RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460308.6

ABCD4-202, Transcript of ATP binding cassette subfamily D member 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ABCD4, Length 1,003 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD4-202ENST00000460308 VSTM2BA6NLU5 285 aa20.33■□□□□ 0.85
ABCD4-202ENST00000460308 KLK8O60259 260 aa20.33■□□□□ 0.85
ABCD4-202ENST00000460308 IGHEP01854 428 aa20.33■□□□□ 0.85
ABCD4-202ENST00000460308 ZGLP1P0C6A0 271 aa20.33■□□□□ 0.85
ABCD4-202ENST00000460308 IL1RNP18510 177 aa20.33■□□□□ 0.85
ABCD4-202ENST00000460308 GSTM2P28161 218 aa20.33■□□□□ 0.85
ABCD4-202ENST00000460308 FOXL2P58012 376 aa20.33■□□□□ 0.85
ABCD4-202ENST00000460308 SKP1P63208 163 aa20.33■□□□□ 0.85
ABCD4-202ENST00000460308 ABHD13Q7L211 337 aa20.33■□□□□ 0.85
ABCD4-202ENST00000460308 PRSS58Q8IYP2 241 aa20.33■□□□□ 0.85
ABCD4-202ENST00000460308 EXD3Q8N9H8 876 aa20.33■□□□□ 0.85
ABCD4-202ENST00000460308 SPSB2Q99619 263 aa20.33■□□□□ 0.85
ABCD4-202ENST00000460308 ADNPQ9H2P0 1102 aa20.33■□□□□ 0.85
ABCD4-202ENST00000460308 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
ABCD4-202ENST00000460308 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
ABCD4-202ENST00000460308 LOC400499M0QZD8 3231 aa20.33■□□□□ 0.84
ABCD4-202ENST00000460308 GOLGA8RI6L899 631 aa20.32■□□□□ 0.84
ABCD4-202ENST00000460308 UMODP07911 640 aa20.32■□□□□ 0.84
ABCD4-202ENST00000460308 SERPINA6P08185 405 aa20.32■□□□□ 0.84
ABCD4-202ENST00000460308 KRT15P19012 456 aa20.32■□□□□ 0.84
ABCD4-202ENST00000460308 RRADP55042 308 aa20.32■□□□□ 0.84
ABCD4-202ENST00000460308 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
ABCD4-202ENST00000460308 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP20.32■□□□□ 0.84
ABCD4-202ENST00000460308 TBCCQ15814 346 aa20.32■□□□□ 0.84
ABCD4-202ENST00000460308 VWA2Q5GFL6 755 aa20.32■□□□□ 0.84
ABCD4-202ENST00000460308 NIPAL1Q6NVV3 410 aa20.32■□□□□ 0.84
ABCD4-202ENST00000460308 LCA5Q86VQ0 697 aa20.32■□□□□ 0.84
ABCD4-202ENST00000460308 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP20.32■□□□□ 0.841e-6■□□□□ 8.7
ABCD4-202ENST00000460308 AMER3Q8N944 861 aa20.32■□□□□ 0.84
ABCD4-202ENST00000460308 NACC2Q96BF6 587 aa20.32■□□□□ 0.84
ABCD4-202ENST00000460308 PHF21BQ96EK2 531 aa20.32■□□□□ 0.84
ABCD4-202ENST00000460308 CRB3Q9BUF7 120 aa20.32■□□□□ 0.84
ABCD4-202ENST00000460308 PARD6BQ9BYG5 372 aa20.32■□□□□ 0.84
ABCD4-202ENST00000460308 ING2Q9H160 280 aa20.32■□□□□ 0.84
ABCD4-202ENST00000460308 ACSS2Q9NR19 701 aa20.32■□□□□ 0.84
ABCD4-202ENST00000460308 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa20.31■□□□□ 0.84
ABCD4-202ENST00000460308 SGK494L7N484 410 aa20.31■□□□□ 0.84
ABCD4-202ENST00000460308 FFAR3O14843 346 aa20.31■□□□□ 0.84
ABCD4-202ENST00000460308 GPR42O15529 346 aa20.31■□□□□ 0.84
ABCD4-202ENST00000460308 KLHL18O94889 574 aa20.31■□□□□ 0.84
ABCD4-202ENST00000460308 ALOX12P18054 663 aa20.31■□□□□ 0.84
ABCD4-202ENST00000460308 MMP11P24347 488 aa20.31■□□□□ 0.84
ABCD4-202ENST00000460308 HNF4AP41235 474 aa20.31■□□□□ 0.84
ABCD4-202ENST00000460308 PIK3CGP48736 1102 aa20.31■□□□□ 0.84
ABCD4-202ENST00000460308 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
ABCD4-202ENST00000460308 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
ABCD4-202ENST00000460308 KLC1Q07866 573 aa20.31■□□□□ 0.84
ABCD4-202ENST00000460308 IFFO1Q0D2I5 559 aa20.31■□□□□ 0.84
ABCD4-202ENST00000460308 KCNAB2Q13303 367 aa20.31■□□□□ 0.84
ABCD4-202ENST00000460308 ATP1A4Q13733 1029 aa20.31■□□□□ 0.84
ABCD4-202ENST00000460308 RBBP7Q16576 425 aa20.31■□□□□ 0.84
ABCD4-202ENST00000460308 SYT16Q17RD7 645 aa20.31■□□□□ 0.84
ABCD4-202ENST00000460308 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
ABCD4-202ENST00000460308 MED25Q71SY5 747 aa20.31■□□□□ 0.84
ABCD4-202ENST00000460308 PRSS41Q7RTY9 318 aa20.31■□□□□ 0.84
ABCD4-202ENST00000460308 MRGPREQ86SM8 312 aa20.31■□□□□ 0.84
ABCD4-202ENST00000460308 TDRPQ86YL5 185 aa20.31■□□□□ 0.84
ABCD4-202ENST00000460308 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
ABCD4-202ENST00000460308 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
ABCD4-202ENST00000460308 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
ABCD4-202ENST00000460308 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
ABCD4-202ENST00000460308 UBE2E3Q969T4 207 aa20.31■□□□□ 0.84
ABCD4-202ENST00000460308 WDR34Q96EX3 536 aa20.31■□□□□ 0.84
ABCD4-202ENST00000460308 SEC16BQ96JE7 1060 aa20.31■□□□□ 0.84
ABCD4-202ENST00000460308 VPS50Q96JG6 964 aa20.31■□□□□ 0.84
ABCD4-202ENST00000460308 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa20.31■□□□□ 0.84
ABCD4-202ENST00000460308 SEMA3GQ9NS98 782 aa20.31■□□□□ 0.84
ABCD4-202ENST00000460308 C14orf105Q9NVL8 296 aa20.31■□□□□ 0.84
ABCD4-202ENST00000460308 C3orf18Q9UK00 162 aa20.31■□□□□ 0.84
ABCD4-202ENST00000460308 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa20.31■□□□□ 0.84
ABCD4-202ENST00000460308 IGSF10Q6WRI0 2623 aa20.31■□□□□ 0.84
ABCD4-202ENST00000460308 TLDC2A0PJX2 215 aa20.3■□□□□ 0.84
ABCD4-202ENST00000460308 MKRN2OSH3BPM6 223 aa20.3■□□□□ 0.84
ABCD4-202ENST00000460308 PRAMEF4O60810 478 aa20.3■□□□□ 0.84
ABCD4-202ENST00000460308 CDH16O75309 829 aa20.3■□□□□ 0.84
ABCD4-202ENST00000460308 TUBBP07437 444 aa20.3■□□□□ 0.84
ABCD4-202ENST00000460308 GSTA1P08263 222 aa20.3■□□□□ 0.84
ABCD4-202ENST00000460308 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
ABCD4-202ENST00000460308 PYGBP11216 843 aa20.3■□□□□ 0.84
ABCD4-202ENST00000460308 EPORP19235 508 aa20.3■□□□□ 0.84
ABCD4-202ENST00000460308 TAC1P20366 129 aa20.3■□□□□ 0.84
ABCD4-202ENST00000460308 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
ABCD4-202ENST00000460308 HPDP32754 393 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
ABCD4-202ENST00000460308 CASP2P42575 452 aa20.3■□□□□ 0.84
ABCD4-202ENST00000460308 GTF2H2Q13888 395 aa20.3■□□□□ 0.84
ABCD4-202ENST00000460308 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa20.3■□□□□ 0.84
ABCD4-202ENST00000460308 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa20.3■□□□□ 0.84
ABCD4-202ENST00000460308 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa20.3■□□□□ 0.84
ABCD4-202ENST00000460308 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
ABCD4-202ENST00000460308 OR51Q1Q8NH59 317 aa20.3■□□□□ 0.84
ABCD4-202ENST00000460308 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
ABCD4-202ENST00000460308 CREB3L4Q8TEY5 395 aa20.3■□□□□ 0.84
ABCD4-202ENST00000460308 ATP6V1E2Q96A05 226 aa20.3■□□□□ 0.84
ABCD4-202ENST00000460308 TGIF2Q9GZN2 237 aa20.3■□□□□ 0.84
ABCD4-202ENST00000460308 SLC6A16Q9GZN6 736 aa20.3■□□□□ 0.84
ABCD4-202ENST00000460308 ACTR8Q9H981 624 aa20.3■□□□□ 0.84
ABCD4-202ENST00000460308 COPG2Q9UBF2 871 aa20.3■□□□□ 0.84
ABCD4-202ENST00000460308 DCDC2Q9UHG0 476 aa20.3■□□□□ 0.84
ABCD4-202ENST00000460308 TUBD1Q9UJT1 453 aa20.3■□□□□ 0.84
ABCD4-202ENST00000460308 LRRC14BA6NHZ5 514 aa20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.5 ms