RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000607882.5

RABGEF1-209, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene RABGEF1, Length 2,654 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-209ENST00000607882 BSNQ9UPA5 3926 aa12.07□□□□□ -0.48
RABGEF1-209ENST00000607882 TMEM114B3SHH9 223 aa12.07□□□□□ -0.48
RABGEF1-209ENST00000607882 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP12.07□□□□□ -0.48
RABGEF1-209ENST00000607882 CFLARO15519 480 aa12.07□□□□□ -0.48
RABGEF1-209ENST00000607882 CDK4P11802 303 aa12.07□□□□□ -0.48
RABGEF1-209ENST00000607882 PRDX6P30041 224 aa12.07□□□□□ -0.48
RABGEF1-209ENST00000607882 PKNOX1P55347 436 aa12.07□□□□□ -0.48
RABGEF1-209ENST00000607882 RTP5Q14D33 572 aa12.07□□□□□ -0.48
RABGEF1-209ENST00000607882 DEFB110Q30KQ9 67 aa12.07□□□□□ -0.48
RABGEF1-209ENST00000607882 SATL1Q86VE3 508 aa12.07□□□□□ -0.48
RABGEF1-209ENST00000607882 PQLC1Q8N2U9 271 aa12.07□□□□□ -0.48
RABGEF1-209ENST00000607882 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP12.07□□□□□ -0.48
RABGEF1-209ENST00000607882 TMEM74Q96NL1 305 aa12.07□□□□□ -0.48
RABGEF1-209ENST00000607882 CDRT15Q96T59 188 aa12.07□□□□□ -0.48
RABGEF1-209ENST00000607882 POT1Q9NUX5 634 aa12.07□□□□□ -0.48
RABGEF1-209ENST00000607882 OXSMQ9NWU1 459 aa12.07□□□□□ -0.48
RABGEF1-209ENST00000607882 ZNF462Q96JM2 2506 aa12.07□□□□□ -0.48
RABGEF1-209ENST00000607882 OR5K4A6NMS3 321 aa12.06□□□□□ -0.48
RABGEF1-209ENST00000607882 MATN2O00339 956 aa12.06□□□□□ -0.48
RABGEF1-209ENST00000607882 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP12.06□□□□□ -0.48
RABGEF1-209ENST00000607882 NRP2O60462 931 aa12.06□□□□□ -0.48
RABGEF1-209ENST00000607882 PRMT3O60678 531 aa12.06□□□□□ -0.48
RABGEF1-209ENST00000607882 OR6B1O95007 311 aa12.06□□□□□ -0.48
RABGEF1-209ENST00000607882 TIAF1O95411 115 aa12.06□□□□□ -0.48
RABGEF1-209ENST00000607882 JUNP05412 331 aaKnown RBP12.06□□□□□ -0.48
RABGEF1-209ENST00000607882 CTSBP07858 339 aa12.06□□□□□ -0.48
RABGEF1-209ENST00000607882 ZNF28P17035 718 aa12.06□□□□□ -0.48
RABGEF1-209ENST00000607882 CAPZBP47756 277 aa12.06□□□□□ -0.48
RABGEF1-209ENST00000607882 NEK2P51955 445 aa12.06□□□□□ -0.48
RABGEF1-209ENST00000607882 FLOT2Q14254 428 aa12.06□□□□□ -0.48
RABGEF1-209ENST00000607882 TLR1Q15399 786 aa12.06□□□□□ -0.48
RABGEF1-209ENST00000607882 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP12.06□□□□□ -0.48
RABGEF1-209ENST00000607882 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP12.06□□□□□ -0.48
RABGEF1-209ENST00000607882 ARHGAP40Q5TG30 622 aa12.06□□□□□ -0.48
RABGEF1-209ENST00000607882 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa12.06□□□□□ -0.48
RABGEF1-209ENST00000607882 NXNQ6DKJ4 435 aa12.06□□□□□ -0.48
RABGEF1-209ENST00000607882 CILP2Q8IUL8 1156 aa12.06□□□□□ -0.48
RABGEF1-209ENST00000607882 SPACA3Q8IXA5 215 aa12.06□□□□□ -0.48
RABGEF1-209ENST00000607882 DSELQ8IZU8 1212 aa12.06□□□□□ -0.48
RABGEF1-209ENST00000607882 OR4D9Q8NGE8 314 aa12.06□□□□□ -0.48
RABGEF1-209ENST00000607882 LPGAT1Q92604 370 aa12.06□□□□□ -0.48
RABGEF1-209ENST00000607882 RCN3Q96D15 328 aa12.06□□□□□ -0.48
RABGEF1-209ENST00000607882 CATSPER2Q96P56 530 aa12.06□□□□□ -0.48
RABGEF1-209ENST00000607882 SRMSQ9H3Y6 488 aa12.06□□□□□ -0.48
RABGEF1-209ENST00000607882 PFDN2Q9UHV9 154 aa12.06□□□□□ -0.48
RABGEF1-209ENST00000607882 HDAC3O15379 428 aa12.06□□□□□ -0.48
RABGEF1-209ENST00000607882 HCRTR1O43613 425 aa12.06□□□□□ -0.48
RABGEF1-209ENST00000607882 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP12.06□□□□□ -0.48
RABGEF1-209ENST00000607882 PNLIPP16233 465 aa12.06□□□□□ -0.48
RABGEF1-209ENST00000607882 CHN2P52757 468 aa12.06□□□□□ -0.48
RABGEF1-209ENST00000607882 NAGLUP54802 743 aa12.06□□□□□ -0.48
RABGEF1-209ENST00000607882 GPLD1P80108 840 aa12.06□□□□□ -0.48
RABGEF1-209ENST00000607882 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP12.06□□□□□ -0.48
RABGEF1-209ENST00000607882 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP12.06□□□□□ -0.48
RABGEF1-209ENST00000607882 METTL21CQ5VZV1 264 aa12.06□□□□□ -0.48
RABGEF1-209ENST00000607882 ZNF549Q6P9A3 640 aa12.06□□□□□ -0.48
RABGEF1-209ENST00000607882 OR6C1Q96RD1 312 aa12.06□□□□□ -0.48
RABGEF1-209ENST00000607882 ACAT2Q9BWD1 397 aa12.06□□□□□ -0.48
RABGEF1-209ENST00000607882 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP12.06□□□□□ -0.48
RABGEF1-209ENST00000607882 THSD1Q9NS62 852 aa12.06□□□□□ -0.48
RABGEF1-209ENST00000607882 SLC39A1Q9NY26 324 aa12.06□□□□□ -0.48
RABGEF1-209ENST00000607882 POLG2Q9UHN1 485 aa12.06□□□□□ -0.48
RABGEF1-209ENST00000607882 ACSL5Q9ULC5 683 aa12.06□□□□□ -0.48
RABGEF1-209ENST00000607882 CDYLQ9Y232 598 aa12.06□□□□□ -0.48
RABGEF1-209ENST00000607882 BTN3A1O00481 513 aa12.05□□□□□ -0.48
RABGEF1-209ENST00000607882 S1PR4O95977 384 aa12.05□□□□□ -0.48
RABGEF1-209ENST00000607882 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP12.05□□□□□ -0.48
RABGEF1-209ENST00000607882 EBLN1P0CF75 366 aa12.05□□□□□ -0.48
RABGEF1-209ENST00000607882 FOLR1P15328 257 aa12.05□□□□□ -0.48
RABGEF1-209ENST00000607882 GABRB3P28472 473 aa12.05□□□□□ -0.48
RABGEF1-209ENST00000607882 GRIA3P42263 894 aa12.05□□□□□ -0.48
RABGEF1-209ENST00000607882 TTPAP49638 278 aa12.05□□□□□ -0.48
RABGEF1-209ENST00000607882 RPL14P50914 215 aaKnown RBP12.05□□□□□ -0.48
RABGEF1-209ENST00000607882 FOXL2P58012 376 aa12.05□□□□□ -0.48
RABGEF1-209ENST00000607882 ZNF460Q14592 562 aa12.05□□□□□ -0.48
RABGEF1-209ENST00000607882 MRNIPQ6NTE8 343 aa12.05□□□□□ -0.48
RABGEF1-209ENST00000607882 UGT2A3Q6UWM9 527 aa12.05□□□□□ -0.48
RABGEF1-209ENST00000607882 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP12.05□□□□□ -0.48
RABGEF1-209ENST00000607882 AGBL5Q8NDL9 886 aa12.05□□□□□ -0.48
RABGEF1-209ENST00000607882 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP12.05□□□□□ -0.48
RABGEF1-209ENST00000607882 SOHLH2Q9NX45 425 aa12.05□□□□□ -0.48
RABGEF1-209ENST00000607882 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa12.05□□□□□ -0.48
RABGEF1-209ENST00000607882 TLK1Q9UKI8 766 aa12.05□□□□□ -0.48
RABGEF1-209ENST00000607882 PCDHGB4Q9UN71 923 aa12.05□□□□□ -0.48
RABGEF1-209ENST00000607882 RAP2CQ9Y3L5 183 aa12.05□□□□□ -0.48
RABGEF1-209ENST00000607882 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa12.05□□□□□ -0.48
RABGEF1-209ENST00000607882 A0A1W2PRQ8 180 aa12.05□□□□□ -0.48
RABGEF1-209ENST00000607882 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa12.05□□□□□ -0.48
RABGEF1-209ENST00000607882 E5RI56 91 aa12.05□□□□□ -0.48
RABGEF1-209ENST00000607882 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa12.05□□□□□ -0.48
RABGEF1-209ENST00000607882 ZNF254O75437 659 aa12.05□□□□□ -0.48
RABGEF1-209ENST00000607882 FTH1P02794 183 aa12.05□□□□□ -0.48
RABGEF1-209ENST00000607882 NTRK1P04629 796 aa12.05□□□□□ -0.48
RABGEF1-209ENST00000607882 SBK3P0C264 359 aa12.05□□□□□ -0.48
RABGEF1-209ENST00000607882 SLC2A4P14672 509 aa12.05□□□□□ -0.48
RABGEF1-209ENST00000607882 TFEBP19484 476 aa12.05□□□□□ -0.48
RABGEF1-209ENST00000607882 WT1P19544 449 aaPredicted RBP12.05□□□□□ -0.48
RABGEF1-209ENST00000607882 PSMB5P28074 263 aa12.05□□□□□ -0.48
RABGEF1-209ENST00000607882 CCKBRP32239 447 aa12.05□□□□□ -0.48
RABGEF1-209ENST00000607882 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP12.05□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.4 ms