RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362832.1

RNU6-170P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 170, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-170P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-170P-201ENST00000362832 SPANXN4Q5MJ08 99 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP0.15□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 OR4A47Q6IF82 309 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 TMCO3Q6UWJ1 677 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZNF836Q6ZNA1 936 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZNF677Q86XU0 584 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 ARMC8Q8IUR7 673 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP0.15□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZNF786Q8N393 782 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 GPR137CQ8N3F9 429 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 RNF182Q8N6D2 247 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP0.15□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 LRTM2Q8N967 370 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 BANPQ8N9N5 519 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 OR4K1Q8NGD4 311 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP0.15□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 METTL21AQ8WXB1 218 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 ST8SIA4Q92187 359 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 HTRA1Q92743 480 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 CASP10Q92851 521 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 HVCN1Q96D96 273 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP0.15□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 KLHL5Q96PQ7 755 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 NEK1Q96PY6 1258 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 RPS6KC1Q96S38 1066 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 CCT8L2Q96SF2 557 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZMYND12Q9H0C1 365 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 ING2Q9H160 280 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 KCNK15Q9H427 330 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 THYN1Q9P016 225 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 HACL1Q9UJ83 578 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 MTMR6Q9Y217 621 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 WIF1Q9Y5W5 379 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 TNRQ92752 1358 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 ASTN1O14525 1302 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 IGLON5A6NGN9 336 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 LIPT2A6NK58 231 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 SIGLEC5O15389 551 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 TSPAN1O60635 241 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 PRAMEF11O60813 436 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP0.14□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 TOMM70O94826 608 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZWINTO95229 277 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 IGHV2-70P01814 119 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP0.14□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP0.14□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 GABRB1P18505 474 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 FUT3P21217 361 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 TMF1P82094 1093 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 PPFIA1Q13136 1202 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 ABRAXAS2Q15018 415 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 MPPED2Q15777 294 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 PRR4Q16378 134 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 CCDC14Q49A88 953 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP0.14□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 ARMCX4Q5H9R4 360 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP0.14□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 REP15Q6BDI9 236 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 TEX38Q6PEX7 206 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 NCEH1Q6PIU2 408 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 BRD3OSQ6XYD6 125 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 NUP54Q7Z3B4 507 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP0.14□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP0.14□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP0.14□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 RCOR2Q8IZ40 523 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 NDUFAF2Q8N183 169 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 FBXO39Q8N4B4 442 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP0.14□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZNRF1Q8ND25 227 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 OR13F1Q8NGS4 319 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP0.14□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP0.14□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 JAKMIP2Q96AA8 810 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 CCDC136Q96JN2 1154 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP0.14□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 RCHY1Q96PM5 261 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP0.14□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 HSD17B14Q9BPX1 270 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP0.14□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP0.14□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 ISCA1Q9BUE6 129 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 AGXT2Q9BYV1 514 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 GPR88Q9GZN0 384 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 VCXQ9H320 206 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 SP140LQ9H930 580 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 HPS4Q9NQG7 708 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 DPP3Q9NY33 737 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 GGA3Q9NZ52 723 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 PHF11Q9UIL8 331 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 KLHL21Q9UJP4 597 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP0.14□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 PILRBQ9UKJ0 227 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 MGAT4AQ9UM21 535 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-170P-201ENST00000362832 WDR83OSQ9Y284 106 aa0.14□□□□□ -2.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.9 ms