RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412161.1

SYNE1-AS1-201, SYNE1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SYNE1-AS1, Length 553 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 IGSF5Q9NSI5 407 aa8.14□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP8.14□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 OPTCQ9UBM4 332 aa8.14□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TRPC4Q9UBN4 977 aa8.14□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CTSFQ9UBX1 484 aa8.14□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP8.14□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 IKZF3Q9UKT9 509 aa8.14□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa8.14□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa8.14□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NBASA2RRP1 2371 aa8.14□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 HMX2A2RU54 273 aa8.13□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ARGFXA6NJG6 315 aa8.13□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SUPT3HB4E1H0 165 aa8.13□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CDK2AP1O14519 115 aa8.13□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MAP2K7O14733 419 aa8.13□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 P2RX6O15547 441 aa8.13□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 FOXS1O43638 330 aa8.13□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 KLK8O60259 260 aa8.13□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NRP2O60462 931 aa8.13□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SUPT3HO75486 399 aa8.13□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CLEC3AO75596 197 aa8.13□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 FAM155BO75949 473 aa8.13□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 UMODP07911 640 aa8.13□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ICAM2P13598 275 aa8.13□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 GFAPP14136 432 aa8.13□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ACPPP15309 386 aa8.13□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 EPB42P16452 691 aa8.13□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 VARSP26640 1264 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 OTX2P32243 289 aa8.13□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 HNF4AP41235 474 aa8.13□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TSFMP43897 325 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 OR1D4P47884 311 aa8.13□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 AGTR2P50052 363 aa8.13□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PGDP52209 483 aa8.13□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ARFIP1P53367 373 aa8.13□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PGGT1BP53609 377 aa8.13□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NAA20P61599 178 aa8.13□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 KLC1Q07866 573 aa8.13□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ATP1A4Q13733 1029 aa8.13□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 BMPR2Q13873 1038 aa8.13□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SETDB1Q15047 1291 aa8.13□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 OR4D1Q15615 310 aa8.13□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TUBB8Q3ZCM7 444 aa8.13□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CATSPEREQ5SY80 951 aa8.13□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TEX35Q5T0J7 233 aa8.13□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa8.13□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa8.13□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ADGRD1Q6QNK2 874 aa8.13□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa8.13□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa8.13□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PLD3Q8IV08 490 aa8.13□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 HOMEZQ8IX15 550 aa8.13□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ZNF843Q8N446 348 aa8.13□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 AMER3Q8N944 861 aa8.13□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 DCAKDQ8WVC6 231 aa8.13□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 GAL3ST3Q96A11 431 aa8.13□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 REPS1Q96D71 796 aa8.13□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ABHD17AQ96GS6 310 aa8.13□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CENPKQ9BS16 269 aa8.13□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TMEM79Q9BSE2 394 aa8.13□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SLC25A23Q9BV35 468 aa8.13□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SLC6A16Q9GZN6 736 aa8.13□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RHBGQ9H310 441 aa8.13□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa8.13□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RIC8BQ9NVN3 520 aa8.13□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 P4HTMQ9NXG6 502 aa8.13□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 GPR83Q9NYM4 423 aa8.13□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 C3orf18Q9UK00 162 aa8.13□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SH2B3Q9UQQ2 575 aa8.13□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 DOCK10Q96BY6 2186 aa8.12□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 BAHCC1Q9P281 2608 aa8.12□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa8.12□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 FEZF1A0PJY2 475 aa8.12□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 BLACEA4D250 179 aa8.12□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ANKDD1BA6NHY2 528 aa8.12□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 IDSB3KWA1 339 aa8.12□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TRIM49D1C9J1S8 452 aa8.12□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa8.12□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa8.12□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 I3L1I5 382 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 STX16O14662 325 aa8.12□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TAPBPO15533 448 aa8.12□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 DPM1O60762 260 aa8.12□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SMIM24O75264 130 aa8.12□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 C1QL1O75973 258 aa8.12□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 KLHL18O94889 574 aa8.12□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 HPP00738 406 aa8.12□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 GSTA1P08263 222 aa8.12□□□□□ -1.11
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MTHFD2P13995 350 aa8.12□□□□□ -1.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.8 ms