RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000618610.1

PTPRT-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 3,230 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-211ENST00000618610 SLC34A3Q8N130 599 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 LINC01465Q8N7H1 131 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 CDC26Q8NHZ8 85 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 SETD6Q8TBK2 473 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP7.93□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 SPNS1Q9H2V7 528 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP7.93□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP7.93□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 POU2F1P14859 743 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 RPL17P18621 184 aaKnown RBP7.93□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 CD52P31358 61 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 ZNF81P51508 661 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 TPMTP51580 245 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 SRP54P61011 504 aaKnown RBP7.93□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 MAXP61244 160 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 GRIK2Q13002 908 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 SNAPC1Q16533 368 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP7.93□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 OR6M1Q8NGM8 313 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP7.93□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 SLC9A6Q92581 669 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 PCED1BQ96HM7 432 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 C12orf57Q99622 126 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 WACQ9BTA9 647 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 NIPAL2Q9H841 368 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP7.93□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 ZNF225Q9UK10 706 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP7.93□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 COPS3Q9UNS2 423 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 ANK1P16157 1881 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 SIP14410 1827 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 LCTP09848 1927 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 DOCK6Q96HP0 2047 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 FAM234BA2RU67 622 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 PER2O15055 1255 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 SEC22BO75396 215 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 ZNF254O75437 659 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 AP2A2O94973 939 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 MMP3P08254 477 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP7.92□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 DNAJB2P25686 324 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 ARSDP51689 593 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP7.92□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 NPRL3Q12980 569 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 SEMA3BQ13214 749 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP7.92□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 NR6A1Q15406 480 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 SGO1Q5FBB7 561 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 TRILQ7L0X0 811 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP7.92□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 ZFAND4Q86XD8 727 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 OR52J3Q8NH60 311 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 SLC22A8Q8TCC7 542 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 MGLLQ99685 303 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 SMOQ99835 787 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 SERHL2Q9H4I8 314 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 CRTAC1Q9NQ79 661 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 ASAH2Q9NR71 780 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 MPP6Q9NZW5 540 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP7.92□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 FAM50BQ9Y247 325 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 SSUH2Q9Y2M2 353 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP7.92□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 MIA3Q5JRA6 1907 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 TRAV20A0A0B4J274 112 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP7.92□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 BNIP3LO60238 219 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 B4GALT3O60512 393 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 RFPL3O75679 317 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 CYP17A1P05093 508 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 MTHFD2P13995 350 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 ARSBP15848 533 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 CD72P21854 359 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 CSKP41240 450 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 MAP2K3P46734 347 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP7.92□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 VLDLRP98155 873 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 SSX1Q16384 188 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP7.92□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 RFX4Q33E94 735 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP7.92□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 TAC4Q86UU9 113 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 MIB1Q86YT6 1006 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 C2orf69Q8N8R5 385 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 OR52B6Q8NGF0 335 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP7.92□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP7.92□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP7.92□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 TINF2Q9BSI4 451 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRT-211ENST00000618610 TRMOQ9BU70 441 aa7.92□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.6 ms