ANKHQ9HCJ1 492 aa25.12■■□□□ 1.61
GTF3C4-202ENST00000483873 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
GTF3C4-202ENST00000483873 SLC22A7Q9Y694 548 aa25.12■■□□□ 1.61
GTF3C4-202ENST00000483873 TLDC2A0PJX2 215 aa25.12■■□□□ 1.61
GTF3C4-202ENST00000483873 ZNF860A6NHJ4 632 aa25.12■■□□□ 1.61
GTF3C4-202ENST00000483873 ARGFXA6NJG6 315 aa25.12■■□□□ 1.61
GTF3C4-202ENST00000483873 C4orf51C9J302 202 aa25.12■■□□□ 1.61
GTF3C4-202ENST00000483873 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP25.12■■□□□ 1.613e-9■■■■■ 30.9
GTF3C4-202ENST00000483873 CDH16O75309 829 aa25.12■■□□□ 1.61
GTF3C4-202ENST00000483873 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
GTF3C4-202ENST00000483873 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
GTF3C4-202ENST00000483873 OCA2Q04671 838 aa25.12■■□□□ 1.61
GTF3C4-202ENST00000483873 KLC1Q07866 573 aa25.12■■□□□ 1.61
GTF3C4-202ENST00000483873 ZNF844Q08AG5 666 aa25.12■■□□□ 1.61
GTF3C4-202ENST00000483873 E2F2Q14209 437 aa25.12■■□□□ 1.61
GTF3C4-202ENST00000483873 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa25.12■■□□□ 1.61
GTF3C4-202ENST00000483873 VN1R5Q7Z5H4 357 aa25.12■■□□□ 1.61
GTF3C4-202ENST00000483873 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa25.12■■□□□ 1.61
GTF3C4-202ENST00000483873 MRGPREQ86SM8 312 aa25.12■■□□□ 1.61
GTF3C4-202ENST00000483873 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa25.12■■□□□ 1.61
GTF3C4-202ENST00000483873 SLC39A7Q92504 469 aa25.12■■□□□ 1.61
GTF3C4-202ENST00000483873 MIEF2Q96C03 454 aa25.12■■□□□ 1.61
GTF3C4-202ENST00000483873 WBP1Q96G27 269 aa25.12■■□□□ 1.61
GTF3C4-202ENST00000483873 EFCAB11Q9BUY7 163 aa25.12■■□□□ 1.61
GTF3C4-202ENST00000483873 TRIM55Q9BYV6 548 aa25.12■■□□□ 1.61
GTF3C4-202ENST00000483873 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
GTF3C4-202ENST00000483873 NT5DC2Q9H857 520 aa25.12■■□□□ 1.61
GTF3C4-202ENST00000483873 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
GTF3C4-202ENST00000483873 HCN3Q9P1Z3 774 aa25.12■■□□□ 1.61
GTF3C4-202ENST00000483873 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
GTF3C4-202ENST00000483873 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa25.12■■□□□ 1.61
GTF3C4-202ENST00000483873 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa25.12■■□□□ 1.61
GTF3C4-202ENST00000483873 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa25.12■■□□□ 1.61
GTF3C4-202ENST00000483873 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa25.11■■□□□ 1.61
GTF3C4-202ENST00000483873 H0YIG0 161 aa25.11■■□□□ 1.61
GTF3C4-202ENST00000483873 E2F3O00716 465 aa25.11■■□□□ 1.61
GTF3C4-202ENST00000483873 SMIM24O75264 130 aa25.11■■□□□ 1.61
GTF3C4-202ENST00000483873 RDH16O75452 317 aa25.11■■□□□ 1.61
GTF3C4-202ENST00000483873 DNAJB5O75953 348 aa25.11■■□□□ 1.61
GTF3C4-202ENST00000483873 WFS1O76024 890 aa25.11■■□□□ 1.61
GTF3C4-202ENST00000483873 KLHL18O94889 574 aa25.11■■□□□ 1.61
GTF3C4-202ENST00000483873 TBCCQ15814 346 aa25.11■■□□□ 1.61
GTF3C4-202ENST00000483873 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.6 ms