RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366661.8

TTC13-201, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 13, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTC13, Length 3,253 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC13-201ENST00000366661 TOR1AO14656 332 aa14.84□□□□□ -0.03
TTC13-201ENST00000366661 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
TTC13-201ENST00000366661 GKP32189 559 aa14.84□□□□□ -0.03
TTC13-201ENST00000366661 RPL9P32969 192 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
TTC13-201ENST00000366661 FEN1P39748 380 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
TTC13-201ENST00000366661 CD86P42081 329 aa14.84□□□□□ -0.03
TTC13-201ENST00000366661 VLDLRP98155 873 aa14.84□□□□□ -0.03
TTC13-201ENST00000366661 FOXM1Q08050 763 aa14.84□□□□□ -0.03
TTC13-201ENST00000366661 SLC25A52Q3SY17 297 aa14.84□□□□□ -0.03
TTC13-201ENST00000366661 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
TTC13-201ENST00000366661 LIPKQ5VXJ0 399 aa14.84□□□□□ -0.03
TTC13-201ENST00000366661 MYDGFQ969H8 173 aa14.84□□□□□ -0.03
TTC13-201ENST00000366661 TMEM80Q96HE8 168 aa14.84□□□□□ -0.03
TTC13-201ENST00000366661 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa14.84□□□□□ -0.03
TTC13-201ENST00000366661 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
TTC13-201ENST00000366661 BARHL1Q9BZE3 327 aa14.84□□□□□ -0.03
TTC13-201ENST00000366661 GPR62Q9BZJ7 368 aa14.84□□□□□ -0.03
TTC13-201ENST00000366661 CHIAQ9BZP6 476 aa14.84□□□□□ -0.03
TTC13-201ENST00000366661 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
TTC13-201ENST00000366661 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
TTC13-201ENST00000366661 ECI2O75521 394 aa14.83□□□□□ -0.03
TTC13-201ENST00000366661 CSF3P09919 207 aa14.83□□□□□ -0.03
TTC13-201ENST00000366661 FGL2Q14314 439 aa14.83□□□□□ -0.03
TTC13-201ENST00000366661 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.03
TTC13-201ENST00000366661 LRRC66Q68CR7 880 aa14.83□□□□□ -0.03
TTC13-201ENST00000366661 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.03
TTC13-201ENST00000366661 PLCZ1Q86YW0 608 aa14.83□□□□□ -0.03
TTC13-201ENST00000366661 TMEM86AQ8N2M4 240 aa14.83□□□□□ -0.03
TTC13-201ENST00000366661 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.03
TTC13-201ENST00000366661 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.03
TTC13-201ENST00000366661 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.03
TTC13-201ENST00000366661 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa14.83□□□□□ -0.03
TTC13-201ENST00000366661 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa14.83□□□□□ -0.03
TTC13-201ENST00000366661 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa14.83□□□□□ -0.04
TTC13-201ENST00000366661 SLC16A6O15403 523 aa14.83□□□□□ -0.04
TTC13-201ENST00000366661 SEC22BO75396 215 aa14.83□□□□□ -0.04
TTC13-201ENST00000366661 TBX18O95935 607 aa14.83□□□□□ -0.04
TTC13-201ENST00000366661 SELPP16109 830 aa14.83□□□□□ -0.04
TTC13-201ENST00000366661 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP14.83□□□□□ -0.04
TTC13-201ENST00000366661 OR1E2P47887 323 aa14.83□□□□□ -0.04
TTC13-201ENST00000366661 KCNQ1P51787 676 aa14.83□□□□□ -0.04
TTC13-201ENST00000366661 KANK2Q63ZY3 851 aa14.83□□□□□ -0.04
TTC13-201ENST00000366661 SAXO2Q658L1 398 aa14.83□□□□□ -0.04
TTC13-201ENST00000366661 FRMPD2BQ6IN97 320 aa14.83□□□□□ -0.04
TTC13-201ENST00000366661 DOK6Q6PKX4 331 aa14.83□□□□□ -0.04
TTC13-201ENST00000366661 OR4N4Q8N0Y3 316 aa14.83□□□□□ -0.04
TTC13-201ENST00000366661 TTLQ8NG68 377 aa14.83□□□□□ -0.04
TTC13-201ENST00000366661 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
TTC13-201ENST00000366661 QRFPRQ96P65 431 aa14.83□□□□□ -0.04
TTC13-201ENST00000366661 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
TTC13-201ENST00000366661 INPP5KQ9BT40 448 aa14.83□□□□□ -0.04
TTC13-201ENST00000366661 SLC52A3Q9NQ40 469 aa14.83□□□□□ -0.04
TTC13-201ENST00000366661 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa14.83□□□□□ -0.04
TTC13-201ENST00000366661 PIPSLA2A3N6 862 aa14.83□□□□□ -0.04
TTC13-201ENST00000366661 RFXAPO00287 272 aa14.83□□□□□ -0.04
TTC13-201ENST00000366661 DCLK1O15075 740 aa14.83□□□□□ -0.04
TTC13-201ENST00000366661 KDM4BO94953 1096 aa14.83□□□□□ -0.04
TTC13-201ENST00000366661 CYP17A1P05093 508 aa14.83□□□□□ -0.04
TTC13-201ENST00000366661 GLAP06280 429 aa14.83□□□□□ -0.04
TTC13-201ENST00000366661 CD1DP15813 335 aa14.83□□□□□ -0.04
TTC13-201ENST00000366661 GDF5P43026 501 aa14.83□□□□□ -0.04
TTC13-201ENST00000366661 FADDQ13158 208 aa14.83□□□□□ -0.04
TTC13-201ENST00000366661 FCN2Q15485 313 aa14.83□□□□□ -0.04
TTC13-201ENST00000366661 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
TTC13-201ENST00000366661 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
TTC13-201ENST00000366661 BCL2L15Q5TBC7 163 aa14.83□□□□□ -0.04
TTC13-201ENST00000366661 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa14.83□□□□□ -0.04
TTC13-201ENST00000366661 ZFAND4Q86XD8 727 aa14.83□□□□□ -0.04
TTC13-201ENST00000366661 ZFP41Q8N8Y5 198 aa14.83□□□□□ -0.04
TTC13-201ENST00000366661 OR13C4Q8NGS5 318 aa14.83□□□□□ -0.04
TTC13-201ENST00000366661 PYURFQ96I23 114 aa14.83□□□□□ -0.04
TTC13-201ENST00000366661 RDH12Q96NR8 316 aa14.83□□□□□ -0.04
TTC13-201ENST00000366661 APOL5Q9BWW9 433 aa14.83□□□□□ -0.04
TTC13-201ENST00000366661 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
TTC13-201ENST00000366661 WDCPQ9H6R7 721 aa14.83□□□□□ -0.04
TTC13-201ENST00000366661 SPASTQ9UBP0 616 aa14.83□□□□□ -0.04
TTC13-201ENST00000366661 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
TTC13-201ENST00000366661 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
TTC13-201ENST00000366661 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa14.82□□□□□ -0.04
TTC13-201ENST00000366661 MYL12BO14950 172 aa14.82□□□□□ -0.04
TTC13-201ENST00000366661 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
TTC13-201ENST00000366661 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
TTC13-201ENST00000366661 MYL12AP19105 171 aa14.82□□□□□ -0.04
TTC13-201ENST00000366661 CLCN5P51795 746 aa14.82□□□□□ -0.04
TTC13-201ENST00000366661 AANATQ16613 207 aa14.82□□□□□ -0.04
TTC13-201ENST00000366661 CTXN3Q4LDR2 81 aa14.82□□□□□ -0.04
TTC13-201ENST00000366661 C22orf42Q6IC83 251 aa14.82□□□□□ -0.04
TTC13-201ENST00000366661 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa14.82□□□□□ -0.04
TTC13-201ENST00000366661 KRT74Q7RTS7 529 aa14.82□□□□□ -0.04
TTC13-201ENST00000366661 VN1R5Q7Z5H4 357 aa14.82□□□□□ -0.04
TTC13-201ENST00000366661 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
TTC13-201ENST00000366661 MIB1Q86YT6 1006 aa14.82□□□□□ -0.04
TTC13-201ENST00000366661 APH1BQ8WW43 257 aa14.82□□□□□ -0.04
TTC13-201ENST00000366661 UBXN10Q96LJ8 280 aa14.82□□□□□ -0.04
TTC13-201ENST00000366661 SMIM14Q96QK8 99 aa14.82□□□□□ -0.04
TTC13-201ENST00000366661 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
TTC13-201ENST00000366661 IFNA16P05015 189 aa14.82□□□□□ -0.04
TTC13-201ENST00000366661 HLA-DQB2P05538 268 aa14.82□□□□□ -0.04
TTC13-201ENST00000366661 MAP2K3P46734 347 aa14.82□□□□□ -0.04
TTC13-201ENST00000366661 HSPA14Q0VDF9 509 aa14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71.8 ms