RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418331.6

PTPRJ-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRJ, Length 5,122 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-201ENST00000418331 SFT2D3Q587I9 215 aa20.7■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 IDNKQ5T6J7 187 aa20.7■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 KCNH6Q9H252 994 aa20.7■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 MEAF6Q9HAF1 191 aa20.7■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 MYH1P12882 1939 aa20.7■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 LAMB4A4D0S4 1761 aa20.7■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 TYRP1P17643 537 aa20.7■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP20.7■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 PRRT3Q5FWE3 981 aa20.7■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 REEP3Q6NUK4 255 aa20.7■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 NCEH1Q6PIU2 408 aa20.7■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 LMX1AQ8TE12 382 aa20.7■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 SAMD11Q96NU1 681 aa20.7■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 KIF13AQ9H1H9 1805 aa20.7■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 PRODHO43272 600 aa20.7■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP20.7■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 ZFP69Q49AA0 526 aa20.7■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 APCDD1Q8J025 514 aa20.7■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 TTC9BQ8N6N2 239 aa20.7■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 XKR8Q9H6D3 395 aa20.7■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 IL23AQ9NPF7 189 aa20.7■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 MYH10P35580 1976 aa20.7■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 GLOD5A6NK44 160 aa20.69■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 SERPINA3P01011 423 aa20.69■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 PDYNP01213 254 aa20.69■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 SLC22A15Q8IZD6 547 aa20.69■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF221Q9UK13 617 aa20.69■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 PHF24Q9UPV7 400 aa20.69■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 NAV1Q8NEY1 1877 aa20.69■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 TTC34A8MYJ7 566 aa20.69■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 RPS21P63220 83 aaKnown RBP20.69■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 RAB33AQ14088 237 aa20.69■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 SLC29A4Q7RTT9 530 aa20.69■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 GKN2Q86XP6 184 aa20.69■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 KLHDC7BQ96G42 594 aa20.69■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 SLC2A11Q9BYW1 496 aa20.69■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 A0A1W2PP55 124 aa20.69■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP20.69■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP20.69■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa20.69■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 OR52E4Q8NGH9 312 aa20.69■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 RAB8BQ92930 207 aa20.69■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 FAM83CQ9BQN1 747 aa20.69■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa20.69■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa20.69■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 GMPRP36959 345 aa20.69■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 GALNT7Q86SF2 657 aa20.69■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 ZFAND4Q86XD8 727 aa20.69■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 OR8J3Q8NGG0 315 aa20.69■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 SORCS1Q8WY21 1168 aa20.69■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 SFXN1Q9H9B4 322 aa20.69■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP20.69■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 C4BP0C0L5 1744 aa20.68■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 A0A075B6Q4 140 aa20.68■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 A0A1W2PQ72 361 aa20.68■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 SCDO00767 359 aa20.68■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 RFPL2O75678 378 aa20.68■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP20.68■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 RPP38P78345 283 aaKnown RBP20.68■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP20.68■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP20.68■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 OR2M4Q96R27 311 aa20.68■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 PIGUQ9H490 435 aa20.68■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 A8MU76 341 aa20.68■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 PDCD5O14737 125 aa20.68■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 PCDHGA12O60330 932 aa20.68■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 AGXTP21549 392 aa20.68■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP20.68■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 SMCO1Q147U7 214 aa20.68■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP20.68■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 ARMCX6Q7L4S7 300 aa20.68■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa20.68■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP20.68■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 MALT1Q9UDY8 824 aa20.68■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 DHCR24Q15392 516 aa20.68■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa20.68■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 CLLU1OSQ5K130 101 aa20.68■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 RANBP10Q6VN20 620 aa20.68■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP20.68■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 ZFP3Q96NJ6 502 aa20.68■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 SERINC1Q9NRX5 453 aa20.68■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 WDR45Q9Y484 360 aa20.68■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 C9J4A7 227 aa20.68■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 TBX1O43435 398 aa20.68■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 TYSND1Q2T9J0 566 aa20.68■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP20.68■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 NCSTNQ92542 709 aa20.68■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 TOR3AQ9H497 397 aa20.68■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 LRRC42Q9Y546 428 aa20.68■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 HEPACAM2A8MVW5 462 aa20.67■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP20.67■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP20.67■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 BCKDHAP12694 445 aa20.67■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 LAPTM4AQ15012 233 aa20.67■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 PLA2G15Q8NCC3 412 aa20.67■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 FBXL20Q96IG2 436 aa20.67■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 KCTD7Q96MP8 289 aa20.67■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 MAFFQ9ULX9 164 aa20.67■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa20.67■□□□□ 0.9
PTPRJ-201ENST00000418331 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa20.67■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.3 ms