RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000285679.10

USP25-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 25, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP25, Length 3,973 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25-201ENST00000285679 BHLHA9Q7RTU4 235 aa14.78□□□□□ -0.04
USP25-201ENST00000285679 TMPRSS11BQ86T26 416 aa14.78□□□□□ -0.04
USP25-201ENST00000285679 POF1BQ8WVV4 589 aa14.78□□□□□ -0.04
USP25-201ENST00000285679 CDADC1Q9BWV3 514 aa14.78□□□□□ -0.04
USP25-201ENST00000285679 SLC32A1Q9H598 525 aa14.78□□□□□ -0.04
USP25-201ENST00000285679 MAGIXQ9H6Y5 334 aa14.78□□□□□ -0.04
USP25-201ENST00000285679 RLIMQ9NVW2 624 aa14.78□□□□□ -0.04
USP25-201ENST00000285679 MIA3Q5JRA6 1907 aa14.78□□□□□ -0.04
USP25-201ENST00000285679 SERPINI2O75830 405 aa14.78□□□□□ -0.04
USP25-201ENST00000285679 EBLN1P0CF75 366 aa14.78□□□□□ -0.04
USP25-201ENST00000285679 MAPKAPK2P49137 400 aa14.78□□□□□ -0.04
USP25-201ENST00000285679 TCEANCQ8N8B7 351 aa14.78□□□□□ -0.04
USP25-201ENST00000285679 GPR150Q8NGU9 434 aa14.78□□□□□ -0.04
USP25-201ENST00000285679 CEP295NLQ96MC4 621 aa14.78□□□□□ -0.04
USP25-201ENST00000285679 PSKH2Q96QS6 385 aa14.78□□□□□ -0.04
USP25-201ENST00000285679 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa14.78□□□□□ -0.04
USP25-201ENST00000285679 DNAJC11Q9NVH1 559 aa14.78□□□□□ -0.04
USP25-201ENST00000285679 ELOVL2Q9NXB9 296 aa14.78□□□□□ -0.04
USP25-201ENST00000285679 MAT2BQ9NZL9 334 aa14.78□□□□□ -0.04
USP25-201ENST00000285679 PRSS21Q9Y6M0 314 aa14.78□□□□□ -0.04
USP25-201ENST00000285679 CLDN24A6NM45 220 aa14.77□□□□□ -0.04
USP25-201ENST00000285679 FADS2P1A8MWK0 482 aa14.77□□□□□ -0.04
USP25-201ENST00000285679 PRPS1L1P21108 318 aa14.77□□□□□ -0.04
USP25-201ENST00000285679 CAV3P56539 151 aa14.77□□□□□ -0.04
USP25-201ENST00000285679 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP14.77□□□□□ -0.04
USP25-201ENST00000285679 GPR162Q16538 588 aa14.77□□□□□ -0.04
USP25-201ENST00000285679 LEXMQ3ZCV2 418 aa14.77□□□□□ -0.04
USP25-201ENST00000285679 LRRC66Q68CR7 880 aa14.77□□□□□ -0.04
USP25-201ENST00000285679 C1orf74Q96LT6 269 aa14.77□□□□□ -0.04
USP25-201ENST00000285679 WACQ9BTA9 647 aa14.77□□□□□ -0.04
USP25-201ENST00000285679 CLMPQ9H6B4 373 aa14.77□□□□□ -0.04
USP25-201ENST00000285679 SIRT5Q9NXA8 310 aa14.77□□□□□ -0.04
USP25-201ENST00000285679 NLKQ9UBE8 527 aa14.77□□□□□ -0.04
USP25-201ENST00000285679 MGAMO43451 1857 aa14.77□□□□□ -0.04
USP25-201ENST00000285679 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.04
USP25-201ENST00000285679 CLDN8P56748 225 aa14.77□□□□□ -0.04
USP25-201ENST00000285679 FCHO2Q0JRZ9 810 aa14.77□□□□□ -0.04
USP25-201ENST00000285679 SNAPC1Q16533 368 aa14.77□□□□□ -0.04
USP25-201ENST00000285679 WSCD2Q2TBF2 565 aa14.77□□□□□ -0.04
USP25-201ENST00000285679 NADSYN1Q6IA69 706 aa14.77□□□□□ -0.04
USP25-201ENST00000285679 CERS6Q6ZMG9 384 aa14.77□□□□□ -0.04
USP25-201ENST00000285679 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.04
USP25-201ENST00000285679 MSRB3Q8IXL7 192 aa14.77□□□□□ -0.04
USP25-201ENST00000285679 NAGSQ8N159 534 aa14.77□□□□□ -0.04
USP25-201ENST00000285679 PJA1Q8NG27 643 aa14.77□□□□□ -0.04
USP25-201ENST00000285679 COQ8BQ96D53 544 aa14.77□□□□□ -0.04
USP25-201ENST00000285679 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.04
USP25-201ENST00000285679 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.04
USP25-201ENST00000285679 FLRT1Q9NZU1 646 aa14.77□□□□□ -0.04
USP25-201ENST00000285679 I3L521 148 aa14.77□□□□□ -0.05
USP25-201ENST00000285679 TSPAN4O14817 238 aa14.77□□□□□ -0.05
USP25-201ENST00000285679 PRAMEF12O95522 483 aa14.77□□□□□ -0.05
USP25-201ENST00000285679 CRYZL1O95825 349 aa14.77□□□□□ -0.05
USP25-201ENST00000285679 IL7P13232 177 aa14.77□□□□□ -0.05
USP25-201ENST00000285679 ANXA8P13928 327 aa14.77□□□□□ -0.05
USP25-201ENST00000285679 ACPPP15309 386 aa14.77□□□□□ -0.05
USP25-201ENST00000285679 CNR2P34972 360 aa14.77□□□□□ -0.05
USP25-201ENST00000285679 GPC1P35052 558 aa14.77□□□□□ -0.05
USP25-201ENST00000285679 LAIR1Q6GTX8 287 aa14.77□□□□□ -0.05
USP25-201ENST00000285679 OR7G1Q8NGA0 311 aa14.77□□□□□ -0.05
USP25-201ENST00000285679 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa14.77□□□□□ -0.05
USP25-201ENST00000285679 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
USP25-201ENST00000285679 GJB5O95377 273 aa14.76□□□□□ -0.05
USP25-201ENST00000285679 CKMP06732 381 aa14.76□□□□□ -0.05
USP25-201ENST00000285679 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
USP25-201ENST00000285679 UQCRC1P31930 480 aa14.76□□□□□ -0.05
USP25-201ENST00000285679 CSRP3P50461 194 aa14.76□□□□□ -0.05
USP25-201ENST00000285679 UGT8Q16880 541 aa14.76□□□□□ -0.05
USP25-201ENST00000285679 LAIR2Q6ISS4 152 aa14.76□□□□□ -0.05
USP25-201ENST00000285679 MZT2BQ6NZ67 158 aa14.76□□□□□ -0.05
USP25-201ENST00000285679 SBSNQ6UWP8 590 aa14.76□□□□□ -0.05
USP25-201ENST00000285679 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa14.76□□□□□ -0.05
USP25-201ENST00000285679 C16orf62Q7Z3J2 963 aa14.76□□□□□ -0.05
USP25-201ENST00000285679 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
USP25-201ENST00000285679 ARMC5Q96C12 935 aa14.76□□□□□ -0.05
USP25-201ENST00000285679 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa14.76□□□□□ -0.05
USP25-201ENST00000285679 BRD9Q9H8M2 597 aa14.76□□□□□ -0.05
USP25-201ENST00000285679 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa14.76□□□□□ -0.05
USP25-201ENST00000285679 A0A0G2JN53 185 aa14.76□□□□□ -0.05
USP25-201ENST00000285679 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
USP25-201ENST00000285679 IFNA14P01570 189 aa14.76□□□□□ -0.05
USP25-201ENST00000285679 CDK1P06493 297 aa14.76□□□□□ -0.05
USP25-201ENST00000285679 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
USP25-201ENST00000285679 CSNK2BP67870 215 aa14.76□□□□□ -0.05
USP25-201ENST00000285679 FBXO43Q4G163 708 aa14.76□□□□□ -0.05
USP25-201ENST00000285679 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa14.76□□□□□ -0.05
USP25-201ENST00000285679 UCK2Q9BZX2 261 aa14.76□□□□□ -0.05
USP25-201ENST00000285679 ZNF224Q9NZL3 707 aa14.76□□□□□ -0.05
USP25-201ENST00000285679 VPS29Q9UBQ0 182 aa14.76□□□□□ -0.05
USP25-201ENST00000285679 PRRG1O14668 218 aa14.76□□□□□ -0.05
USP25-201ENST00000285679 CLDN11O75508 207 aa14.76□□□□□ -0.05
USP25-201ENST00000285679 TSPAN9O75954 239 aa14.76□□□□□ -0.05
USP25-201ENST00000285679 PEX11BO96011 259 aa14.76□□□□□ -0.05
USP25-201ENST00000285679 NR2F6P10588 404 aa14.76□□□□□ -0.05
USP25-201ENST00000285679 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP14.76□□□□□ -0.05
USP25-201ENST00000285679 BMPR1AP36894 532 aa14.76□□□□□ -0.05
USP25-201ENST00000285679 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
USP25-201ENST00000285679 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
USP25-201ENST00000285679 C2orf80Q0P641 193 aa14.76□□□□□ -0.05
USP25-201ENST00000285679 SCARB2Q14108 478 aa14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.4 ms