RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613246.4

PTPRJ-207, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRJ, Length 7,851 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-207ENST00000613246 NFATC2Q13469 925 aa18.09■□□□□ 0.49
PTPRJ-207ENST00000613246 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP18.09■□□□□ 0.49
PTPRJ-207ENST00000613246 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP18.09■□□□□ 0.49
PTPRJ-207ENST00000613246 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa18.09■□□□□ 0.49
PTPRJ-207ENST00000613246 LRRN3Q9H3W5 708 aa18.09■□□□□ 0.49
PTPRJ-207ENST00000613246 A0A0U1RQJ8 604 aa18.09■□□□□ 0.49
PTPRJ-207ENST00000613246 ARL6IP5O75915 188 aa18.09■□□□□ 0.49
PTPRJ-207ENST00000613246 GP1BBP13224 206 aa18.09■□□□□ 0.49
PTPRJ-207ENST00000613246 PTNP21246 168 aa18.09■□□□□ 0.49
PTPRJ-207ENST00000613246 DSC3Q14574 896 aa18.09■□□□□ 0.49
PTPRJ-207ENST00000613246 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP18.09■□□□□ 0.49
PTPRJ-207ENST00000613246 STRADAQ7RTN6 431 aa18.09■□□□□ 0.49
PTPRJ-207ENST00000613246 LGI4Q8N135 537 aa18.09■□□□□ 0.49
PTPRJ-207ENST00000613246 OR6N1Q8NGY5 312 aa18.09■□□□□ 0.49
PTPRJ-207ENST00000613246 CD320Q9NPF0 282 aa18.09■□□□□ 0.49
PTPRJ-207ENST00000613246 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP18.09■□□□□ 0.49
PTPRJ-207ENST00000613246 UTS2RQ9UKP6 389 aa18.09■□□□□ 0.49
PTPRJ-207ENST00000613246 ASXL3Q9C0F0 2248 aa18.09■□□□□ 0.49
PTPRJ-207ENST00000613246 PROM1O43490 865 aa18.09■□□□□ 0.49
PTPRJ-207ENST00000613246 CFIP05156 583 aa18.09■□□□□ 0.49
PTPRJ-207ENST00000613246 CD3GP09693 182 aa18.09■□□□□ 0.49
PTPRJ-207ENST00000613246 FASLGP48023 281 aa18.09■□□□□ 0.49
PTPRJ-207ENST00000613246 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa18.09■□□□□ 0.49
PTPRJ-207ENST00000613246 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa18.09■□□□□ 0.49
PTPRJ-207ENST00000613246 CEACAM20Q6UY09 585 aa18.09■□□□□ 0.49
PTPRJ-207ENST00000613246 SLC15A3Q8IY34 581 aa18.09■□□□□ 0.49
PTPRJ-207ENST00000613246 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP18.09■□□□□ 0.49
PTPRJ-207ENST00000613246 C12orf71A8MTZ7 269 aa18.09■□□□□ 0.49
PTPRJ-207ENST00000613246 COQ9O75208 318 aa18.09■□□□□ 0.49
PTPRJ-207ENST00000613246 PLP2Q04941 152 aa18.09■□□□□ 0.49
PTPRJ-207ENST00000613246 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa18.09■□□□□ 0.49
PTPRJ-207ENST00000613246 CHPT1Q8WUD6 406 aa18.09■□□□□ 0.49
PTPRJ-207ENST00000613246 SLC13A3Q8WWT9 602 aa18.09■□□□□ 0.49
PTPRJ-207ENST00000613246 LRRC58Q96CX6 371 aa18.09■□□□□ 0.49
PTPRJ-207ENST00000613246 DNTTIP1Q9H147 329 aa18.09■□□□□ 0.49
PTPRJ-207ENST00000613246 CDH1P12830 882 aa18.09■□□□□ 0.49
PTPRJ-207ENST00000613246 NR2C1P13056 603 aa18.09■□□□□ 0.49
PTPRJ-207ENST00000613246 NUDT6P53370 316 aa18.09■□□□□ 0.49
PTPRJ-207ENST00000613246 OAZ1P54368 228 aa18.09■□□□□ 0.49
PTPRJ-207ENST00000613246 ZNF529Q6P280 563 aa18.09■□□□□ 0.49
PTPRJ-207ENST00000613246 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP18.09■□□□□ 0.49
PTPRJ-207ENST00000613246 TMEM100Q9NV29 134 aa18.09■□□□□ 0.49
PTPRJ-207ENST00000613246 CDH10Q9Y6N8 788 aa18.09■□□□□ 0.49
PTPRJ-207ENST00000613246 CLIC1O00299 241 aa18.08■□□□□ 0.49
PTPRJ-207ENST00000613246 POP4O95707 220 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.49
PTPRJ-207ENST00000613246 TNFP01375 233 aa18.08■□□□□ 0.49
PTPRJ-207ENST00000613246 ADRB2P07550 413 aa18.08■□□□□ 0.49
PTPRJ-207ENST00000613246 RPL35P42766 123 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.49
PTPRJ-207ENST00000613246 NRLP54845 237 aa18.08■□□□□ 0.49
PTPRJ-207ENST00000613246 PDSS1Q5T2R2 415 aa18.08■□□□□ 0.49
PTPRJ-207ENST00000613246 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa18.08■□□□□ 0.49
PTPRJ-207ENST00000613246 NFKBIDQ8NI38 313 aa18.08■□□□□ 0.49
PTPRJ-207ENST00000613246 NLGN3Q9NZ94 848 aa18.08■□□□□ 0.49
PTPRJ-207ENST00000613246 BACE2Q9Y5Z0 518 aa18.08■□□□□ 0.49
PTPRJ-207ENST00000613246 MFSD11O43934 449 aa18.08■□□□□ 0.49
PTPRJ-207ENST00000613246 IFNA17P01571 189 aa18.08■□□□□ 0.49
PTPRJ-207ENST00000613246 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.49
PTPRJ-207ENST00000613246 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.49
PTPRJ-207ENST00000613246 HSPBAP1Q96EW2 488 aa18.08■□□□□ 0.49
PTPRJ-207ENST00000613246 B4DGG1 531 aa18.08■□□□□ 0.49
PTPRJ-207ENST00000613246 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.49
PTPRJ-207ENST00000613246 MATN1P21941 496 aa18.08■□□□□ 0.49
PTPRJ-207ENST00000613246 MYRFLQ96LU7 910 aa18.08■□□□□ 0.49
PTPRJ-207ENST00000613246 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa18.08■□□□□ 0.49
PTPRJ-207ENST00000613246 CCNFP41002 786 aa18.08■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 FAM86B1Q8N7N1 296 aa18.08■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 TCEANCQ8N8B7 351 aa18.08■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 SLAIN1Q8ND83 568 aa18.08■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 FANK1Q8TC84 345 aa18.08■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 TLR6Q9Y2C9 796 aa18.08■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 A0A1W2PQY0 241 aa18.08■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 BTNL10A8MVZ5 291 aa18.08■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 CXCL11O14625 94 aa18.08■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 ANXA8P13928 327 aa18.08■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 VSTM1Q6UX27 236 aa18.08■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 CSPG4P5Q96PW8 444 aa18.08■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 OSBPL2Q9H1P3 480 aa18.08■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 ZNF446Q9NWS9 450 aa18.08■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 IQSEC2Q5JU85 1478 aa18.08■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 SLC34A2O95436 690 aa18.08■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 SOX14O95416 240 aa18.08■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 ADAP00813 363 aa18.08■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 RIDAP52758 137 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 SPIN4Q56A73 249 aa18.08■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 COPS5Q92905 334 aa18.08■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 CEP170Q5SW79 1584 aa18.07■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 GRXCR1A8MXD5 290 aa18.07■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 MT-ND5P03915 603 aa18.07■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 GSTM3P21266 225 aa18.07■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 CRTC1Q6UUV9 634 aa18.07■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 CDCA5Q96FF9 252 aa18.07■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 TIGARQ9NQ88 270 aa18.07■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP18.07■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP18.07■□□□□ 0.48
PTPRJ-207ENST00000613246 TAS1R3Q7RTX0 852 aa18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.6 ms