RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366686.1

CCSAP-202, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CCSAP, Length 4,399 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-202ENST00000366686 C17orf102A2RUQ5 167 aa2.4□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 CFAP73A6NFT4 308 aa2.4□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 A6NL46 340 aa2.4□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 GABRR3A8MPY1 467 aa2.4□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP2.4□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 CSO75390 466 aaKnown RBP2.4□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 PMPCBO75439 489 aa2.4□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 FLOT1O75955 427 aa2.4□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 STC2O76061 302 aa2.4□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 GLCEO94923 617 aa2.4□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 CH25HO95992 272 aa2.4□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 FESP07332 822 aa2.4□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 CD59P13987 128 aa2.4□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 CAPGP40121 348 aa2.4□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 PCP4P48539 62 aa2.4□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF75DP51815 510 aa2.4□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 VAV2P52735 878 aa2.4□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 MZT1Q08AG7 82 aa2.4□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 E2F2Q14209 437 aa2.4□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP2.4□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 CYP1B1Q16678 543 aa2.4□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 PCK2Q16822 640 aa2.4□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 COL28A1Q2UY09 1125 aa2.4□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 IGSF11Q5DX21 431 aa2.4□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 XKR3Q5GH77 459 aa2.4□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 GCNT6Q5T4J0 391 aa2.4□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 LIN9Q5TKA1 542 aa2.4□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 ULK3Q6PHR2 472 aa2.4□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP2.4□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa2.4□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 PEX26Q7Z412 305 aa2.4□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF554Q86TJ5 538 aa2.4□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa2.4□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 BBS5Q8N3I7 341 aa2.4□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 CCDC197Q8NCU1 140 aa2.4□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 DDHD1Q8NEL9 900 aa2.4□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 OR52N4Q8NGI2 321 aa2.4□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP2.4□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 TMEM171Q8WVE6 324 aa2.4□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 CKAP2Q8WWK9 683 aa2.4□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 ATL1Q8WXF7 558 aa2.4□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP2.4□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 ELMO2Q96JJ3 720 aa2.4□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 ASCL2Q99929 193 aa2.4□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 TTYH3Q9C0H2 523 aa2.4□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP2.4□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 BCAS3Q9H6U6 928 aa2.4□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP2.4□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 ECHDC1Q9NTX5 307 aa2.4□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP2.4□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 CROTQ9UKG9 612 aa2.4□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 PCDHA12Q9UN75 941 aa2.4□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 TNNQ9UQP3 1299 aa2.4□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 RAI2Q9Y5P3 530 aa2.4□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 ELP1O95163 1332 aa2.39□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 ICE1Q9Y2F5 2266 aa2.39□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa2.39□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 LOC100653049A0A140TA62 436 aa2.39□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 ACOD1A6NK06 481 aa2.39□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 MCIDASD6RGH6 385 aa2.39□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 NDUFAB1O14561 156 aa2.39□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 HAT1O14929 419 aa2.39□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 TBX19O60806 448 aa2.39□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 PRAMEF2O60811 474 aa2.39□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 KRT34O76011 436 aa2.39□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP2.39□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 CALM1P0DP23 149 aa2.39□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 CALM2P0DP24 149 aa2.39□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 CALM3P0DP25 149 aa2.39□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 TMEM225BP0DP42 221 aa2.39□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP2.39□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 IFI30P13284 250 aa2.39□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 ETS2P15036 469 aa2.39□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 UCHL3P15374 230 aa2.39□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP2.39□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 CYP3A5P20815 502 aa2.39□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 CYP2F1P24903 491 aa2.39□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 PSMA2P25787 234 aa2.39□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 TYK2P29597 1187 aa2.39□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 STAT6P42226 847 aa2.39□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 ARSEP51690 589 aa2.39□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 KCNQ1P51787 676 aa2.39□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 OVGP1Q12889 678 aa2.39□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 RIN1Q13671 783 aa2.39□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 RUNX2Q13950 521 aa2.39□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP2.39□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 MAPK11Q15759 364 aa2.39□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 CA9Q16790 459 aa2.39□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 USP41Q3LFD5 358 aa2.39□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa2.39□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 BCL7AQ4VC05 210 aa2.39□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 BRMS1LQ5PSV4 323 aa2.39□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP2.39□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP2.39□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 SCYL2Q6P3W7 929 aa2.39□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa2.39□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 C1QL4Q86Z23 238 aa2.39□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 LRRC8AQ8IWT6 810 aa2.39□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP2.39□□□□□ -2.03
CCSAP-202ENST00000366686 TMEFF1Q8IYR6 380 aa2.39□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.8 ms