RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477563.6

RBBP4-211, Transcript of RB binding protein 4, chromatin remodeling factor, humanhuman

TSL 5

Gene RBBP4, Length 544 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4-211ENST00000477563 GSTA2P09210 222 aa7.23□□□□□ -1.25
RBBP4-211ENST00000477563 FBLP22087 321 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
RBBP4-211ENST00000477563 CASQ1P31415 396 aa7.23□□□□□ -1.25
RBBP4-211ENST00000477563 SLC1A2P43004 574 aa7.23□□□□□ -1.25
RBBP4-211ENST00000477563 EFNA3P52797 238 aa7.23□□□□□ -1.25
RBBP4-211ENST00000477563 CSNK1G2P78368 415 aa7.23□□□□□ -1.25
RBBP4-211ENST00000477563 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
RBBP4-211ENST00000477563 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
RBBP4-211ENST00000477563 ZNF766Q5HY98 468 aa7.23□□□□□ -1.25
RBBP4-211ENST00000477563 ABHD17BQ5VST6 288 aa7.23□□□□□ -1.25
RBBP4-211ENST00000477563 PLAG1Q6DJT9 500 aa7.23□□□□□ -1.25
RBBP4-211ENST00000477563 FAAH2Q6GMR7 532 aa7.23□□□□□ -1.25
RBBP4-211ENST00000477563 CES3Q6UWW8 571 aa7.23□□□□□ -1.25
RBBP4-211ENST00000477563 NAPRTQ6XQN6 538 aa7.23□□□□□ -1.25
RBBP4-211ENST00000477563 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
RBBP4-211ENST00000477563 SLC26A11Q86WA9 606 aa7.23□□□□□ -1.25
RBBP4-211ENST00000477563 SIAH3Q8IW03 269 aa7.23□□□□□ -1.25
RBBP4-211ENST00000477563 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
RBBP4-211ENST00000477563 OR4N4Q8N0Y3 316 aa7.23□□□□□ -1.25
RBBP4-211ENST00000477563 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
RBBP4-211ENST00000477563 AMER3Q8N944 861 aa7.23□□□□□ -1.25
RBBP4-211ENST00000477563 ANKRD7Q92527 254 aa7.23□□□□□ -1.25
RBBP4-211ENST00000477563 MAGED4Q96JG8 741 aa7.23□□□□□ -1.25
RBBP4-211ENST00000477563 CAPZA3Q96KX2 299 aa7.23□□□□□ -1.25
RBBP4-211ENST00000477563 IL17FQ96PD4 163 aa7.23□□□□□ -1.25
RBBP4-211ENST00000477563 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa7.23□□□□□ -1.25
RBBP4-211ENST00000477563 VKORC1Q9BQB6 163 aa7.23□□□□□ -1.25
RBBP4-211ENST00000477563 ERP44Q9BS26 406 aa7.23□□□□□ -1.25
RBBP4-211ENST00000477563 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
RBBP4-211ENST00000477563 RAB17Q9H0T7 212 aa7.23□□□□□ -1.25
RBBP4-211ENST00000477563 CXXC4Q9H2H0 198 aa7.23□□□□□ -1.25
RBBP4-211ENST00000477563 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
RBBP4-211ENST00000477563 TAS2R13Q9NYV9 303 aa7.23□□□□□ -1.25
RBBP4-211ENST00000477563 MED16Q9Y2X0 877 aa7.23□□□□□ -1.25
RBBP4-211ENST00000477563 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa7.23□□□□□ -1.25
RBBP4-211ENST00000477563 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
RBBP4-211ENST00000477563 SPG11Q96JI7 2443 aa7.22□□□□□ -1.25
RBBP4-211ENST00000477563 ABCA2Q9BZC7 2435 aa7.22□□□□□ -1.25
RBBP4-211ENST00000477563 H0YGG7 62 aa7.22□□□□□ -1.25
RBBP4-211ENST00000477563 SLC16A5O15375 505 aa7.22□□□□□ -1.25
RBBP4-211ENST00000477563 TTI1O43156 1089 aa7.22□□□□□ -1.25
RBBP4-211ENST00000477563 FOXS1O43638 330 aa7.22□□□□□ -1.25
RBBP4-211ENST00000477563 NIPSNAP2O75323 286 aa7.22□□□□□ -1.25
RBBP4-211ENST00000477563 VPS26AO75436 327 aa7.22□□□□□ -1.25
RBBP4-211ENST00000477563 FAM155BO75949 473 aa7.22□□□□□ -1.25
RBBP4-211ENST00000477563 CCNDBP1O95273 360 aa7.22□□□□□ -1.25
RBBP4-211ENST00000477563 F10P00742 488 aa7.22□□□□□ -1.25
RBBP4-211ENST00000477563 C8GP07360 202 aa7.22□□□□□ -1.25
RBBP4-211ENST00000477563 HEXBP07686 556 aa7.22□□□□□ -1.25
RBBP4-211ENST00000477563 CHRM3P20309 590 aa7.22□□□□□ -1.25
RBBP4-211ENST00000477563 HRH2P25021 359 aa7.22□□□□□ -1.25
RBBP4-211ENST00000477563 FMO4P31512 558 aa7.22□□□□□ -1.25
RBBP4-211ENST00000477563 RGS4P49798 205 aa7.22□□□□□ -1.25
RBBP4-211ENST00000477563 ITGA8P53708 1063 aa7.22□□□□□ -1.25
RBBP4-211ENST00000477563 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
RBBP4-211ENST00000477563 PMP22Q01453 160 aa7.22□□□□□ -1.25
RBBP4-211ENST00000477563 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
RBBP4-211ENST00000477563 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
RBBP4-211ENST00000477563 CALCOCO2Q13137 446 aa7.22□□□□□ -1.25
RBBP4-211ENST00000477563 TUBA3CQ13748 450 aa7.22□□□□□ -1.25
RBBP4-211ENST00000477563 FAM53BQ14153 422 aa7.22□□□□□ -1.25
RBBP4-211ENST00000477563 ACER2Q5QJU3 275 aa7.22□□□□□ -1.25
RBBP4-211ENST00000477563 ZNF549Q6P9A3 640 aa7.22□□□□□ -1.25
RBBP4-211ENST00000477563 TUBA3EQ6PEY2 450 aa7.22□□□□□ -1.25
RBBP4-211ENST00000477563 DOLPP1Q86YN1 238 aa7.22□□□□□ -1.25
RBBP4-211ENST00000477563 KLHL7Q8IXQ5 586 aa7.22□□□□□ -1.25
RBBP4-211ENST00000477563 PRSS58Q8IYP2 241 aa7.22□□□□□ -1.25
RBBP4-211ENST00000477563 CCDC116Q8IYX3 515 aa7.22□□□□□ -1.25
RBBP4-211ENST00000477563 KRT222Q8N1A0 295 aa7.22□□□□□ -1.25
RBBP4-211ENST00000477563 MEIOBQ8N635 442 aa7.22□□□□□ -1.25
RBBP4-211ENST00000477563 OR9A1PQ8NGU1 263 aa7.22□□□□□ -1.25
RBBP4-211ENST00000477563 CD200R1Q8TD46 325 aa7.22□□□□□ -1.25
RBBP4-211ENST00000477563 ASB11Q8WXH4 323 aa7.22□□□□□ -1.25
RBBP4-211ENST00000477563 ZNF354BQ96LW1 612 aa7.22□□□□□ -1.25
RBBP4-211ENST00000477563 FRMD6Q96NE9 622 aa7.22□□□□□ -1.25
RBBP4-211ENST00000477563 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa7.22□□□□□ -1.25
RBBP4-211ENST00000477563 TRIM51Q9BSJ1 452 aa7.22□□□□□ -1.25
RBBP4-211ENST00000477563 POPDC3Q9HBV1 291 aa7.22□□□□□ -1.25
RBBP4-211ENST00000477563 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
RBBP4-211ENST00000477563 TRPC4Q9UBN4 977 aa7.22□□□□□ -1.25
RBBP4-211ENST00000477563 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa7.22□□□□□ -1.25
RBBP4-211ENST00000477563 SLC39A10Q9ULF5 831 aa7.22□□□□□ -1.25
RBBP4-211ENST00000477563 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
RBBP4-211ENST00000477563 CRYL1Q9Y2S2 319 aa7.22□□□□□ -1.25
RBBP4-211ENST00000477563 ASB1Q9Y576 335 aa7.22□□□□□ -1.25
RBBP4-211ENST00000477563 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
RBBP4-211ENST00000477563 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa7.21□□□□□ -1.26
RBBP4-211ENST00000477563 A0A0J9YVX5 310 aa7.21□□□□□ -1.26
RBBP4-211ENST00000477563 POM121CA8CG34 1229 aa7.21□□□□□ -1.26
RBBP4-211ENST00000477563 FOXO6A8MYZ6 492 aa7.21□□□□□ -1.26
RBBP4-211ENST00000477563 GOLGA8KD6RF30 607 aa7.21□□□□□ -1.26
RBBP4-211ENST00000477563 H0YIG0 161 aa7.21□□□□□ -1.26
RBBP4-211ENST00000477563 GOLGA8TH3BQL2 631 aa7.21□□□□□ -1.26
RBBP4-211ENST00000477563 ASNA1O43681 348 aa7.21□□□□□ -1.26
RBBP4-211ENST00000477563 NRP2O60462 931 aa7.21□□□□□ -1.26
RBBP4-211ENST00000477563 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
RBBP4-211ENST00000477563 CCND1P24385 295 aa7.21□□□□□ -1.26
RBBP4-211ENST00000477563 PSMB5P28074 263 aa7.21□□□□□ -1.26
RBBP4-211ENST00000477563 ELK3P41970 407 aa7.21□□□□□ -1.26
RBBP4-211ENST00000477563 RPL21P46778 160 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.4 ms