RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332175.12

PTPRM-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 6,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-201ENST00000332175 LEFTY1O75610 366 aa21.68■■□□□ 1.06
PTPRM-201ENST00000332175 RCBTB2O95199 551 aa21.68■■□□□ 1.06
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF806P0C7X5 589 aa21.68■■□□□ 1.06
PTPRM-201ENST00000332175 JMJD7P0C870 316 aa21.68■■□□□ 1.06
PTPRM-201ENST00000332175 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP21.68■■□□□ 1.06
PTPRM-201ENST00000332175 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa21.68■■□□□ 1.06
PTPRM-201ENST00000332175 CD244Q9BZW8 370 aa21.68■■□□□ 1.06
PTPRM-201ENST00000332175 ETV3P41162 512 aa21.68■■□□□ 1.06
PTPRM-201ENST00000332175 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP21.68■■□□□ 1.06
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF461Q8TAF7 563 aa21.68■■□□□ 1.06
PTPRM-201ENST00000332175 PEBP4Q96S96 227 aa21.68■■□□□ 1.06
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PTPRM-201ENST00000332175 SMIM30A4D0T7 59 aa21.68■■□□□ 1.06
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PTPRM-201ENST00000332175 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP21.68■■□□□ 1.06
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PTPRM-201ENST00000332175 SMURF1Q9HCE7 757 aa21.68■■□□□ 1.06
PTPRM-201ENST00000332175 MAFFQ9ULX9 164 aa21.68■■□□□ 1.06
PTPRM-201ENST00000332175 OR2AT4A6NND4 320 aa21.67■■□□□ 1.06
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PTPRM-201ENST00000332175 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP21.67■■□□□ 1.06
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PTPRM-201ENST00000332175 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP21.67■■□□□ 1.06
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PTPRM-201ENST00000332175 STK19P49842 368 aaPredicted RBP21.67■■□□□ 1.06
PTPRM-201ENST00000332175 GALNT2Q10471 571 aa21.67■■□□□ 1.06
PTPRM-201ENST00000332175 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa21.67■■□□□ 1.06
PTPRM-201ENST00000332175 GPAT4Q86UL3 456 aa21.67■■□□□ 1.06
PTPRM-201ENST00000332175 RAB2BQ8WUD1 216 aa21.67■■□□□ 1.06
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PTPRM-201ENST00000332175 SERINC3Q13530 473 aa21.67■■□□□ 1.06
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PTPRM-201ENST00000332175 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
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PTPRM-201ENST00000332175 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP21.67■■□□□ 1.06
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PTPRM-201ENST00000332175 PRAP1Q96NZ9 151 aa21.67■■□□□ 1.06
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PTPRM-201ENST00000332175 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP21.66■■□□□ 1.06
PTPRM-201ENST00000332175 CEP76Q8TAP6 659 aa21.66■■□□□ 1.06
PTPRM-201ENST00000332175 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP21.66■■□□□ 1.06
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PTPRM-201ENST00000332175 PIK3CBP42338 1070 aa21.66■■□□□ 1.06
PTPRM-201ENST00000332175 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa21.66■■□□□ 1.06
PTPRM-201ENST00000332175 SPANXN4Q5MJ08 99 aa21.66■■□□□ 1.06
PTPRM-201ENST00000332175 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa21.66■■□□□ 1.06
PTPRM-201ENST00000332175 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP21.66■■□□□ 1.06
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PTPRM-201ENST00000332175 HSD3B7Q9H2F3 369 aa21.66■■□□□ 1.06
PTPRM-201ENST00000332175 RFC2P35250 354 aa21.66■■□□□ 1.06
PTPRM-201ENST00000332175 RAB8BQ92930 207 aa21.66■■□□□ 1.06
PTPRM-201ENST00000332175 PNPLA2Q96AD5 504 aa21.66■■□□□ 1.06
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PTPRM-201ENST00000332175 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP21.66■■□□□ 1.06
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PTPRM-201ENST00000332175 CLRN1P58418 232 aa21.66■■□□□ 1.06
PTPRM-201ENST00000332175 PYHIN1Q6K0P9 492 aa21.66■■□□□ 1.06
PTPRM-201ENST00000332175 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP21.66■■□□□ 1.06
PTPRM-201ENST00000332175 LRCH3Q96II8 777 aa21.66■■□□□ 1.06
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