RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317243.9

ZNF554-201, Transcript of zinc finger protein 554, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZNF554, Length 2,736 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF554-201ENST00000317243 MVKQ03426 396 aa18.73■□□□□ 0.59
ZNF554-201ENST00000317243 LRRC26Q2I0M4 334 aa18.73■□□□□ 0.59
ZNF554-201ENST00000317243 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
ZNF554-201ENST00000317243 CACHD1Q5VU97 1274 aa18.73■□□□□ 0.59
ZNF554-201ENST00000317243 CERS6Q6ZMG9 384 aa18.73■□□□□ 0.59
ZNF554-201ENST00000317243 HTR3DQ70Z44 454 aa18.73■□□□□ 0.59
ZNF554-201ENST00000317243 CHPFQ8IZ52 775 aa18.73■□□□□ 0.59
ZNF554-201ENST00000317243 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP18.73■□□□□ 0.59
ZNF554-201ENST00000317243 INPP5KQ9BT40 448 aa18.73■□□□□ 0.59
ZNF554-201ENST00000317243 TMEM45AQ9NWC5 275 aa18.73■□□□□ 0.59
ZNF554-201ENST00000317243 B4GALT6Q9UBX8 382 aa18.73■□□□□ 0.59
ZNF554-201ENST00000317243 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa18.72■□□□□ 0.59
ZNF554-201ENST00000317243 TMEM202A6NGA9 273 aa18.72■□□□□ 0.59
ZNF554-201ENST00000317243 M0R082 166 aa18.72■□□□□ 0.59
ZNF554-201ENST00000317243 ULK1O75385 1050 aa18.72■□□□□ 0.59
ZNF554-201ENST00000317243 ERVFC1P60507 584 aa18.72■□□□□ 0.59
ZNF554-201ENST00000317243 ZNF697Q5TEC3 545 aa18.72■□□□□ 0.59
ZNF554-201ENST00000317243 TMEM215Q68D42 235 aa18.72■□□□□ 0.59
ZNF554-201ENST00000317243 C22orf39Q6P5X5 142 aa18.72■□□□□ 0.59
ZNF554-201ENST00000317243 ZNF438Q7Z4V0 828 aa18.72■□□□□ 0.59
ZNF554-201ENST00000317243 TCAIMQ8N3R3 496 aa18.72■□□□□ 0.59
ZNF554-201ENST00000317243 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP18.72■□□□□ 0.59
ZNF554-201ENST00000317243 ANKK1Q8NFD2 765 aa18.72■□□□□ 0.59
ZNF554-201ENST00000317243 FIBINQ8TAL6 211 aa18.72■□□□□ 0.59
ZNF554-201ENST00000317243 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP18.72■□□□□ 0.59
ZNF554-201ENST00000317243 C1orf109Q9NX04 203 aa18.72■□□□□ 0.59
ZNF554-201ENST00000317243 NPAP1Q9NZP6 1156 aa18.72■□□□□ 0.59
ZNF554-201ENST00000317243 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa18.72■□□□□ 0.59
ZNF554-201ENST00000317243 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP18.72■□□□□ 0.59
ZNF554-201ENST00000317243 PTPRSQ13332 1948 aa18.72■□□□□ 0.59
ZNF554-201ENST00000317243 PRAMEF4O60810 478 aa18.72■□□□□ 0.59
ZNF554-201ENST00000317243 GLUD1P00367 558 aa18.72■□□□□ 0.59
ZNF554-201ENST00000317243 IL6P05231 212 aa18.72■□□□□ 0.59
ZNF554-201ENST00000317243 C1SP09871 688 aa18.72■□□□□ 0.59
ZNF554-201ENST00000317243 DGKAP23743 735 aa18.72■□□□□ 0.59
ZNF554-201ENST00000317243 CTSKP43235 329 aa18.72■□□□□ 0.59
ZNF554-201ENST00000317243 GNPDA1P46926 289 aa18.72■□□□□ 0.59
ZNF554-201ENST00000317243 RGS4P49798 205 aa18.72■□□□□ 0.59
ZNF554-201ENST00000317243 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP18.72■□□□□ 0.59
ZNF554-201ENST00000317243 SPANXN2Q5MJ10 180 aa18.72■□□□□ 0.59
ZNF554-201ENST00000317243 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa18.72■□□□□ 0.59
ZNF554-201ENST00000317243 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP18.72■□□□□ 0.59
ZNF554-201ENST00000317243 OR8H2Q8N162 312 aa18.72■□□□□ 0.59
ZNF554-201ENST00000317243 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP18.72■□□□□ 0.59
ZNF554-201ENST00000317243 AMBNQ9NP70 447 aa18.72■□□□□ 0.59
ZNF554-201ENST00000317243 BTBD3Q9Y2F9 522 aa18.72■□□□□ 0.59
ZNF554-201ENST00000317243 LRATO95237 230 aa18.71■□□□□ 0.59
ZNF554-201ENST00000317243 CXCL14O95715 111 aa18.71■□□□□ 0.59
ZNF554-201ENST00000317243 RETP07949 1114 aa18.71■□□□□ 0.59
ZNF554-201ENST00000317243 ITPKAP23677 461 aa18.71■□□□□ 0.59
ZNF554-201ENST00000317243 PPP3CCP48454 512 aa18.71■□□□□ 0.59
ZNF554-201ENST00000317243 CXCR4P61073 352 aa18.71■□□□□ 0.59
ZNF554-201ENST00000317243 MPPE1Q53F39 396 aa18.71■□□□□ 0.59
ZNF554-201ENST00000317243 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP18.71■□□□□ 0.59
ZNF554-201ENST00000317243 BEX2Q9BXY8 128 aa18.71■□□□□ 0.59
ZNF554-201ENST00000317243 ATG10Q9H0Y0 220 aa18.71■□□□□ 0.59
ZNF554-201ENST00000317243 OR51E2Q9H255 320 aa18.71■□□□□ 0.59
ZNF554-201ENST00000317243 SUV39H2Q9H5I1 410 aa18.71■□□□□ 0.59
ZNF554-201ENST00000317243 LRTM1Q9HBL6 345 aa18.71■□□□□ 0.59
ZNF554-201ENST00000317243 ARL15Q9NXU5 204 aa18.71■□□□□ 0.59
ZNF554-201ENST00000317243 H3BQ06 376 aaPredicted RBP18.71■□□□□ 0.59
ZNF554-201ENST00000317243 TFECO14948 347 aaPredicted RBP18.71■□□□□ 0.59
ZNF554-201ENST00000317243 TACR1P25103 407 aa18.71■□□□□ 0.59
ZNF554-201ENST00000317243 SLC15A1P46059 708 aa18.71■□□□□ 0.59
ZNF554-201ENST00000317243 ARHGDIAP52565 204 aa18.71■□□□□ 0.59
ZNF554-201ENST00000317243 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP18.71■□□□□ 0.59
ZNF554-201ENST00000317243 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP18.71■□□□□ 0.59
ZNF554-201ENST00000317243 SPERTQ8NA61 448 aa18.71■□□□□ 0.59
ZNF554-201ENST00000317243 LMLNQ96KR4 655 aa18.71■□□□□ 0.59
ZNF554-201ENST00000317243 BRD9Q9H8M2 597 aa18.71■□□□□ 0.59
ZNF554-201ENST00000317243 TM9SF3Q9HD45 589 aa18.71■□□□□ 0.59
ZNF554-201ENST00000317243 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP18.71■□□□□ 0.59
ZNF554-201ENST00000317243 TBC1D24Q9ULP9 559 aa18.71■□□□□ 0.59
ZNF554-201ENST00000317243 OR2AG2A6NM03 316 aa18.7■□□□□ 0.58
ZNF554-201ENST00000317243 CYP7B1O75881 506 aa18.7■□□□□ 0.58
ZNF554-201ENST00000317243 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP18.7■□□□□ 0.58
ZNF554-201ENST00000317243 NRIP1P48552 1158 aa18.7■□□□□ 0.58
ZNF554-201ENST00000317243 RPIAP49247 311 aa18.7■□□□□ 0.58
ZNF554-201ENST00000317243 TEAD2Q15562 447 aa18.7■□□□□ 0.58
ZNF554-201ENST00000317243 TIGD6Q17RP2 521 aa18.7■□□□□ 0.58
ZNF554-201ENST00000317243 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP18.7■□□□□ 0.58
ZNF554-201ENST00000317243 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP18.7■□□□□ 0.58
ZNF554-201ENST00000317243 RASSF5Q8WWW0 418 aa18.7■□□□□ 0.58
ZNF554-201ENST00000317243 ULK4Q96C45 1275 aa18.7■□□□□ 0.58
ZNF554-201ENST00000317243 SCRN2Q96FV2 425 aa18.7■□□□□ 0.58
ZNF554-201ENST00000317243 TSSK3Q96PN8 268 aa18.7■□□□□ 0.58
ZNF554-201ENST00000317243 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP18.7■□□□□ 0.58
ZNF554-201ENST00000317243 PHOX2BQ99453 314 aa18.7■□□□□ 0.58
ZNF554-201ENST00000317243 APOL4Q9BPW4 351 aa18.7■□□□□ 0.58
ZNF554-201ENST00000317243 ZBP1Q9H171 429 aa18.7■□□□□ 0.58
ZNF554-201ENST00000317243 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa18.7■□□□□ 0.58
ZNF554-201ENST00000317243 KIF17Q9P2E2 1029 aa18.7■□□□□ 0.58
ZNF554-201ENST00000317243 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa18.7■□□□□ 0.58
ZNF554-201ENST00000317243 LAG3P18627 525 aa18.7■□□□□ 0.58
ZNF554-201ENST00000317243 PRKACBP22694 351 aa18.7■□□□□ 0.58
ZNF554-201ENST00000317243 DDOSTP39656 456 aa18.7■□□□□ 0.58
ZNF554-201ENST00000317243 CDKN2CP42773 168 aa18.7■□□□□ 0.58
ZNF554-201ENST00000317243 MESP2Q0VG99 397 aa18.7■□□□□ 0.58
ZNF554-201ENST00000317243 NATD1Q8N6N6 113 aa18.7■□□□□ 0.58
ZNF554-201ENST00000317243 ATG16L2Q8NAA4 619 aa18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.4 ms