RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417536.5

SH3BP1-202, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,858 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-202ENST00000417536 PTPN5P54829 565 aa18.01■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP18.01■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 CAMK1Q14012 370 aa18.01■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 HPS1Q92902 700 aa18.01■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 PITX2Q99697 317 aa18.01■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa18.01■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 TESMINQ9Y4I5 508 aa18.01■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 SUV39H1O43463 412 aa18■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP18■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 ALOX5P09917 674 aa18■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 TNFRSF1BP20333 461 aa18■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 PPP3CCP48454 512 aa18■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP18■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 KCNJ10P78508 379 aa18■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 LILRA6Q6PI73 481 aa18■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 FOXJ1Q92949 421 aa18■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 FCRL1Q96LA6 429 aa18■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 ITPAQ9BY32 194 aa18■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 TMEM184CQ9NVA4 438 aa18■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 OSGIN1Q9UJX0 560 aa18■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP18■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 LINC01553A4QN01 128 aa18■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 OPN1SWP03999 348 aa18■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP18■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 MPC1LP0DKB6 136 aa18■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 ACPPP15309 386 aa18■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP18■□□□□ 0.474e-7■■■■■ 29
SH3BP1-202ENST00000417536 VEZF1Q14119 521 aa18■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 HKDC1Q2TB90 917 aa18■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP18■□□□□ 0.472e-6■□□□□ 10.8
SH3BP1-202ENST00000417536 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa18■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 MINDY2Q8NBR6 621 aa18■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 SPPL2AQ8TCT8 520 aa18■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 SCAMP4Q969E2 229 aa18■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 MED8Q96G25 268 aa18■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 SIGLEC11Q96RL6 698 aa18■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 ASAH2Q9NR71 780 aa18■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 B4GALT6Q9UBX8 382 aa18■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP18■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 CLDN24A6NM45 220 aa17.99■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 GABRR3A8MPY1 467 aa17.99■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 PRMT3O60678 531 aa17.99■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 ETHE1O95571 254 aa17.99■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 CA3P07451 260 aa17.99■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 CD40LGP29965 261 aa17.99■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 DOC2AQ14183 400 aa17.99■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP17.99■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 WDR20Q8TBZ3 569 aa17.99■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC38A4Q969I6 547 aa17.99■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 HRASLS5Q96KN8 279 aa17.99■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 BRD9Q9H8M2 597 aa17.99■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 ABCB10Q9NRK6 738 aa17.99■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF229Q9UJW7 825 aa17.99■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 OR2AG2A6NM03 316 aa17.99■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 LEFTY2O00292 366 aa17.99■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 AIREO43918 545 aa17.99■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 EFCAB14O75071 495 aa17.99■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 SPINT3P49223 89 aa17.99■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 AP1S2P56377 157 aa17.99■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP17.99■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 GAB1Q13480 694 aa17.99■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 UBE2UQ5VVX9 321 aa17.99■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 FAM124AQ86V42 546 aa17.99■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP17.99■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP17.99■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 GPR156Q8NFN8 814 aa17.99■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 RHOXF1Q8NHV9 184 aa17.99■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 SPPL3Q8TCT6 385 aa17.99■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP17.99■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 ABHD8Q96I13 439 aa17.99■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 ZSWIM3Q96MP5 696 aa17.99■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 FEVQ99581 238 aa17.99■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 RAD9AQ99638 391 aa17.99■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 HEPHQ9BQS7 1158 aa17.99■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 LINC00597Q9H2U6 94 aa17.99■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 ADPRHL2Q9NX46 363 aa17.99■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa17.99■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP17.98■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 BMPR1AP36894 532 aa17.98■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 NUDT6P53370 316 aa17.98■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 FADDQ13158 208 aa17.98■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 SP140Q13342 867 aa17.98■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa17.98■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 CPTPQ5TA50 214 aa17.98■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa17.98■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 LIPJQ5W064 366 aa17.98■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 NAGSQ8N159 534 aa17.98■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 OR52J3Q8NH60 311 aa17.98■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 EPYCQ99645 322 aa17.98■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 PSD2Q9BQI7 771 aa17.98■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 EPS8L2Q9H6S3 715 aa17.98■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP17.98■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa17.98■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 BRWD1Q9NSI6 2320 aa17.98■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 TMEM202A6NGA9 273 aa17.98■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 MYO1DO94832 1006 aa17.98■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC19A1P41440 591 aa17.98■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 PPP5CP53041 499 aa17.98■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC13A2Q13183 592 aa17.98■□□□□ 0.47
SH3BP1-202ENST00000417536 NAE1Q13564 534 aa17.98■□□□□ 0.47
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