RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000390930.1

SNORD17-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 17, humanhuman

BASIC

Gene SNORD17, Length 237 nt, Biotype snoRNA, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD17-201ENST00000390930 QRFPRQ96P65 431 aa3.29□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 EFHD1Q9BUP0 239 aa3.29□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 TRIM54Q9BYV2 358 aa3.29□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa3.29□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 SLC6A16Q9GZN6 736 aa3.29□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 SLC26A1Q9H2B4 701 aa3.29□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 NT5DC2Q9H857 520 aa3.29□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 ZNF304Q9HCX3 659 aa3.29□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 MLXIPLQ9NP71 852 aa3.29□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 TXLNGQ9NUQ3 528 aa3.29□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 DNAJC11Q9NVH1 559 aa3.29□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 IRAK4Q9NWZ3 460 aa3.29□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 WWOXQ9NZC7 414 aa3.29□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 GPRC5BQ9NZH0 403 aa3.29□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 CD274Q9NZQ7 290 aa3.29□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 XPR1Q9UBH6 696 aa3.29□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 FETUBQ9UGM5 382 aa3.29□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 NDOR1Q9UHB4 597 aa3.29□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 TBK1Q9UHD2 729 aa3.29□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 ZFP69BQ9UJL9 534 aa3.29□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 ZNF225Q9UK10 706 aa3.29□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 KCND3Q9UK17 655 aa3.29□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 TLK1Q9UKI8 766 aa3.29□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 RNF112Q9ULX5 631 aa3.29□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 SRPK3Q9UPE1 567 aa3.29□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 RNF11Q9Y3C5 154 aa3.29□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 DYRK1BQ9Y463 629 aa3.29□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 CLDN16Q9Y5I7 305 aa3.29□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa3.29□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 KCNE2Q9Y6J6 123 aa3.29□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa3.28□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 SHANK1Q9Y566 2161 aa3.28□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 CROCCQ5TZA2 2017 aa3.28□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa3.28□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa3.28□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 A0A1W2PQ72 361 aa3.28□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 ARGFXA6NJG6 315 aa3.28□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 SMIM23A6NLE4 172 aa3.28□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 A8MT66 165 aa3.28□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 C9J4A7 227 aa3.28□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 FAM227AF5H4B4 570 aa3.28□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 G3V2L1 256 aa3.28□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 H0YIG0 161 aa3.28□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa3.28□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 TGFBR3LH3BV60 316 aa3.28□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 RTCAO00442 366 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 STX16O14662 325 aa3.28□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 CLGNO14967 610 aa3.28□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 NDUFS4O43181 175 aa3.28□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 CHST10O43529 356 aa3.28□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 SH3BGRLO75368 114 aa3.28□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 RDH16O75452 317 aa3.28□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 CLEC3AO75596 197 aa3.28□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 CEACAM4O75871 244 aa3.28□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 KRT38O76015 456 aa3.28□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 IPO13O94829 963 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 NSA2O95478 260 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 ETHE1O95571 254 aa3.28□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 PROCP04070 461 aa3.28□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 SERPIND1P05546 499 aa3.28□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 SERPINA6P08185 405 aa3.28□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 CELA2AP08217 269 aa3.28□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 RPS17P08708 135 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 NUDT17P0C025 328 aa3.28□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 COX6A1P12074 109 aa3.28□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 COL6A2P12110 1019 aa3.28□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 GFAPP14136 432 aa3.28□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 TSPAN8P19075 237 aa3.28□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 FBLP22087 321 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 MMP11P24347 488 aa3.28□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 CNTFP26441 200 aa3.28□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 OTX2P32243 289 aa3.28□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 AHRP35869 848 aa3.28□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 CCR10P46092 362 aa3.28□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 PIK3CGP48736 1102 aa3.28□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 EMP2P54851 167 aa3.28□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 CDH13P55290 713 aa3.28□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 BTG2P78543 158 aa3.28□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 MC1RQ01726 317 aa3.28□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 RHAGQ02094 409 aa3.28□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 IRF8Q02556 426 aa3.28□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 SLC18A2Q05940 514 aa3.28□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 KLC1Q07866 573 aa3.28□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 Q0VFX4 171 aa3.28□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 TRAF3Q13114 568 aa3.28□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 CHIT1Q13231 466 aa3.28□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 KCNAB2Q13303 367 aa3.28□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 PWP1Q13610 501 aa3.28□□□□□ -1.88
SNORD17-201ENST00000390930 GTF2H2Q13888 395 aa3.28□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.2 ms