RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284273.5

UBASH3B-201, Transcript of ubiquitin associated and SH3 domain containing B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBASH3B, Length 6,912 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3B-201ENST00000284273 EDNRBP24530 442 aa11.5□□□□□ -0.57
UBASH3B-201ENST00000284273 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
UBASH3B-201ENST00000284273 SOX2P48431 317 aa11.5□□□□□ -0.57
UBASH3B-201ENST00000284273 SOX9P48436 509 aa11.5□□□□□ -0.57
UBASH3B-201ENST00000284273 PGGT1BP53609 377 aa11.5□□□□□ -0.57
UBASH3B-201ENST00000284273 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
UBASH3B-201ENST00000284273 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa11.5□□□□□ -0.57
UBASH3B-201ENST00000284273 PDPRQ8NCN5 879 aa11.5□□□□□ -0.57
UBASH3B-201ENST00000284273 TMEM41AQ96HV5 264 aa11.5□□□□□ -0.57
UBASH3B-201ENST00000284273 TWNKQ96RR1 684 aa11.5□□□□□ -0.57
UBASH3B-201ENST00000284273 MTG2Q9H4K7 406 aa11.5□□□□□ -0.57
UBASH3B-201ENST00000284273 GALPQ9UBC7 116 aa11.5□□□□□ -0.57
UBASH3B-201ENST00000284273 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
UBASH3B-201ENST00000284273 THRBP10828 461 aa11.5□□□□□ -0.57
UBASH3B-201ENST00000284273 PSKH1P11801 424 aa11.5□□□□□ -0.57
UBASH3B-201ENST00000284273 CD79AP11912 226 aa11.5□□□□□ -0.57
UBASH3B-201ENST00000284273 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
UBASH3B-201ENST00000284273 RNF130Q86XS8 419 aa11.5□□□□□ -0.57
UBASH3B-201ENST00000284273 TTLQ8NG68 377 aa11.5□□□□□ -0.57
UBASH3B-201ENST00000284273 OR6N2Q8NGY6 317 aa11.5□□□□□ -0.57
UBASH3B-201ENST00000284273 SLC5A11Q8WWX8 675 aa11.5□□□□□ -0.57
UBASH3B-201ENST00000284273 CDH22Q9UJ99 828 aa11.5□□□□□ -0.57
UBASH3B-201ENST00000284273 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa11.5□□□□□ -0.57
UBASH3B-201ENST00000284273 TLL2Q9Y6L7 1015 aa11.5□□□□□ -0.57
UBASH3B-201ENST00000284273 CACNA1FO60840 1977 aa11.5□□□□□ -0.57
UBASH3B-201ENST00000284273 A0A1W2PRQ8 180 aa11.49□□□□□ -0.57
UBASH3B-201ENST00000284273 MPPED1O15442 326 aa11.49□□□□□ -0.57
UBASH3B-201ENST00000284273 ZNF35P13682 527 aa11.49□□□□□ -0.57
UBASH3B-201ENST00000284273 ABOP16442 354 aa11.49□□□□□ -0.57
UBASH3B-201ENST00000284273 TMEM11P17152 192 aa11.49□□□□□ -0.57
UBASH3B-201ENST00000284273 CHRNB2P17787 502 aa11.49□□□□□ -0.57
UBASH3B-201ENST00000284273 LIMK2P53671 638 aa11.49□□□□□ -0.57
UBASH3B-201ENST00000284273 TMEM198Q66K66 360 aa11.49□□□□□ -0.57
UBASH3B-201ENST00000284273 SLC2A7Q6PXP3 512 aa11.49□□□□□ -0.57
UBASH3B-201ENST00000284273 TBC1D21Q8IYX1 336 aa11.49□□□□□ -0.57
UBASH3B-201ENST00000284273 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa11.49□□□□□ -0.57
UBASH3B-201ENST00000284273 HAPLN3Q96S86 360 aa11.49□□□□□ -0.57
UBASH3B-201ENST00000284273 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
UBASH3B-201ENST00000284273 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa11.49□□□□□ -0.57
UBASH3B-201ENST00000284273 K7ERQ8 282 aa11.49□□□□□ -0.57
UBASH3B-201ENST00000284273 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
UBASH3B-201ENST00000284273 LHCGRP22888 699 aa11.49□□□□□ -0.57
UBASH3B-201ENST00000284273 PLCXD2Q0VAA5 305 aa11.49□□□□□ -0.57
UBASH3B-201ENST00000284273 NPRL3Q12980 569 aa11.49□□□□□ -0.57
UBASH3B-201ENST00000284273 LRIT3Q3SXY7 679 aa11.49□□□□□ -0.57
UBASH3B-201ENST00000284273 TTC27Q6P3X3 843 aa11.49□□□□□ -0.57
UBASH3B-201ENST00000284273 KCTD13Q8WZ19 329 aa11.49□□□□□ -0.57
UBASH3B-201ENST00000284273 IL1RAPQ9NPH3 570 aa11.49□□□□□ -0.57
UBASH3B-201ENST00000284273 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa11.49□□□□□ -0.57
UBASH3B-201ENST00000284273 AGPSO00116 658 aa11.49□□□□□ -0.57
UBASH3B-201ENST00000284273 TGM5O43548 720 aa11.49□□□□□ -0.57
UBASH3B-201ENST00000284273 THEGLP0DJG4 465 aa11.49□□□□□ -0.57
UBASH3B-201ENST00000284273 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
UBASH3B-201ENST00000284273 CBR4Q8N4T8 237 aa11.49□□□□□ -0.57
UBASH3B-201ENST00000284273 ASB15Q8WXK1 588 aa11.49□□□□□ -0.57
UBASH3B-201ENST00000284273 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
UBASH3B-201ENST00000284273 ACTL7AQ9Y615 435 aa11.49□□□□□ -0.57
UBASH3B-201ENST00000284273 USP32Q8NFA0 1604 aa11.49□□□□□ -0.57
UBASH3B-201ENST00000284273 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
UBASH3B-201ENST00000284273 ANKRD66B4E2M5 251 aa11.49□□□□□ -0.57
UBASH3B-201ENST00000284273 H3BML4 177 aa11.49□□□□□ -0.57
UBASH3B-201ENST00000284273 FSCN2O14926 492 aa11.49□□□□□ -0.57
UBASH3B-201ENST00000284273 SSX5O60225 188 aa11.49□□□□□ -0.57
UBASH3B-201ENST00000284273 PRKD3O94806 890 aa11.49□□□□□ -0.57
UBASH3B-201ENST00000284273 P04436 131 aa11.49□□□□□ -0.57
UBASH3B-201ENST00000284273 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
UBASH3B-201ENST00000284273 CCR3P51677 355 aa11.49□□□□□ -0.57
UBASH3B-201ENST00000284273 RIT1Q92963 219 aa11.49□□□□□ -0.57
UBASH3B-201ENST00000284273 MNTQ99583 582 aa11.49□□□□□ -0.57
UBASH3B-201ENST00000284273 USP29Q9HBJ7 922 aa11.49□□□□□ -0.57
UBASH3B-201ENST00000284273 GIMAP2Q9UG22 337 aa11.49□□□□□ -0.57
UBASH3B-201ENST00000284273 SCML2Q9UQR0 700 aa11.49□□□□□ -0.57
UBASH3B-201ENST00000284273 PADI2Q9Y2J8 665 aa11.49□□□□□ -0.57
UBASH3B-201ENST00000284273 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
UBASH3B-201ENST00000284273 GNRHRP30968 328 aa11.49□□□□□ -0.57
UBASH3B-201ENST00000284273 HNF1BP35680 557 aa11.49□□□□□ -0.57
UBASH3B-201ENST00000284273 DCCP43146 1447 aa11.49□□□□□ -0.57
UBASH3B-201ENST00000284273 CDH15P55291 814 aa11.49□□□□□ -0.57
UBASH3B-201ENST00000284273 GALNT12Q8IXK2 581 aa11.49□□□□□ -0.57
UBASH3B-201ENST00000284273 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa11.49□□□□□ -0.57
UBASH3B-201ENST00000284273 POFUT2Q9Y2G5 429 aa11.49□□□□□ -0.57
UBASH3B-201ENST00000284273 KAT7O95251 611 aa11.49□□□□□ -0.57
UBASH3B-201ENST00000284273 AHSA1O95433 338 aa11.49□□□□□ -0.57
UBASH3B-201ENST00000284273 HK1P19367 917 aa11.49□□□□□ -0.57
UBASH3B-201ENST00000284273 GSTT1P30711 240 aa11.49□□□□□ -0.57
UBASH3B-201ENST00000284273 CHRNEQ04844 493 aa11.49□□□□□ -0.57
UBASH3B-201ENST00000284273 TMEM35AQ53FP2 167 aa11.49□□□□□ -0.57
UBASH3B-201ENST00000284273 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
UBASH3B-201ENST00000284273 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa11.49□□□□□ -0.57
UBASH3B-201ENST00000284273 ADNP2Q6IQ32 1131 aa11.49□□□□□ -0.57
UBASH3B-201ENST00000284273 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
UBASH3B-201ENST00000284273 OTUB2Q96DC9 234 aa11.49□□□□□ -0.57
UBASH3B-201ENST00000284273 OR2M4Q96R27 311 aa11.49□□□□□ -0.57
UBASH3B-201ENST00000284273 TTYH3Q9C0H2 523 aa11.49□□□□□ -0.57
UBASH3B-201ENST00000284273 MED28Q9H204 178 aa11.49□□□□□ -0.57
UBASH3B-201ENST00000284273 ADAMTS10Q9H324 1103 aa11.49□□□□□ -0.57
UBASH3B-201ENST00000284273 FZD9O00144 591 aa11.48□□□□□ -0.57
UBASH3B-201ENST00000284273 PDCD5O14737 125 aa11.48□□□□□ -0.57
UBASH3B-201ENST00000284273 AURKAO14965 403 aa11.48□□□□□ -0.57
UBASH3B-201ENST00000284273 TSPAN6O43657 245 aa11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44 ms