RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000450873.6

RABGEF1-205, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 2,281 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-205ENST00000450873 E2F2Q14209 437 aa10.12□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 MAP7Q14244 749 aa10.12□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 FAM214AQ32MH5 1076 aa10.12□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 ZNF678Q5SXM1 525 aa10.12□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa10.12□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 PLD3Q8IV08 490 aa10.12□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 CSNK1A1LQ8N752 337 aa10.12□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 PPP4R1Q8TF05 950 aa10.12□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 L3HYPDHQ96EM0 354 aa10.12□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa10.12□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 IPPKQ9H8X2 491 aa10.12□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 COPG2Q9UBF2 871 aa10.12□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 SRPK3Q9UPE1 567 aa10.12□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 AHCYL1O43865 530 aa10.11□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 UGDHO60701 494 aa10.11□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 WFS1O76024 890 aa10.11□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 TIAF1O95411 115 aa10.11□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 GSTM2P28161 218 aa10.11□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 ASPHQ12797 758 aa10.11□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP10.11□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 PRTGQ2VWP7 1150 aa10.11□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 MANEAQ5SRI9 462 aa10.11□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 LIPJQ5W064 366 aa10.11□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa10.11□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 ZFAND4Q86XD8 727 aa10.11□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 CAMKVQ8NCB2 501 aa10.11□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 TTLQ8NG68 377 aa10.11□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 UBE2E3Q969T4 207 aa10.11□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 ATP6V1E2Q96A05 226 aa10.11□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 SPDL1Q96EA4 605 aa10.11□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 SEC16BQ96JE7 1060 aa10.11□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 LRFN5Q96NI6 719 aa10.11□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 FAM111AQ96PZ2 611 aa10.11□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 NDC1Q9BTX1 674 aa10.11□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 OXSMQ9NWU1 459 aa10.11□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 SLC17A7Q9P2U7 560 aa10.11□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 TM9SF1O15321 606 aa10.1□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP10.1□□□□□ -0.795e-6■□□□□ 8.1
RABGEF1-205ENST00000450873 PRAMEF4O60810 478 aa10.1□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 SUPT7LO94864 414 aa10.1□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 DLGAP3O95886 979 aa10.1□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 NTRK1P04629 796 aa10.1□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 CTSBP07858 339 aa10.1□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 ZNF28P17035 718 aa10.1□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 HNF4AP41235 474 aa10.1□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 CCNG1P51959 295 aa10.1□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 UNC50Q53HI1 259 aa10.1□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP10.1□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 GARNL3Q5VVW2 1013 aa10.1□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa10.1□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 RHBDD2Q6NTF9 364 aa10.1□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP10.1□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 CCDC81Q6ZN84 652 aa10.1□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 ASPGQ86U10 573 aa10.1□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 ESX1Q8N693 406 aa10.1□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 ZNF740Q8NDX6 193 aa10.1□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 TRPV3Q8NET8 790 aa10.1□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 CCT6BQ92526 530 aa10.1□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 TLCD1Q96CP7 247 aa10.1□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 TM4SF19Q96DZ7 209 aa10.1□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP10.1□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 TMEM237Q96Q45 408 aa10.1□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 NTMT1Q9BV86 223 aa10.1□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 SPNS1Q9H2V7 528 aa10.1□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP10.1□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 ACTR8Q9H981 624 aa10.1□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 KCNK9Q9NPC2 374 aa10.1□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 ZFP69BQ9UJL9 534 aa10.1□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 HYKKA2RU49 373 aa10.1□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 OR7A17O14581 309 aa10.1□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 ZWINTO95229 277 aa10.1□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP10.1□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 FESP07332 822 aa10.1□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 CCNYL3P0C7X3 344 aa10.1□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP10.1□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 PPP2R2AP63151 447 aa10.1□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 CLCQ05315 142 aa10.1□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 PWP1Q13610 501 aa10.1□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa10.1□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 LIPMQ5VYY2 423 aa10.1□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 GRHL2Q6ISB3 625 aa10.1□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 MED27Q6P2C8 311 aa10.1□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 VN1R4Q7Z5H5 301 aa10.1□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 NLGN4XQ8N0W4 816 aa10.1□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP10.1□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 PROKR1Q8TCW9 393 aa10.1□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 SLC13A3Q8WWT9 602 aa10.1□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP10.1□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 CLIP3Q96DZ5 547 aa10.1□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP10.1□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP10.1□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 DRC3Q9H069 523 aa10.1□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 SYNPO2LQ9H987 977 aa10.1□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 ZBTB26Q9HCK0 441 aa10.1□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP10.1□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 STARD5Q9NSY2 213 aa10.1□□□□□ -0.79
RABGEF1-205ENST00000450873 CUTCQ9NTM9 273 aa10.1□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29 ms