RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325599.12

SHQ1-201, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SHQ1, Length 2,879 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-201ENST00000325599 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP15.76■□□□□ 0.11
SHQ1-201ENST00000325599 ARHGDIAP52565 204 aa15.76■□□□□ 0.11
SHQ1-201ENST00000325599 RPS13P62277 151 aaKnown RBP15.76■□□□□ 0.11
SHQ1-201ENST00000325599 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP15.76■□□□□ 0.11
SHQ1-201ENST00000325599 KCNC3Q14003 757 aa15.76■□□□□ 0.11
SHQ1-201ENST00000325599 MOGQ16653 247 aa15.76■□□□□ 0.11
SHQ1-201ENST00000325599 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP15.76■□□□□ 0.11
SHQ1-201ENST00000325599 UTS2BQ765I0 119 aa15.76■□□□□ 0.11
SHQ1-201ENST00000325599 FAR1Q8WVX9 515 aa15.76■□□□□ 0.11
SHQ1-201ENST00000325599 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa15.76■□□□□ 0.11
SHQ1-201ENST00000325599 MOSPD1Q9UJG1 213 aa15.76■□□□□ 0.11
SHQ1-201ENST00000325599 RPS6KA6Q9UK32 745 aa15.76■□□□□ 0.11
SHQ1-201ENST00000325599 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP15.76■□□□□ 0.11
SHQ1-201ENST00000325599 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa15.76■□□□□ 0.11
SHQ1-201ENST00000325599 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa15.76■□□□□ 0.11
SHQ1-201ENST00000325599 SOBPA7XYQ1 873 aa15.76■□□□□ 0.11
SHQ1-201ENST00000325599 SAP18O00422 153 aaKnown RBP15.76■□□□□ 0.11
SHQ1-201ENST00000325599 PRMT3O60678 531 aa15.76■□□□□ 0.11
SHQ1-201ENST00000325599 CLTBP09497 229 aa15.76■□□□□ 0.11
SHQ1-201ENST00000325599 NAT2P11245 290 aa15.76■□□□□ 0.11
SHQ1-201ENST00000325599 CREMQ03060 361 aa15.76■□□□□ 0.11
SHQ1-201ENST00000325599 PLPP4Q5VZY2 271 aa15.76■□□□□ 0.11
SHQ1-201ENST00000325599 ZNF852Q6ZMS4 543 aa15.76■□□□□ 0.11
SHQ1-201ENST00000325599 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP15.76■□□□□ 0.11
SHQ1-201ENST00000325599 TMPRSS11BQ86T26 416 aa15.76■□□□□ 0.11
SHQ1-201ENST00000325599 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP15.76■□□□□ 0.11
SHQ1-201ENST00000325599 NAGSQ8N159 534 aa15.76■□□□□ 0.11
SHQ1-201ENST00000325599 SYNPOQ8N3V7 929 aa15.76■□□□□ 0.11
SHQ1-201ENST00000325599 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP15.76■□□□□ 0.11
SHQ1-201ENST00000325599 OR4K1Q8NGD4 311 aa15.76■□□□□ 0.11
SHQ1-201ENST00000325599 NACC2Q96BF6 587 aa15.76■□□□□ 0.11
SHQ1-201ENST00000325599 RASSF1Q9NS23 344 aa15.76■□□□□ 0.11
SHQ1-201ENST00000325599 IL36AQ9UHA7 158 aa15.76■□□□□ 0.11
SHQ1-201ENST00000325599 GMPPBQ9Y5P6 360 aa15.76■□□□□ 0.11
SHQ1-201ENST00000325599 TNFRSF10AO00220 468 aa15.75■□□□□ 0.11
SHQ1-201ENST00000325599 ATG13O75143 517 aa15.75■□□□□ 0.11
SHQ1-201ENST00000325599 NDUFS2O75306 463 aa15.75■□□□□ 0.11
SHQ1-201ENST00000325599 MYO1DO94832 1006 aa15.75■□□□□ 0.11
SHQ1-201ENST00000325599 CATP04040 527 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
SHQ1-201ENST00000325599 CCDC159P0C7I6 412 aa15.75■□□□□ 0.11
SHQ1-201ENST00000325599 ITIH1P19827 911 aa15.75■□□□□ 0.11
SHQ1-201ENST00000325599 TNFRSF1BP20333 461 aa15.75■□□□□ 0.11
SHQ1-201ENST00000325599 FPR1P21462 350 aa15.75■□□□□ 0.11
SHQ1-201ENST00000325599 IDSP22304 550 aa15.75■□□□□ 0.11
SHQ1-201ENST00000325599 IL18R1Q13478 541 aa15.75■□□□□ 0.11
SHQ1-201ENST00000325599 CTF1Q16619 201 aa15.75■□□□□ 0.11
SHQ1-201ENST00000325599 RGS21Q2M5E4 152 aa15.75■□□□□ 0.11
SHQ1-201ENST00000325599 TRIM16LQ309B1 348 aa15.75■□□□□ 0.11
SHQ1-201ENST00000325599 IQCCQ4KMZ1 466 aa15.75■□□□□ 0.11
SHQ1-201ENST00000325599 IER5LQ5T953 404 aa15.75■□□□□ 0.11
SHQ1-201ENST00000325599 LIPIQ6XZB0 460 aa15.75■□□□□ 0.11
SHQ1-201ENST00000325599 PGBD3Q8N328 593 aa15.75■□□□□ 0.11
SHQ1-201ENST00000325599 ATG16L2Q8NAA4 619 aa15.75■□□□□ 0.11
SHQ1-201ENST00000325599 CHPT1Q8WUD6 406 aa15.75■□□□□ 0.11
SHQ1-201ENST00000325599 CCM2Q9BSQ5 444 aa15.75■□□□□ 0.11
SHQ1-201ENST00000325599 RAD21L1Q9H4I0 556 aa15.75■□□□□ 0.11
SHQ1-201ENST00000325599 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa15.75■□□□□ 0.11
SHQ1-201ENST00000325599 LRRK1Q38SD2 2015 aa15.75■□□□□ 0.11
SHQ1-201ENST00000325599 C1orf226A1L170 272 aa15.75■□□□□ 0.11
SHQ1-201ENST00000325599 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP15.75■□□□□ 0.11
SHQ1-201ENST00000325599 PCDH7O60245 1069 aa15.75■□□□□ 0.11
SHQ1-201ENST00000325599 UGT2B11O75310 529 aa15.75■□□□□ 0.11
SHQ1-201ENST00000325599 GUCY1B2O75343 617 aa15.75■□□□□ 0.11
SHQ1-201ENST00000325599 RHOP08100 348 aa15.75■□□□□ 0.11
SHQ1-201ENST00000325599 ELFN1P0C7U0 828 aa15.75■□□□□ 0.11
SHQ1-201ENST00000325599 HNF4AP41235 474 aa15.75■□□□□ 0.11
SHQ1-201ENST00000325599 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
SHQ1-201ENST00000325599 LSM3P62310 102 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
SHQ1-201ENST00000325599 NPTX1Q15818 432 aa15.75■□□□□ 0.11
SHQ1-201ENST00000325599 ZNF385BQ569K4 471 aa15.75■□□□□ 0.11
SHQ1-201ENST00000325599 ZNF805Q5CZA5 627 aa15.75■□□□□ 0.11
SHQ1-201ENST00000325599 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP15.75■□□□□ 0.11
SHQ1-201ENST00000325599 C11orf74Q86VG3 221 aa15.75■□□□□ 0.11
SHQ1-201ENST00000325599 CHTF18Q8WVB6 975 aa15.75■□□□□ 0.11
SHQ1-201ENST00000325599 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP15.75■□□□□ 0.11
SHQ1-201ENST00000325599 PALMDQ9NP74 551 aa15.75■□□□□ 0.11
SHQ1-201ENST00000325599 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
SHQ1-201ENST00000325599 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa15.75■□□□□ 0.11
SHQ1-201ENST00000325599 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa15.75■□□□□ 0.11
SHQ1-201ENST00000325599 TMEM229AB2RXF0 380 aa15.74■□□□□ 0.11
SHQ1-201ENST00000325599 K7ESM1 405 aa15.74■□□□□ 0.11
SHQ1-201ENST00000325599 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP15.74■□□□□ 0.11
SHQ1-201ENST00000325599 CLPXO76031 633 aa15.74■□□□□ 0.11
SHQ1-201ENST00000325599 ALDH4A1P30038 563 aa15.74■□□□□ 0.11
SHQ1-201ENST00000325599 PRLHRP49683 370 aa15.74■□□□□ 0.11
SHQ1-201ENST00000325599 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP15.74■□□□□ 0.11
SHQ1-201ENST00000325599 MESP2Q0VG99 397 aa15.74■□□□□ 0.11
SHQ1-201ENST00000325599 ERICH5Q6P6B1 374 aa15.74■□□□□ 0.11
SHQ1-201ENST00000325599 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa15.74■□□□□ 0.11
SHQ1-201ENST00000325599 CCDC81Q6ZN84 652 aa15.74■□□□□ 0.11
SHQ1-201ENST00000325599 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP15.74■□□□□ 0.11
SHQ1-201ENST00000325599 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP15.74■□□□□ 0.11
SHQ1-201ENST00000325599 OR56A3Q8NH54 315 aa15.74■□□□□ 0.11
SHQ1-201ENST00000325599 ZNF480Q8WV37 535 aa15.74■□□□□ 0.11
SHQ1-201ENST00000325599 ING5Q8WYH8 240 aa15.74■□□□□ 0.11
SHQ1-201ENST00000325599 GLMNQ92990 594 aa15.74■□□□□ 0.11
SHQ1-201ENST00000325599 TBC1D20Q96BZ9 403 aa15.74■□□□□ 0.11
SHQ1-201ENST00000325599 C7orf34Q96L11 122 aa15.74■□□□□ 0.11
SHQ1-201ENST00000325599 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP15.74■□□□□ 0.11
SHQ1-201ENST00000325599 CHST8Q9H2A9 424 aa15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.4 ms