RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426333.6

EFTUD2-202, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene EFTUD2, Length 4,548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-202ENST00000426333 J3QLW9 94 aa10.67□□□□□ -0.7
EFTUD2-202ENST00000426333 M0R036 132 aa10.67□□□□□ -0.7
EFTUD2-202ENST00000426333 VNN1O95497 513 aa10.67□□□□□ -0.7
EFTUD2-202ENST00000426333 TBX18O95935 607 aa10.67□□□□□ -0.7
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF19P17023 458 aa10.67□□□□□ -0.7
EFTUD2-202ENST00000426333 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP10.67□□□□□ -0.7
EFTUD2-202ENST00000426333 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP10.67□□□□□ -0.7
EFTUD2-202ENST00000426333 UFM1P61960 85 aa10.67□□□□□ -0.7
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF527Q8NB42 609 aa10.67□□□□□ -0.7
EFTUD2-202ENST00000426333 OR4F6Q8NGB9 312 aa10.67□□□□□ -0.7
EFTUD2-202ENST00000426333 GRHL3Q8TE85 626 aa10.67□□□□□ -0.7
EFTUD2-202ENST00000426333 TMEM74Q96NL1 305 aa10.67□□□□□ -0.7
EFTUD2-202ENST00000426333 ALPK1Q96QP1 1244 aa10.67□□□□□ -0.7
EFTUD2-202ENST00000426333 LPIN3Q9BQK8 851 aa10.67□□□□□ -0.7
EFTUD2-202ENST00000426333 WDR26Q9H7D7 661 aa10.67□□□□□ -0.7
EFTUD2-202ENST00000426333 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP10.67□□□□□ -0.7
EFTUD2-202ENST00000426333 FNIP2Q9P278 1114 aa10.67□□□□□ -0.7
EFTUD2-202ENST00000426333 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP10.67□□□□□ -0.7
EFTUD2-202ENST00000426333 LOC730098B7Z3J9 87 aa10.67□□□□□ -0.7
EFTUD2-202ENST00000426333 MTX2O75431 263 aa10.67□□□□□ -0.7
EFTUD2-202ENST00000426333 JUNP05412 331 aaKnown RBP10.67□□□□□ -0.7
EFTUD2-202ENST00000426333 NR2C1P13056 603 aa10.67□□□□□ -0.7
EFTUD2-202ENST00000426333 CSKP41240 450 aa10.67□□□□□ -0.7
EFTUD2-202ENST00000426333 DGKEP52429 567 aa10.67□□□□□ -0.7
EFTUD2-202ENST00000426333 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP10.67□□□□□ -0.7
EFTUD2-202ENST00000426333 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP10.67□□□□□ -0.7
EFTUD2-202ENST00000426333 CHRNA6Q15825 494 aa10.67□□□□□ -0.7
EFTUD2-202ENST00000426333 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP10.67□□□□□ -0.7
EFTUD2-202ENST00000426333 PTCHD3Q3KNS1 767 aa10.67□□□□□ -0.7
EFTUD2-202ENST00000426333 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa10.67□□□□□ -0.7
EFTUD2-202ENST00000426333 NCEH1Q6PIU2 408 aa10.67□□□□□ -0.7
EFTUD2-202ENST00000426333 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP10.67□□□□□ -0.7
EFTUD2-202ENST00000426333 DPYSL5Q9BPU6 564 aa10.67□□□□□ -0.7
EFTUD2-202ENST00000426333 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP10.67□□□□□ -0.7
EFTUD2-202ENST00000426333 WDR37Q9Y2I8 494 aa10.67□□□□□ -0.7
EFTUD2-202ENST00000426333 LCHNA4D1U4 455 aa10.66□□□□□ -0.7
EFTUD2-202ENST00000426333 TTC34A8MYJ7 566 aa10.66□□□□□ -0.7
EFTUD2-202ENST00000426333 BTBD19C9JJ37 291 aa10.66□□□□□ -0.7
EFTUD2-202ENST00000426333 H7C2Y5 167 aa10.66□□□□□ -0.7
EFTUD2-202ENST00000426333 PROM1O43490 865 aa10.66□□□□□ -0.7
EFTUD2-202ENST00000426333 G6PDP11413 515 aa10.66□□□□□ -0.7
EFTUD2-202ENST00000426333 ACADVLP49748 655 aa10.66□□□□□ -0.7
EFTUD2-202ENST00000426333 MEP1AQ16819 746 aa10.66□□□□□ -0.7
EFTUD2-202ENST00000426333 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP10.66□□□□□ -0.7
EFTUD2-202ENST00000426333 YIPF7Q8N8F6 280 aa10.66□□□□□ -0.7
EFTUD2-202ENST00000426333 CYP2S1Q96SQ9 504 aa10.66□□□□□ -0.7
EFTUD2-202ENST00000426333 SEC61A2Q9H9S3 476 aa10.66□□□□□ -0.7
EFTUD2-202ENST00000426333 ENAMQ9NRM1 1142 aa10.66□□□□□ -0.7
EFTUD2-202ENST00000426333 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP10.66□□□□□ -0.7
EFTUD2-202ENST00000426333 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa10.66□□□□□ -0.7
EFTUD2-202ENST00000426333 NOTOA8MTQ0 251 aa10.66□□□□□ -0.7
EFTUD2-202ENST00000426333 VNN2O95498 520 aa10.66□□□□□ -0.7
EFTUD2-202ENST00000426333 ARSFP54793 590 aa10.66□□□□□ -0.7
EFTUD2-202ENST00000426333 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP10.66□□□□□ -0.7
EFTUD2-202ENST00000426333 KCNJ11Q14654 390 aa10.66□□□□□ -0.7
EFTUD2-202ENST00000426333 SGCBQ16585 318 aa10.66□□□□□ -0.7
EFTUD2-202ENST00000426333 SIRPB2Q5JXA9 342 aa10.66□□□□□ -0.7
EFTUD2-202ENST00000426333 EPGNQ6UW88 154 aa10.66□□□□□ -0.7
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP10.66□□□□□ -0.7
EFTUD2-202ENST00000426333 OR2AP1Q8NGE2 309 aa10.66□□□□□ -0.7
EFTUD2-202ENST00000426333 TTYH2Q9BSA4 534 aa10.66□□□□□ -0.7
EFTUD2-202ENST00000426333 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP10.66□□□□□ -0.7
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP10.66□□□□□ -0.7
EFTUD2-202ENST00000426333 ABCD2Q9UBJ2 740 aa10.66□□□□□ -0.7
EFTUD2-202ENST00000426333 DLGAP1O14490 977 aa10.66□□□□□ -0.7
EFTUD2-202ENST00000426333 CSF2P04141 144 aa10.66□□□□□ -0.7
EFTUD2-202ENST00000426333 PRKCGP05129 697 aa10.66□□□□□ -0.7
EFTUD2-202ENST00000426333 PRKACGP22612 351 aa10.66□□□□□ -0.7
EFTUD2-202ENST00000426333 DNAJB1P25685 340 aa10.66□□□□□ -0.7
EFTUD2-202ENST00000426333 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP10.66□□□□□ -0.7
EFTUD2-202ENST00000426333 CLCNKAP51800 687 aa10.66□□□□□ -0.7
EFTUD2-202ENST00000426333 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP10.66□□□□□ -0.71e-6■■■■■ 27.4
EFTUD2-202ENST00000426333 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa10.66□□□□□ -0.7
EFTUD2-202ENST00000426333 GDPD4Q6W3E5 623 aa10.66□□□□□ -0.7
EFTUD2-202ENST00000426333 AMIGO1Q86WK6 493 aa10.66□□□□□ -0.7
EFTUD2-202ENST00000426333 HDDC3Q8N4P3 179 aa10.66□□□□□ -0.7
EFTUD2-202ENST00000426333 CAMKVQ8NCB2 501 aa10.66□□□□□ -0.7
EFTUD2-202ENST00000426333 DENND6BQ8NEG7 585 aa10.66□□□□□ -0.7
EFTUD2-202ENST00000426333 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP10.66□□□□□ -0.7
EFTUD2-202ENST00000426333 HSH2DQ96JZ2 352 aa10.66□□□□□ -0.7
EFTUD2-202ENST00000426333 GKN1Q9NS71 199 aa10.66□□□□□ -0.7
EFTUD2-202ENST00000426333 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa10.66□□□□□ -0.7
EFTUD2-202ENST00000426333 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP10.66□□□□□ -0.7
EFTUD2-202ENST00000426333 ASB3Q9Y575 518 aa10.66□□□□□ -0.7
EFTUD2-202ENST00000426333 CDH10Q9Y6N8 788 aa10.66□□□□□ -0.7
EFTUD2-202ENST00000426333 LOC100509620A0A075B734 347 aa10.66□□□□□ -0.7
EFTUD2-202ENST00000426333 A0A0J9YVX5 310 aa10.66□□□□□ -0.7
EFTUD2-202ENST00000426333 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa10.66□□□□□ -0.7
EFTUD2-202ENST00000426333 ANKRD66B4E2M5 251 aa10.66□□□□□ -0.7
EFTUD2-202ENST00000426333 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa10.66□□□□□ -0.7
EFTUD2-202ENST00000426333 SOX14O95416 240 aa10.66□□□□□ -0.7
EFTUD2-202ENST00000426333 ALPIP09923 528 aa10.66□□□□□ -0.7
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP10.66□□□□□ -0.7
EFTUD2-202ENST00000426333 HSD11B1P28845 292 aa10.66□□□□□ -0.7
EFTUD2-202ENST00000426333 ENTPD1P49961 510 aa10.66□□□□□ -0.7
EFTUD2-202ENST00000426333 GPX6P59796 221 aa10.66□□□□□ -0.7
EFTUD2-202ENST00000426333 SEC23BQ15437 767 aa10.66□□□□□ -0.7
EFTUD2-202ENST00000426333 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP10.66□□□□□ -0.7
EFTUD2-202ENST00000426333 TICAM1Q8IUC6 712 aa10.66□□□□□ -0.7
EFTUD2-202ENST00000426333 NPAS3Q8IXF0 933 aa10.66□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.5 ms