RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000321337.11

SENP3-201, Transcript of SUMO specific peptidase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SENP3, Length 2,611 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3-201ENST00000321337 ADPRHL2Q9NX46 363 aa24.35■■□□□ 1.49
SENP3-201ENST00000321337 FAM8A1Q9UBU6 413 aa24.35■■□□□ 1.49
SENP3-201ENST00000321337 DUSP12Q9UNI6 340 aa24.35■■□□□ 1.49
SENP3-201ENST00000321337 C1orf226A1L170 272 aa24.35■■□□□ 1.49
SENP3-201ENST00000321337 ARHGAP33O14559 1287 aa24.35■■□□□ 1.49
SENP3-201ENST00000321337 PCDH17O14917 1159 aa24.35■■□□□ 1.49
SENP3-201ENST00000321337 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
SENP3-201ENST00000321337 OR8J2Q8NGG1 315 aa24.35■■□□□ 1.49
SENP3-201ENST00000321337 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa24.35■■□□□ 1.49
SENP3-201ENST00000321337 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
SENP3-201ENST00000321337 CWH43Q9H720 699 aa24.35■■□□□ 1.49
SENP3-201ENST00000321337 PLSCR3Q9NRY6 295 aa24.35■■□□□ 1.49
SENP3-201ENST00000321337 MKLN1Q9UL63 735 aa24.35■■□□□ 1.49
SENP3-201ENST00000321337 OR51B4Q9Y5P0 310 aa24.35■■□□□ 1.49
SENP3-201ENST00000321337 SPAM1P38567 509 aa24.34■■□□□ 1.49
SENP3-201ENST00000321337 DEFA1P59665 94 aa24.34■■□□□ 1.49
SENP3-201ENST00000321337 DEFA3P59666 94 aa24.34■■□□□ 1.49
SENP3-201ENST00000321337 HKDC1Q2TB90 917 aa24.34■■□□□ 1.49
SENP3-201ENST00000321337 FAM217AQ8IXS0 508 aa24.34■■□□□ 1.49
SENP3-201ENST00000321337 MGLLQ99685 303 aa24.34■■□□□ 1.49
SENP3-201ENST00000321337 MTX2O75431 263 aa24.34■■□□□ 1.49
SENP3-201ENST00000321337 APOA1P02647 267 aa24.34■■□□□ 1.49
SENP3-201ENST00000321337 ETFAP13804 333 aa24.34■■□□□ 1.49
SENP3-201ENST00000321337 RFX2P48378 723 aa24.34■■□□□ 1.49
SENP3-201ENST00000321337 DMC1Q14565 340 aa24.34■■□□□ 1.49
SENP3-201ENST00000321337 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
SENP3-201ENST00000321337 LRRC73Q5JTD7 316 aa24.34■■□□□ 1.49
SENP3-201ENST00000321337 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa24.34■■□□□ 1.49
SENP3-201ENST00000321337 FOXJ1Q92949 421 aa24.34■■□□□ 1.49
SENP3-201ENST00000321337 TTLL2Q9BWV7 592 aa24.34■■□□□ 1.49
SENP3-201ENST00000321337 BARHL1Q9BZE3 327 aa24.34■■□□□ 1.49
SENP3-201ENST00000321337 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
SENP3-201ENST00000321337 SCN8AQ9UQD0 1980 aa24.34■■□□□ 1.49
SENP3-201ENST00000321337 ETV6P41212 452 aa24.33■■□□□ 1.49
SENP3-201ENST00000321337 SELENOWP63302 87 aa24.33■■□□□ 1.49
SENP3-201ENST00000321337 SMARCB1Q12824 385 aa24.33■■□□□ 1.49
SENP3-201ENST00000321337 BBS7Q8IWZ6 715 aa24.33■■□□□ 1.49
SENP3-201ENST00000321337 FAM9CQ8IZT9 166 aa24.33■■□□□ 1.49
SENP3-201ENST00000321337 ST6GAL2Q96JF0 529 aa24.33■■□□□ 1.49
SENP3-201ENST00000321337 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
SENP3-201ENST00000321337 CNPPD1Q9BV87 410 aa24.33■■□□□ 1.49
SENP3-201ENST00000321337 SLC12A9Q9BXP2 914 aa24.33■■□□□ 1.49
SENP3-201ENST00000321337 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
SENP3-201ENST00000321337 FAM227AF5H4B4 570 aa24.33■■□□□ 1.49
SENP3-201ENST00000321337 BCL2L1Q07817 233 aa24.33■■□□□ 1.49
SENP3-201ENST00000321337 ABRQ12979 859 aa24.33■■□□□ 1.49
SENP3-201ENST00000321337 FBXO43Q4G163 708 aa24.33■■□□□ 1.49
SENP3-201ENST00000321337 TPGS1Q6ZTW0 290 aa24.33■■□□□ 1.49
SENP3-201ENST00000321337 FCRL1Q96LA6 429 aa24.33■■□□□ 1.49
SENP3-201ENST00000321337 SLC30A2Q9BRI3 323 aa24.33■■□□□ 1.49
SENP3-201ENST00000321337 IMPAD1Q9NX62 359 aa24.33■■□□□ 1.49
SENP3-201ENST00000321337 RHCGQ9UBD6 479 aa24.33■■□□□ 1.49
SENP3-201ENST00000321337 EOMESO95936 686 aa24.32■■□□□ 1.48
SENP3-201ENST00000321337 CYBAP13498 195 aa24.32■■□□□ 1.48
SENP3-201ENST00000321337 CRATP43155 626 aa24.32■■□□□ 1.48
SENP3-201ENST00000321337 PXNP49023 591 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
SENP3-201ENST00000321337 SLC11A1P49279 550 aa24.32■■□□□ 1.48
SENP3-201ENST00000321337 PFN3P60673 137 aa24.32■■□□□ 1.48
SENP3-201ENST00000321337 RAE1P78406 368 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
SENP3-201ENST00000321337 BAK1Q16611 211 aa24.32■■□□□ 1.48
SENP3-201ENST00000321337 ASB11Q8WXH4 323 aa24.32■■□□□ 1.48
SENP3-201ENST00000321337 CEP19Q96LK0 163 aa24.32■■□□□ 1.48
SENP3-201ENST00000321337 DNAJC11Q9NVH1 559 aa24.32■■□□□ 1.48
SENP3-201ENST00000321337 TBC1D14Q9P2M4 693 aa24.32■■□□□ 1.48
SENP3-201ENST00000321337 RGS5O15539 181 aa24.32■■□□□ 1.48
SENP3-201ENST00000321337 DPM1O60762 260 aa24.32■■□□□ 1.48
SENP3-201ENST00000321337 GANABQ14697 944 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
SENP3-201ENST00000321337 MICAQ29983 383 aa24.32■■□□□ 1.48
SENP3-201ENST00000321337 SLX4IPQ5VYV7 408 aa24.32■■□□□ 1.48
SENP3-201ENST00000321337 GPR151Q8TDV0 419 aa24.32■■□□□ 1.48
SENP3-201ENST00000321337 C17orf50Q8WW18 174 aa24.32■■□□□ 1.48
SENP3-201ENST00000321337 ALG14Q96F25 216 aa24.32■■□□□ 1.48
SENP3-201ENST00000321337 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
SENP3-201ENST00000321337 TTYH2Q9BSA4 534 aa24.32■■□□□ 1.48
SENP3-201ENST00000321337 VPS29Q9UBQ0 182 aa24.32■■□□□ 1.48
SENP3-201ENST00000321337 KLK4Q9Y5K2 254 aa24.32■■□□□ 1.48
SENP3-201ENST00000321337 SNX4O95219 450 aa24.31■■□□□ 1.48
SENP3-201ENST00000321337 JUPP14923 745 aa24.31■■□□□ 1.48
SENP3-201ENST00000321337 RPS19P39019 145 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
SENP3-201ENST00000321337 SOX3P41225 446 aa24.31■■□□□ 1.48
SENP3-201ENST00000321337 NSG1P42857 185 aa24.31■■□□□ 1.48
SENP3-201ENST00000321337 GPR50Q13585 617 aa24.31■■□□□ 1.48
SENP3-201ENST00000321337 FUT10Q6P4F1 479 aa24.31■■□□□ 1.48
SENP3-201ENST00000321337 GPR156Q8NFN8 814 aa24.31■■□□□ 1.48
SENP3-201ENST00000321337 OR4K1Q8NGD4 311 aa24.31■■□□□ 1.48
SENP3-201ENST00000321337 PLD4Q96BZ4 506 aa24.31■■□□□ 1.48
SENP3-201ENST00000321337 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
SENP3-201ENST00000321337 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
SENP3-201ENST00000321337 ACSL6Q9UKU0 697 aa24.31■■□□□ 1.48
SENP3-201ENST00000321337 E7EQ34 232 aa24.31■■□□□ 1.48
SENP3-201ENST00000321337 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
SENP3-201ENST00000321337 CA12O43570 354 aa24.31■■□□□ 1.48
SENP3-201ENST00000321337 BNIP3LO60238 219 aa24.31■■□□□ 1.48
SENP3-201ENST00000321337 ADAMTS4O75173 837 aa24.31■■□□□ 1.48
SENP3-201ENST00000321337 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
SENP3-201ENST00000321337 CKMT1AP12532 417 aa24.31■■□□□ 1.48
SENP3-201ENST00000321337 HIST1H2ADP20671 130 aa24.31■■□□□ 1.48
SENP3-201ENST00000321337 SOX6P35712 828 aa24.31■■□□□ 1.48
SENP3-201ENST00000321337 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
SENP3-201ENST00000321337 TAB1Q15750 504 aa24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.3 ms