RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000053252.8

Ctxn1-201, Transcript of Cortexin-1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ctxn1, Length 1,212 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Slc22a4Q9Z306 553 aa20.91■□□□□ 0.94
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Dock8Q8C147 2100 aa20.9■□□□□ 0.94
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gm21885A0A286YDN8 145 aa20.9■□□□□ 0.94
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Tmem74bA2AU34 232 aa20.9■□□□□ 0.94
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Znf296E9Q6W4 445 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gm45837F7D3W5 961 aa20.9■□□□□ 0.94
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Rnf148G3X9R7 316 aa20.9■□□□□ 0.94
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Vmn1r170K7N6W9 304 aa20.9■□□□□ 0.94
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Rundc3aO08576 446 aa20.9■□□□□ 0.94
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Galnt1O08912 559 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Sh2d1bO35324 132 aa20.9■□□□□ 0.94
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Il2rgP34902 369 aa20.9■□□□□ 0.94
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Pcbp4P57724 403 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Arl1P61211 181 aa20.9■□□□□ 0.94
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Abce1P61222 599 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Tmem38aQ3TMP8 298 aa20.9■□□□□ 0.94
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Q5SPV6 233 aa20.9■□□□□ 0.94
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Olfr1065Q7TR70 313 aa20.9■□□□□ 0.94
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ttc29Q80VM3 471 aa20.9■□□□□ 0.94
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Abhd16bQ80YU0 474 aa20.9■□□□□ 0.94
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ip6k3Q8BWD2 396 aa20.9■□□□□ 0.94
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Utp6Q8VCY6 597 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Olfr1310Q8VF85 312 aa20.9■□□□□ 0.94
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Olfr1390Q8VGW9 311 aa20.9■□□□□ 0.94
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Pcdha8Q91Y12 946 aa20.9■□□□□ 0.94
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ppp6cQ9CQR6 305 aa20.9■□□□□ 0.94
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Tmem186Q9CR76 216 aa20.9■□□□□ 0.94
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 MispQ9D279 648 aa20.9■□□□□ 0.94
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ndufs3Q9DCT2 263 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Taf8Q9EQH4 308 aa20.9■□□□□ 0.94
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Epb41l1Q9Z2H5 879 aa20.9■□□□□ 0.94
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 NbeaQ9EPN1 2936 aa20.89■□□□□ 0.94
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Rpl7a-ps3A0A140T8L1 270 aa20.89■□□□□ 0.93
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Igkv15-103A0A140T8P3 115 aa20.89■□□□□ 0.93
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Olfr1089A0A1L1SRK6 311 aa20.89■□□□□ 0.93
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1700023F06RikA2AB62 382 aa20.89■□□□□ 0.93
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ccdc175E9PVB3 822 aa20.89■□□□□ 0.93
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 H2-T23P06339 357 aa20.89■□□□□ 0.93
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Fv4P11370 679 aa20.89■□□□□ 0.93
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Fen1P39749 378 aa20.89■□□□□ 0.93
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Glt6d1Q2NKH9 311 aa20.89■□□□□ 0.93
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Kdm4dQ3U2K5 510 aa20.89■□□□□ 0.93
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Lin28bQ45KJ6 247 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.93
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Xrcc1Q60596 631 aa20.89■□□□□ 0.93
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Map3k7Q62073 579 aa20.89■□□□□ 0.93
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Tmcc1Q69ZZ6 649 aa20.89■□□□□ 0.93
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Banf2Q8BVR0 90 aa20.89■□□□□ 0.93
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Wdr60Q8C761 999 aa20.89■□□□□ 0.93
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Aqp12Q8CHJ2 290 aa20.89■□□□□ 0.93
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Pih1d2Q8CHR9 315 aa20.89■□□□□ 0.93
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Agpat4Q8K4X7 378 aa20.89■□□□□ 0.93
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Vmn1r33Q8R2E0 305 aa20.89■□□□□ 0.93
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Olfr1391Q8VFA4 311 aa20.89■□□□□ 0.93
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Txndc9Q9CQ79 226 aa20.89■□□□□ 0.93
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Zdhhc4Q9D6H5 343 aa20.89■□□□□ 0.93
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ascc1Q9D8Z1 356 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.93
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Defb5Q9EPV9 64 aa20.89■□□□□ 0.93
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Aif1lQ9EQX4 150 aa20.89■□□□□ 0.93
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Rgs20Q9QZB1 239 aa20.89■□□□□ 0.93
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Cdh22Q9WTP5 813 aa20.89■□□□□ 0.93
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gm33543A0A1B0GSI5 81 aa20.88■□□□□ 0.93
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Zfp808B8JJZ4 753 aa20.88■□□□□ 0.93
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Lce6aD3YV94 81 aa20.88■□□□□ 0.93
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Olfr600E9PUN7 314 aa20.88■□□□□ 0.93
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Serpinb6bO08804 377 aa20.88■□□□□ 0.93
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ess2O70279 479 aa20.88■□□□□ 0.93
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Btnl2O70355 454 aa20.88■□□□□ 0.93
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Gpld1O70362 837 aa20.88■□□□□ 0.93
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 P01637 128 aa20.88■□□□□ 0.93
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 P01664 111 aa20.88■□□□□ 0.93
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Apoa4P06728 395 aa20.88■□□□□ 0.93
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 HexaP29416 528 aa20.88■□□□□ 0.93
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 LdlrP35951 862 aa20.88■□□□□ 0.93
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Alox5P48999 674 aa20.88■□□□□ 0.93
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Hnf4aP49698 474 aa20.88■□□□□ 0.93
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Slc9a3r1P70441 355 aa20.88■□□□□ 0.93
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Serpina3mQ03734 418 aa20.88■□□□□ 0.93
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Prmt9Q3U3W5 846 aa20.88■□□□□ 0.93
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Kctd16Q5DTY9 427 aa20.88■□□□□ 0.93
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Eif1aQ60872 144 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Itih3Q61704 889 aa20.88■□□□□ 0.93
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Sema3bQ62177 748 aa20.88■□□□□ 0.93
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Hist2h2acQ64523 129 aa20.88■□□□□ 0.93
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Hist2h2aa1Q6GSS7 130 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Megf11Q80T91 1091 aa20.88■□□□□ 0.93
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Ntf4Q80VU4 209 aa20.88■□□□□ 0.93
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Tubgcp5Q8BKN5 1024 aa20.88■□□□□ 0.93
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Snx16Q8C080 344 aa20.88■□□□□ 0.93
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Cabs1Q8C633 391 aa20.88■□□□□ 0.93
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 ItchQ8C863 864 aa20.88■□□□□ 0.93
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Rdh16f2Q8K3M1 318 aa20.88■□□□□ 0.93
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Olfr952Q8VFD7 314 aa20.88■□□□□ 0.93
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Olfr522Q8VGL1 312 aa20.88■□□□□ 0.93
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Fgfrl1Q91V87 529 aa20.88■□□□□ 0.93
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Tmem81Q9D5K1 259 aa20.88■□□□□ 0.93
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Olfr955Q9EQ97 314 aa20.88■□□□□ 0.93
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Rnf11Q9QYK7 154 aa20.88■□□□□ 0.93
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Med13Q5SWW4 2171 aa20.87■□□□□ 0.93
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 AgrnA2ASQ1 1950 aa20.87■□□□□ 0.93
Ctxn1-201ENSMUST00000053252 Cfap77A0A087WRI3 283 aa20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 9.6 ms