RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426939.6

APOL3-208, Transcript of apolipoprotein L3, human

TSL 4

Gene APOL3, Length 576 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
APOL3-208	ENST00000426939	UBTD2	Q8WUN7	234 aa		13.59	□□□□□ -0.23
APOL3-208	ENST00000426939	AIF1L	Q9BQI0	150 aa		13.59	□□□□□ -0.23
APOL3-208	ENST00000426939	YIPF2	Q9BWQ6	316 aa		13.59	□□□□□ -0.23
APOL3-208	ENST00000426939	SLC6A16	Q9GZN6	736 aa		13.59	□□□□□ -0.23
APOL3-208	ENST00000426939	EPB41L4B	Q9H329	900 aa		13.59	□□□□□ -0.23
APOL3-208	ENST00000426939	C14orf105	Q9NVL8	296 aa		13.59	□□□□□ -0.23
APOL3-208	ENST00000426939	HCN3	Q9P1Z3	774 aa		13.59	□□□□□ -0.23
APOL3-208	ENST00000426939	COPG2	Q9UBF2	871 aa		13.59	□□□□□ -0.23
APOL3-208	ENST00000426939	HEMK1	Q9Y5R4	338 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
APOL3-208	ENST00000426939	SLC22A7	Q9Y694	548 aa		13.59	□□□□□ -0.23
APOL3-208	ENST00000426939	ZNF462	Q96JM2	2506 aa		13.59	□□□□□ -0.23
APOL3-208	ENST00000426939	ZNF860	A6NHJ4	632 aa		13.58	□□□□□ -0.24
APOL3-208	ENST00000426939	IDS	B3KWA1	339 aa		13.58	□□□□□ -0.24
APOL3-208	ENST00000426939	SUPT3H	B4E1H0	165 aa		13.58	□□□□□ -0.24
APOL3-208	ENST00000426939	RIPK2	O43353	540 aa		13.58	□□□□□ -0.24
APOL3-208	ENST00000426939	DNAJB6	O75190	326 aa		13.58	□□□□□ -0.24
APOL3-208	ENST00000426939	RDH16	O75452	317 aa		13.58	□□□□□ -0.24
APOL3-208	ENST00000426939	SUPT3H	O75486	399 aa		13.58	□□□□□ -0.24
APOL3-208	ENST00000426939	STK16	O75716	305 aa		13.58	□□□□□ -0.24
APOL3-208	ENST00000426939	KLHL18	O94889	574 aa		13.58	□□□□□ -0.24
APOL3-208	ENST00000426939	KLHL2	O95198	593 aa		13.58	□□□□□ -0.24
APOL3-208	ENST00000426939	BMP10	O95393	424 aa		13.58	□□□□□ -0.24
APOL3-208	ENST00000426939	GNAZ	P19086	355 aa		13.58	□□□□□ -0.24
APOL3-208	ENST00000426939	CD22	P20273	847 aa		13.58	□□□□□ -0.24
APOL3-208	ENST00000426939	TYK2	P29597	1187 aa		13.58	□□□□□ -0.24
APOL3-208	ENST00000426939	PGD	P52209	483 aa		13.58	□□□□□ -0.24
APOL3-208	ENST00000426939	SOX8	P57073	446 aa		13.58	□□□□□ -0.24
APOL3-208	ENST00000426939	LRRC70	Q7Z2Q7	622 aa		13.58	□□□□□ -0.24
APOL3-208	ENST00000426939	VN1R5	Q7Z5H4	357 aa		13.58	□□□□□ -0.24
APOL3-208	ENST00000426939	GALNT16	Q8N428	558 aa		13.58	□□□□□ -0.24
APOL3-208	ENST00000426939	TBC1D19	Q8N5T2	526 aa		13.58	□□□□□ -0.24
APOL3-208	ENST00000426939	OR5T3	Q8NGG3	340 aa		13.58	□□□□□ -0.24
APOL3-208	ENST00000426939	RHEBL1	Q8TAI7	183 aa		13.58	□□□□□ -0.24
APOL3-208	ENST00000426939	UTP15	Q8TED0	518 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
APOL3-208	ENST00000426939	C8orf44	Q96CB5	159 aa		13.58	□□□□□ -0.24
APOL3-208	ENST00000426939	WDR34	Q96EX3	536 aa		13.58	□□□□□ -0.24
APOL3-208	ENST00000426939	CNOT10	Q9H9A5	744 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
APOL3-208	ENST00000426939	ANKH	Q9HCJ1	492 aa		13.58	□□□□□ -0.24
APOL3-208	ENST00000426939	ZNF180	Q9UJW8	692 aa		13.58	□□□□□ -0.24
APOL3-208	ENST00000426939	NAALAD2	Q9Y3Q0	740 aa		13.58	□□□□□ -0.24
APOL3-208	ENST00000426939		A0A1W2PQ72	361 aa		13.57	□□□□□ -0.24
APOL3-208	ENST00000426939	POC1B-GALNT4	F8VUJ3	575 aa		13.57	□□□□□ -0.24
APOL3-208	ENST00000426939	PYCARD-AS1	I3L0S3	204 aa		13.57	□□□□□ -0.24
APOL3-208	ENST00000426939	CCNT2	O60583	730 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
APOL3-208	ENST00000426939	GALR3	O60755	368 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
APOL3-208	ENST00000426939	TBX6	O95947	436 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
APOL3-208	ENST00000426939	S100B	P04271	92 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
APOL3-208	ENST00000426939	SERPIND1	P05546	499 aa		13.57	□□□□□ -0.24
APOL3-208	ENST00000426939	ZNF888	P0CJ79	500 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
APOL3-208	ENST00000426939	SMIM10L1	P0DMW3	83 aa		13.57	□□□□□ -0.24
APOL3-208	ENST00000426939	COX6A1	P12074	109 aa		13.57	□□□□□ -0.24
APOL3-208	ENST00000426939	MSH2	P43246	934 aa		13.57	□□□□□ -0.24
APOL3-208	ENST00000426939	SERPINB9	P50453	376 aa		13.57	□□□□□ -0.24
APOL3-208	ENST00000426939	EMP2	P54851	167 aa		13.57	□□□□□ -0.24
APOL3-208	ENST00000426939	RGS1	Q08116	209 aa		13.57	□□□□□ -0.24
APOL3-208	ENST00000426939		Q0VFX4	171 aa		13.57	□□□□□ -0.24
APOL3-208	ENST00000426939	E2F2	Q14209	437 aa		13.57	□□□□□ -0.24
APOL3-208	ENST00000426939	RBBP5	Q15291	538 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
APOL3-208	ENST00000426939	PDK4	Q16654	411 aa		13.57	□□□□□ -0.24
APOL3-208	ENST00000426939	TUBB8	Q3ZCM7	444 aa		13.57	□□□□□ -0.24
APOL3-208	ENST00000426939	TECRL	Q5HYJ1	363 aa		13.57	□□□□□ -0.24
APOL3-208	ENST00000426939	ADNP2	Q6IQ32	1131 aa		13.57	□□□□□ -0.24
APOL3-208	ENST00000426939	TRMT10C	Q7L0Y3	403 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
APOL3-208	ENST00000426939	SNX31	Q8N9S9	440 aa		13.57	□□□□□ -0.24
APOL3-208	ENST00000426939	CLEC1A	Q8NC01	280 aa		13.57	□□□□□ -0.24
APOL3-208	ENST00000426939	OR51Q1	Q8NH59	317 aa		13.57	□□□□□ -0.24
APOL3-208	ENST00000426939	SMIM10	Q96HG1	83 aa		13.57	□□□□□ -0.24
APOL3-208	ENST00000426939	SMAD5	Q99717	465 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
APOL3-208	ENST00000426939	CD244	Q9BZW8	370 aa		13.57	□□□□□ -0.24
APOL3-208	ENST00000426939	TRIM4	Q9C037	500 aa		13.57	□□□□□ -0.24
APOL3-208	ENST00000426939	EPN3	Q9H201	632 aa		13.57	□□□□□ -0.24
APOL3-208	ENST00000426939	VPS11	Q9H270	941 aa		13.57	□□□□□ -0.24
APOL3-208	ENST00000426939	EHD1	Q9H4M9	534 aa		13.57	□□□□□ -0.24
APOL3-208	ENST00000426939	KLHL31	Q9H511	634 aa		13.57	□□□□□ -0.24
APOL3-208	ENST00000426939	ZNF552	Q9H707	407 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
APOL3-208	ENST00000426939	ZNF358	Q9NW07	568 aa		13.57	□□□□□ -0.24
APOL3-208	ENST00000426939	GPR83	Q9NYM4	423 aa		13.57	□□□□□ -0.24
APOL3-208	ENST00000426939	ANAPC2	Q9UJX6	822 aa		13.57	□□□□□ -0.24
APOL3-208	ENST00000426939	LOC102723996	A0A087X1L8	192 aa		13.56	□□□□□ -0.24
APOL3-208	ENST00000426939	EXOC1L	A0A1B0GW35	172 aa		13.56	□□□□□ -0.24
APOL3-208	ENST00000426939	CCDC189	A1A4V9	331 aa		13.56	□□□□□ -0.24
APOL3-208	ENST00000426939	TRIM49D1	C9J1S8	452 aa		13.56	□□□□□ -0.24
APOL3-208	ENST00000426939	MAP2K7	O14733	419 aa		13.56	□□□□□ -0.24
APOL3-208	ENST00000426939	KLK8	O60259	260 aa		13.56	□□□□□ -0.24
APOL3-208	ENST00000426939	ACPP	P15309	386 aa		13.56	□□□□□ -0.24
APOL3-208	ENST00000426939	ALOX12	P18054	663 aa		13.56	□□□□□ -0.24
APOL3-208	ENST00000426939	XCR1	P46094	333 aa		13.56	□□□□□ -0.24
APOL3-208	ENST00000426939	OLR1	P78380	273 aa		13.56	□□□□□ -0.24
APOL3-208	ENST00000426939	EEF1A2	Q05639	463 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
APOL3-208	ENST00000426939	KLRB1	Q12918	225 aa		13.56	□□□□□ -0.24
APOL3-208	ENST00000426939	AIMP2	Q13155	320 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
APOL3-208	ENST00000426939	DOC2A	Q14183	400 aa		13.56	□□□□□ -0.24
APOL3-208	ENST00000426939	MYBPC3	Q14896	1274 aa		13.56	□□□□□ -0.24
APOL3-208	ENST00000426939	HERC3	Q15034	1050 aa		13.56	□□□□□ -0.24
APOL3-208	ENST00000426939	SETDB1	Q15047	1291 aa		13.56	□□□□□ -0.24
APOL3-208	ENST00000426939	ACAP2	Q15057	778 aa		13.56	□□□□□ -0.24
APOL3-208	ENST00000426939	FAM83E	Q2M2I3	478 aa		13.56	□□□□□ -0.24
APOL3-208	ENST00000426939	DEFB134	Q4QY38	66 aa		13.56	□□□□□ -0.24
APOL3-208	ENST00000426939	TEX35	Q5T0J7	233 aa		13.56	□□□□□ -0.24
APOL3-208	ENST00000426939	VWA5B1	Q5TIE3	1220 aa		13.56	□□□□□ -0.24

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