RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000414620.1

ACTB-202, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 4

Gene ACTB, Length 561 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-202ENST00000414620 TRBC2A0A5B9 178 aa14.65□□□□□ -0.06
ACTB-202ENST00000414620 OR5H15A6NDH6 313 aa14.65□□□□□ -0.06
ACTB-202ENST00000414620 CDC7O00311 574 aa14.65□□□□□ -0.06
ACTB-202ENST00000414620 DNAJB6O75190 326 aa14.65□□□□□ -0.06
ACTB-202ENST00000414620 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
ACTB-202ENST00000414620 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
ACTB-202ENST00000414620 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
ACTB-202ENST00000414620 HNF4AP41235 474 aa14.65□□□□□ -0.06
ACTB-202ENST00000414620 TDGF1P3P51864 188 aa14.65□□□□□ -0.06
ACTB-202ENST00000414620 AP2B1P63010 937 aa14.65□□□□□ -0.06
ACTB-202ENST00000414620 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
ACTB-202ENST00000414620 PMP22Q01453 160 aa14.65□□□□□ -0.06
ACTB-202ENST00000414620 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
ACTB-202ENST00000414620 DEFB134Q4QY38 66 aa14.65□□□□□ -0.06
ACTB-202ENST00000414620 SFT2D3Q587I9 215 aa14.65□□□□□ -0.06
ACTB-202ENST00000414620 C1QL3Q5VWW1 255 aa14.65□□□□□ -0.06
ACTB-202ENST00000414620 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
ACTB-202ENST00000414620 STRA8Q7Z7C7 330 aa14.65□□□□□ -0.06
ACTB-202ENST00000414620 FJX1Q86VR8 437 aa14.65□□□□□ -0.06
ACTB-202ENST00000414620 BEST3Q8N1M1 668 aa14.65□□□□□ -0.06
ACTB-202ENST00000414620 FBXO36Q8NEA4 188 aa14.65□□□□□ -0.06
ACTB-202ENST00000414620 ABHD11Q8NFV4 315 aa14.65□□□□□ -0.06
ACTB-202ENST00000414620 ATL1Q8WXF7 558 aa14.65□□□□□ -0.06
ACTB-202ENST00000414620 RUNDC3BQ96NL0 473 aa14.65□□□□□ -0.06
ACTB-202ENST00000414620 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
ACTB-202ENST00000414620 STMN3Q9NZ72 180 aa14.65□□□□□ -0.06
ACTB-202ENST00000414620 DYRK1BQ9Y463 629 aa14.65□□□□□ -0.06
ACTB-202ENST00000414620 SAR1BQ9Y6B6 198 aa14.65□□□□□ -0.06
ACTB-202ENST00000414620 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
ACTB-202ENST00000414620 CTAGE15A4D2H0 777 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTB-202ENST00000414620 EFCAB8A8MWE9 144 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTB-202ENST00000414620 PIAS1O75925 651 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTB-202ENST00000414620 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
ACTB-202ENST00000414620 DCTP40126 519 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTB-202ENST00000414620 AGTR2P50052 363 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTB-202ENST00000414620 REEP5Q00765 189 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTB-202ENST00000414620 RHAGQ02094 409 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTB-202ENST00000414620 MGAT5Q09328 741 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTB-202ENST00000414620 CSHL1Q14406 222 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTB-202ENST00000414620 ABRAXAS2Q15018 415 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTB-202ENST00000414620 HERC3Q15034 1050 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTB-202ENST00000414620 INAQ16352 499 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTB-202ENST00000414620 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
ACTB-202ENST00000414620 PLAG1Q6DJT9 500 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTB-202ENST00000414620 CTAGE6Q86UF2 777 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTB-202ENST00000414620 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
ACTB-202ENST00000414620 OR4K1Q8NGD4 311 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTB-202ENST00000414620 SUN3Q8TAQ9 357 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTB-202ENST00000414620 NR4A3Q92570 626 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTB-202ENST00000414620 LRRC39Q96DD0 335 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTB-202ENST00000414620 EGFL8Q99944 293 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTB-202ENST00000414620 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
ACTB-202ENST00000414620 LANCL2Q9NS86 450 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTB-202ENST00000414620 ANKRD10Q9NXR5 420 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTB-202ENST00000414620 TEKT2Q9UIF3 430 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTB-202ENST00000414620 SNX24Q9Y343 169 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTB-202ENST00000414620 SLC22A7Q9Y694 548 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTB-202ENST00000414620 POLEQ07864 2286 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTB-202ENST00000414620 MAN1A2O60476 641 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTB-202ENST00000414620 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
ACTB-202ENST00000414620 PRAMEF2O60811 474 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTB-202ENST00000414620 ZG16O60844 167 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTB-202ENST00000414620 B4GALT2O60909 372 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTB-202ENST00000414620 RASAL1O95294 804 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTB-202ENST00000414620 CYC1P08574 325 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTB-202ENST00000414620 ALOX12P18054 663 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTB-202ENST00000414620 MST1P26927 711 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTB-202ENST00000414620 RPL21P46778 160 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
ACTB-202ENST00000414620 SCTRP47872 440 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTB-202ENST00000414620 PER3P56645 1201 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTB-202ENST00000414620 TAS2R39P59534 338 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTB-202ENST00000414620 RAB8AP61006 207 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTB-202ENST00000414620 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
ACTB-202ENST00000414620 RGS1Q08116 209 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTB-202ENST00000414620 NSDHLQ15738 373 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTB-202ENST00000414620 PPP1R3AQ16821 1122 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTB-202ENST00000414620 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
ACTB-202ENST00000414620 GFRALQ6UXV0 394 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTB-202ENST00000414620 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
ACTB-202ENST00000414620 CRLF3Q8IUI8 442 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTB-202ENST00000414620 ZBED8Q8IZ13 594 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTB-202ENST00000414620 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTB-202ENST00000414620 TBC1D19Q8N5T2 526 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTB-202ENST00000414620 KRT12Q99456 494 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTB-202ENST00000414620 NPAS2Q99743 824 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTB-202ENST00000414620 SARGQ9BW04 601 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTB-202ENST00000414620 HES7Q9BYE0 225 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTB-202ENST00000414620 FAM129AQ9BZQ8 928 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTB-202ENST00000414620 RNF32Q9H0A6 362 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTB-202ENST00000414620 ZFP69BQ9UJL9 534 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTB-202ENST00000414620 PYCARDQ9ULZ3 195 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTB-202ENST00000414620 SLC22A14Q9Y267 594 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTB-202ENST00000414620 CCDC188H7C350 402 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTB-202ENST00000414620 TP73O15350 636 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTB-202ENST00000414620 CHST10O43529 356 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTB-202ENST00000414620 FHP07954 510 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTB-202ENST00000414620 PAFAH1B1P43034 410 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTB-202ENST00000414620 OR4D2P58180 307 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTB-202ENST00000414620 PWP1Q13610 501 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTB-202ENST00000414620 USP10Q14694 798 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
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