RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000297267.13

FNDC1-201, Transcript of fibronectin type III domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene FNDC1, Length 6,552 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC1-201ENST00000297267 TTC9BQ8N6N2 239 aa14.96□□□□□ -0.01
FNDC1-201ENST00000297267 LRCH3Q96II8 777 aa14.96□□□□□ -0.01
FNDC1-201ENST00000297267 ALPK1Q96QP1 1244 aa14.96□□□□□ -0.01
FNDC1-201ENST00000297267 MNTQ99583 582 aa14.96□□□□□ -0.01
FNDC1-201ENST00000297267 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
FNDC1-201ENST00000297267 PHLPP1O60346 1717 aa14.96□□□□□ -0.01
FNDC1-201ENST00000297267 A0A1W2PPW3 197 aa14.96□□□□□ -0.01
FNDC1-201ENST00000297267 DFNA5O60443 496 aa14.96□□□□□ -0.01
FNDC1-201ENST00000297267 PLGP00747 810 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
FNDC1-201ENST00000297267 CCKBRP32239 447 aa14.96□□□□□ -0.01
FNDC1-201ENST00000297267 HNF1BP35680 557 aa14.96□□□□□ -0.01
FNDC1-201ENST00000297267 BNC1Q01954 994 aa14.96□□□□□ -0.01
FNDC1-201ENST00000297267 NOGQ13253 232 aa14.96□□□□□ -0.01
FNDC1-201ENST00000297267 FBXO27Q8NI29 283 aa14.96□□□□□ -0.01
FNDC1-201ENST00000297267 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
FNDC1-201ENST00000297267 TRIM2Q9C040 744 aa14.96□□□□□ -0.01
FNDC1-201ENST00000297267 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
FNDC1-201ENST00000297267 CMAHPQ9Y471 501 aa14.96□□□□□ -0.01
FNDC1-201ENST00000297267 GLTPD2A6NH11 291 aa14.96□□□□□ -0.01
FNDC1-201ENST00000297267 RTCAO00442 366 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
FNDC1-201ENST00000297267 RENP00797 406 aa14.96□□□□□ -0.01
FNDC1-201ENST00000297267 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
FNDC1-201ENST00000297267 ABCA11PQ4W5N1 156 aa14.96□□□□□ -0.01
FNDC1-201ENST00000297267 C1orf189Q5VU69 101 aa14.96□□□□□ -0.01
FNDC1-201ENST00000297267 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
FNDC1-201ENST00000297267 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
FNDC1-201ENST00000297267 GALNT7Q86SF2 657 aa14.96□□□□□ -0.01
FNDC1-201ENST00000297267 TMC8Q8IU68 726 aa14.96□□□□□ -0.01
FNDC1-201ENST00000297267 ASB9Q96DX5 294 aa14.96□□□□□ -0.01
FNDC1-201ENST00000297267 ITPAQ9BY32 194 aa14.96□□□□□ -0.01
FNDC1-201ENST00000297267 TREM1Q9NP99 234 aa14.96□□□□□ -0.01
FNDC1-201ENST00000297267 STARD5Q9NSY2 213 aa14.96□□□□□ -0.01
FNDC1-201ENST00000297267 MOCS1Q9NZB8 636 aa14.96□□□□□ -0.01
FNDC1-201ENST00000297267 BAIAP2Q9UQB8 552 aa14.96□□□□□ -0.01
FNDC1-201ENST00000297267 KRBA1A5PL33 1030 aa14.96□□□□□ -0.01
FNDC1-201ENST00000297267 WASH3PC4AMC7 463 aa14.96□□□□□ -0.01
FNDC1-201ENST00000297267 COCHO43405 550 aa14.96□□□□□ -0.01
FNDC1-201ENST00000297267 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
FNDC1-201ENST00000297267 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
FNDC1-201ENST00000297267 RFKQ969G6 155 aa14.96□□□□□ -0.01
FNDC1-201ENST00000297267 TRPV4Q9HBA0 871 aa14.96□□□□□ -0.01
FNDC1-201ENST00000297267 M0R036 132 aa14.96□□□□□ -0.02
FNDC1-201ENST00000297267 CRISP3P54108 245 aa14.96□□□□□ -0.02
FNDC1-201ENST00000297267 ACTR3P61158 418 aa14.96□□□□□ -0.02
FNDC1-201ENST00000297267 OR4D1Q15615 310 aa14.96□□□□□ -0.02
FNDC1-201ENST00000297267 FRG2Q64ET8 278 aa14.96□□□□□ -0.02
FNDC1-201ENST00000297267 BICRALQ6AI39 1079 aa14.96□□□□□ -0.02
FNDC1-201ENST00000297267 ABHD13Q7L211 337 aa14.96□□□□□ -0.02
FNDC1-201ENST00000297267 TICAM1Q8IUC6 712 aa14.96□□□□□ -0.02
FNDC1-201ENST00000297267 RNF175Q8N4F7 328 aa14.96□□□□□ -0.02
FNDC1-201ENST00000297267 WDTC1Q8N5D0 677 aa14.96□□□□□ -0.02
FNDC1-201ENST00000297267 FRG2BQ96QU4 278 aa14.96□□□□□ -0.02
FNDC1-201ENST00000297267 P2RX2Q9UBL9 471 aa14.96□□□□□ -0.02
FNDC1-201ENST00000297267 SLC7A4O43246 635 aa14.95□□□□□ -0.02
FNDC1-201ENST00000297267 ITGB8P26012 769 aa14.95□□□□□ -0.02
FNDC1-201ENST00000297267 ACVR1BP36896 505 aa14.95□□□□□ -0.02
FNDC1-201ENST00000297267 SCNN1AP37088 669 aa14.95□□□□□ -0.02
FNDC1-201ENST00000297267 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
FNDC1-201ENST00000297267 RIN1Q13671 783 aa14.95□□□□□ -0.02
FNDC1-201ENST00000297267 ARFRP1Q13795 201 aa14.95□□□□□ -0.02
FNDC1-201ENST00000297267 SYVN1Q86TM6 617 aa14.95□□□□□ -0.02
FNDC1-201ENST00000297267 SLC22A17Q8WUG5 538 aa14.95□□□□□ -0.02
FNDC1-201ENST00000297267 RGMAQ96B86 450 aa14.95□□□□□ -0.02
FNDC1-201ENST00000297267 MUS81Q96NY9 551 aa14.95□□□□□ -0.02
FNDC1-201ENST00000297267 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa14.95□□□□□ -0.02
FNDC1-201ENST00000297267 SLC6A15Q9H2J7 730 aa14.95□□□□□ -0.02
FNDC1-201ENST00000297267 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
FNDC1-201ENST00000297267 GPR52Q9Y2T5 361 aa14.95□□□□□ -0.02
FNDC1-201ENST00000297267 LEFTY2O00292 366 aa14.95□□□□□ -0.02
FNDC1-201ENST00000297267 KCNJ5P48544 419 aa14.95□□□□□ -0.02
FNDC1-201ENST00000297267 INHBEP58166 350 aa14.95□□□□□ -0.02
FNDC1-201ENST00000297267 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP14.95□□□□□ -0.02
FNDC1-201ENST00000297267 BTBD16Q32M84 506 aa14.95□□□□□ -0.02
FNDC1-201ENST00000297267 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
FNDC1-201ENST00000297267 SIAH1Q8IUQ4 282 aa14.95□□□□□ -0.02
FNDC1-201ENST00000297267 NIPA2Q8N8Q9 360 aa14.95□□□□□ -0.02
FNDC1-201ENST00000297267 OR5T2Q8NGG2 359 aa14.95□□□□□ -0.02
FNDC1-201ENST00000297267 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
FNDC1-201ENST00000297267 ELOVL2Q9NXB9 296 aa14.95□□□□□ -0.02
FNDC1-201ENST00000297267 OR1A2Q9Y585 309 aa14.95□□□□□ -0.02
FNDC1-201ENST00000297267 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
FNDC1-201ENST00000297267 FOXN4Q96NZ1 517 aa14.95□□□□□ -0.02
FNDC1-201ENST00000297267 SMIM14Q96QK8 99 aa14.95□□□□□ -0.02
FNDC1-201ENST00000297267 CLCC1Q96S66 551 aa14.95□□□□□ -0.02
FNDC1-201ENST00000297267 CCDC106Q9BWC9 280 aa14.95□□□□□ -0.02
FNDC1-201ENST00000297267 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa14.95□□□□□ -0.02
FNDC1-201ENST00000297267 NUP50Q9UKX7 468 aa14.95□□□□□ -0.02
FNDC1-201ENST00000297267 PTPRRQ15256 657 aa14.95□□□□□ -0.02
FNDC1-201ENST00000297267 ADAM7Q9H2U9 754 aa14.95□□□□□ -0.02
FNDC1-201ENST00000297267 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa14.95□□□□□ -0.02
FNDC1-201ENST00000297267 VAMP1P23763 118 aa14.95□□□□□ -0.02
FNDC1-201ENST00000297267 RAB39AQ14964 217 aa14.95□□□□□ -0.02
FNDC1-201ENST00000297267 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
FNDC1-201ENST00000297267 TMEM151AQ8N4L1 468 aa14.95□□□□□ -0.02
FNDC1-201ENST00000297267 ZNF639Q9UID6 485 aa14.95□□□□□ -0.02
FNDC1-201ENST00000297267 SARDHQ9UL12 918 aa14.95□□□□□ -0.02
FNDC1-201ENST00000297267 MON2Q7Z3U7 1717 aa14.95□□□□□ -0.02
FNDC1-201ENST00000297267 SDC3O75056 442 aa14.95□□□□□ -0.02
FNDC1-201ENST00000297267 HCKP08631 526 aa14.95□□□□□ -0.02
FNDC1-201ENST00000297267 MAGEA12P43365 314 aa14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.3 ms