RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474230.5

NFU1-209, Transcript of NFU1 iron-sulfur cluster scaffold, human

TSL 3

Gene NFU1, Length 666 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NFU1-209	ENST00000474230	NKX3-1	Q99801	234 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
NFU1-209	ENST00000474230	CHKB	Q9Y259	395 aa		4.22	□□□□□ -1.73
NFU1-209	ENST00000474230	TTLL3	Q9Y4R7	772 aa		4.22	□□□□□ -1.73
NFU1-209	ENST00000474230	RTL1	A6NKG5	1358 aa		4.22	□□□□□ -1.73
NFU1-209	ENST00000474230	USP47	Q96K76	1375 aa		4.22	□□□□□ -1.73
NFU1-209	ENST00000474230	RGPD1	P0DJD0	1748 aa		4.21	□□□□□ -1.73
NFU1-209	ENST00000474230	NRAP	Q86VF7	1730 aa		4.21	□□□□□ -1.73
NFU1-209	ENST00000474230	ABCA3	Q99758	1704 aa		4.21	□□□□□ -1.73
NFU1-209	ENST00000474230	BRWD3	Q6RI45	1802 aa		4.21	□□□□□ -1.74
NFU1-209	ENST00000474230	TDRD15	B5MCY1	1934 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
NFU1-209	ENST00000474230		A0A087WUV0	522 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
NFU1-209	ENST00000474230	TRAV24	A0A0B4J272	114 aa		4.21	□□□□□ -1.74
NFU1-209	ENST00000474230	URAD	A6NGE7	173 aa		4.21	□□□□□ -1.74
NFU1-209	ENST00000474230	MPTX1	A8MV57	137 aa		4.21	□□□□□ -1.74
NFU1-209	ENST00000474230	KPNA7	A9QM74	516 aa		4.21	□□□□□ -1.74
NFU1-209	ENST00000474230	PALM2-AKAP2	B1ALY0	433 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
NFU1-209	ENST00000474230		E9PQ18	207 aa		4.21	□□□□□ -1.74
NFU1-209	ENST00000474230	BAG3	O95817	575 aa		4.21	□□□□□ -1.74
NFU1-209	ENST00000474230	ATP1B1	P05026	303 aa		4.21	□□□□□ -1.74
NFU1-209	ENST00000474230	HSP90AB1	P08238	724 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
NFU1-209	ENST00000474230	HNF4A	P41235	474 aa		4.21	□□□□□ -1.74
NFU1-209	ENST00000474230	DNA2	P51530	1060 aa		4.21	□□□□□ -1.74
NFU1-209	ENST00000474230	UBASH3A	P57075	661 aa		4.21	□□□□□ -1.74
NFU1-209	ENST00000474230	MYL7	Q01449	175 aa		4.21	□□□□□ -1.74
NFU1-209	ENST00000474230	NECTIN1	Q15223	517 aa		4.21	□□□□□ -1.74
NFU1-209	ENST00000474230	RPUSD3	Q6P087	351 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
NFU1-209	ENST00000474230	NOA1	Q8NC60	698 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
NFU1-209	ENST00000474230	OR7A2P	Q8NGA2	310 aa		4.21	□□□□□ -1.74
NFU1-209	ENST00000474230	PROX1	Q92786	737 aa		4.21	□□□□□ -1.74
NFU1-209	ENST00000474230	ANKRD9	Q96BM1	317 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
NFU1-209	ENST00000474230	SPAG5	Q96R06	1193 aa		4.21	□□□□□ -1.74
NFU1-209	ENST00000474230	SPHK2	Q9NRA0	654 aa		4.21	□□□□□ -1.74
NFU1-209	ENST00000474230	GSN-AS1	Q9NRJ2	163 aa		4.21	□□□□□ -1.74
NFU1-209	ENST00000474230	TBC1D7	Q9P0N9	293 aa		4.21	□□□□□ -1.74
NFU1-209	ENST00000474230	BCCIP	Q9P287	314 aa	Known RBP eCLIP	4.21	□□□□□ -1.74
NFU1-209	ENST00000474230	SWAP70	Q9UH65	585 aa		4.21	□□□□□ -1.74
NFU1-209	ENST00000474230		A0A1W2PP64	1363 aa		4.21	□□□□□ -1.74
NFU1-209	ENST00000474230	INSR	P06213	1382 aa		4.21	□□□□□ -1.74
NFU1-209	ENST00000474230	MAP3K19	Q56UN5	1328 aa		4.21	□□□□□ -1.74
NFU1-209	ENST00000474230	AKAP12	Q02952	1782 aa		4.2	□□□□□ -1.74
NFU1-209	ENST00000474230	LMO7	Q8WWI1	1683 aa		4.2	□□□□□ -1.74
NFU1-209	ENST00000474230	THSD7A	Q9UPZ6	1657 aa		4.2	□□□□□ -1.74
NFU1-209	ENST00000474230	COL2A1	P02458	1487 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
NFU1-209	ENST00000474230	NSD2	O96028	1365 aa		4.2	□□□□□ -1.74
NFU1-209	ENST00000474230	FLT4	P35916	1363 aa		4.2	□□□□□ -1.74
NFU1-209	ENST00000474230		A8MXE2	369 aa		4.2	□□□□□ -1.74
NFU1-209	ENST00000474230	CCL24	O00175	119 aa		4.2	□□□□□ -1.74
NFU1-209	ENST00000474230	SOCS3	O14543	225 aa		4.2	□□□□□ -1.74
NFU1-209	ENST00000474230	GSR	P00390	522 aa		4.2	□□□□□ -1.74
NFU1-209	ENST00000474230	DNTT	P04053	509 aa		4.2	□□□□□ -1.74
NFU1-209	ENST00000474230	SP100	P23497	879 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
NFU1-209	ENST00000474230	HLA-F	P30511	346 aa		4.2	□□□□□ -1.74
NFU1-209	ENST00000474230	RASGEF1B	Q0VAM2	473 aa		4.2	□□□□□ -1.74
NFU1-209	ENST00000474230	MTF1	Q14872	753 aa		4.2	□□□□□ -1.74
NFU1-209	ENST00000474230	RASA2	Q15283	850 aa		4.2	□□□□□ -1.74
NFU1-209	ENST00000474230	SLC15A2	Q16348	729 aa		4.2	□□□□□ -1.74
NFU1-209	ENST00000474230	SNAI3	Q3KNW1	292 aa		4.2	□□□□□ -1.74
NFU1-209	ENST00000474230	KRT80	Q6KB66	452 aa		4.2	□□□□□ -1.74
NFU1-209	ENST00000474230	RYBP	Q8N488	228 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
NFU1-209	ENST00000474230	OR6J1	Q8NGC5	347 aa		4.2	□□□□□ -1.74
NFU1-209	ENST00000474230	KCNE4	Q8WWG9	221 aa		4.2	□□□□□ -1.74
NFU1-209	ENST00000474230	PIK3R3	Q92569	461 aa		4.2	□□□□□ -1.74
NFU1-209	ENST00000474230	PYGO2	Q9BRQ0	406 aa		4.2	□□□□□ -1.74
NFU1-209	ENST00000474230	UBXN6	Q9BZV1	441 aa		4.2	□□□□□ -1.74
NFU1-209	ENST00000474230	ANKRD2	Q9GZV1	360 aa		4.2	□□□□□ -1.74
NFU1-209	ENST00000474230	UPF3A	Q9H1J1	476 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
NFU1-209	ENST00000474230	STAU2	Q9NUL3	570 aa	Known RBP eCLIP	4.2	□□□□□ -1.74
NFU1-209	ENST00000474230	KNSTRN	Q9Y448	316 aa		4.2	□□□□□ -1.74
NFU1-209	ENST00000474230	ARID2	Q68CP9	1835 aa		4.2	□□□□□ -1.74
NFU1-209	ENST00000474230	CRYBG1	Q9Y4K1	1723 aa		4.2	□□□□□ -1.74
NFU1-209	ENST00000474230	PHRF1	Q9P1Y6	1649 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
NFU1-209	ENST00000474230	PCDH11X	Q9BZA7	1347 aa		4.2	□□□□□ -1.74
NFU1-209	ENST00000474230	NRK	Q7Z2Y5	1582 aa		4.19	□□□□□ -1.74
NFU1-209	ENST00000474230	PARP4	Q9UKK3	1724 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
NFU1-209	ENST00000474230	EPM2A	B3EWF7	344 aa		4.19	□□□□□ -1.74
NFU1-209	ENST00000474230	PI15	O43692	258 aa		4.19	□□□□□ -1.74
NFU1-209	ENST00000474230	SNX3	O60493	162 aa		4.19	□□□□□ -1.74
NFU1-209	ENST00000474230	EIF5B	O60841	1220 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
NFU1-209	ENST00000474230	GGPS1	O95749	300 aa		4.19	□□□□□ -1.74
NFU1-209	ENST00000474230	RPL35A	P18077	110 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
NFU1-209	ENST00000474230	XG	P55808	180 aa		4.19	□□□□□ -1.74
NFU1-209	ENST00000474230	DLK1	P80370	383 aa		4.19	□□□□□ -1.74
NFU1-209	ENST00000474230	CALCOCO2	Q13137	446 aa		4.19	□□□□□ -1.74
NFU1-209	ENST00000474230	NFATC2	Q13469	925 aa		4.19	□□□□□ -1.74
NFU1-209	ENST00000474230	TRIM29	Q14134	588 aa		4.19	□□□□□ -1.74
NFU1-209	ENST00000474230	GLIPR1L2	Q4G1C9	344 aa		4.19	□□□□□ -1.74
NFU1-209	ENST00000474230	KIF6	Q6ZMV9	814 aa		4.19	□□□□□ -1.74
NFU1-209	ENST00000474230	ANKRD13C	Q8N6S4	541 aa		4.19	□□□□□ -1.74
NFU1-209	ENST00000474230	GTF3A	Q92664	365 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
NFU1-209	ENST00000474230	FAM218A	Q96MZ4	157 aa		4.19	□□□□□ -1.74
NFU1-209	ENST00000474230	FZD8	Q9H461	694 aa		4.19	□□□□□ -1.74
NFU1-209	ENST00000474230	MED20	Q9H944	212 aa		4.19	□□□□□ -1.74
NFU1-209	ENST00000474230	TXNDC16	Q9P2K2	825 aa		4.19	□□□□□ -1.74
NFU1-209	ENST00000474230	CSNK1G3	Q9Y6M4	447 aa		4.19	□□□□□ -1.74
NFU1-209	ENST00000474230	COL18A1	P39060	1754 aa		4.19	□□□□□ -1.74
NFU1-209	ENST00000474230	TNS2	Q63HR2	1409 aa		4.19	□□□□□ -1.74
NFU1-209	ENST00000474230	CD163L1	Q9NR16	1453 aa		4.18	□□□□□ -1.74
NFU1-209	ENST00000474230	NFAT5	O94916	1531 aa		4.18	□□□□□ -1.74
NFU1-209	ENST00000474230	TBX10	O75333	385 aa		4.18	□□□□□ -1.74
NFU1-209	ENST00000474230	RPS6KA5	O75582	802 aa		4.18	□□□□□ -1.74

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