RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261169.10

LMO3-201, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO3, Length 3,810 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-201ENST00000261169 CSF2P04141 144 aa5.33□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 DBIP07108 87 aaKnown RBP5.33□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 LINGO3P0C6S8 592 aa5.33□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP5.33□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 KDELR2P33947 212 aa5.33□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 SLC9A3P48764 834 aa5.33□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 PXNP49023 591 aaPredicted RBP5.33□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 CRISP3P54108 245 aa5.33□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 DNAJB13P59910 316 aa5.33□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP5.33□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 DNASE1L3Q13609 305 aa5.33□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 DPY19L1Q2PZI1 675 aa5.33□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 IQCCQ4KMZ1 466 aa5.33□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 CYBRD1Q53TN4 286 aa5.33□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 MORN1Q5T089 497 aa5.33□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 MZT2BQ6NZ67 158 aa5.33□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP5.33□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 ARL9Q6T311 187 aa5.33□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 ENPP6Q6UWR7 440 aa5.33□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 ASB18Q6ZVZ8 466 aa5.33□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP5.33□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP5.33□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP5.33□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 GPR26Q8NDV2 337 aa5.33□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 MDGA1Q8NFP4 955 aa5.33□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 OR9A1PQ8NGU1 263 aa5.33□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 OR4C6Q8NH72 309 aa5.33□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 PIGXQ8TBF5 258 aa5.33□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 NUDT8Q8WV74 236 aa5.33□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 SLC5A11Q8WWX8 675 aa5.33□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 FOXJ1Q92949 421 aa5.33□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 RTP4Q96DX8 246 aa5.33□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 APIPQ96GX9 242 aa5.33□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 DPYSL5Q9BPU6 564 aa5.33□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP5.33□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 TMEM175Q9BSA9 504 aa5.33□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 BEX2Q9BXY8 128 aa5.33□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 BCL2L14Q9BZR8 327 aa5.33□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP5.33□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 MUC13Q9H3R2 512 aa5.33□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 BEX1Q9HBH7 125 aa5.33□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 POLE4Q9NR33 117 aa5.33□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 TMEM30AQ9NV96 361 aa5.33□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 IL17CQ9P0M4 197 aa5.33□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 USP22Q9UPT9 525 aa5.33□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP5.33□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 CACNA1EQ15878 2313 aa5.33□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 A0A1W2PPK0 400 aa5.33□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 ZNF487B1APH4 448 aa5.33□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 STX16O14662 325 aa5.33□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 CCNDBP1O95273 360 aa5.33□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 H1F0P07305 194 aaKnown RBP5.33□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 IL3P08700 152 aa5.33□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 DHRS4L1P0CG22 281 aa5.33□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 LAMP1P11279 417 aa5.33□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 ANXA8P13928 327 aa5.33□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 CD72P21854 359 aa5.33□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP5.33□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 STT3AP46977 705 aa5.33□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 OMPP47874 163 aa5.33□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 APLP1P51693 650 aa5.33□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 ARF5P84085 180 aa5.33□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP5.33□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 CAMK1Q14012 370 aa5.33□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 GK3PQ14409 553 aa5.33□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 GRIN2CQ14957 1233 aa5.33□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP5.33□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 ZNF311Q5JNZ3 666 aa5.33□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 MLIPQ5VWP3 458 aa5.33□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 CRTC1Q6UUV9 634 aa5.33□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 ZNF534Q76KX8 674 aa5.33□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 BTN2A1Q7KYR7 527 aa5.33□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 SVOPLQ8N434 492 aa5.33□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 PSD4Q8NDX1 1056 aa5.33□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 FRS2Q8WU20 508 aa5.33□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 NRG4Q8WWG1 115 aa5.33□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 S100ZQ8WXG8 99 aa5.33□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 RGMAQ96B86 450 aa5.33□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 ALPK1Q96QP1 1244 aa5.33□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 GSTO2Q9H4Y5 243 aa5.33□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 EXO5Q9H790 373 aa5.33□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP5.33□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP5.33□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 SMOXQ9NWM0 555 aa5.33□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa5.33□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 SMCHD1A6NHR9 2005 aa5.33□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 AKAP6Q13023 2319 aa5.33□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 M0R129 80 aa5.33□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 SLC22A2O15244 555 aa5.33□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP5.33□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 KRT33AO76009 404 aa5.33□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 SRCP12931 536 aa5.33□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 MASP1P48740 699 aa5.33□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 TBPL1P62380 186 aa5.33□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP5.33□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 TSTQ16762 297 aaKnown RBP5.33□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 IDNKQ5T6J7 187 aa5.33□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 NEK5Q6P3R8 708 aa5.33□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 MZT2AQ6P582 158 aa5.33□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa5.33□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.1 ms