RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000604516.1

HMGN3-AS1-201, HMGN3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HMGN3-AS1, Length 2,946 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SERTM1A2A2V5 107 aa11.36□□□□□ -0.59
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CBLL1Q75N03 491 aa11.35□□□□□ -0.59
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa11.35□□□□□ -0.59
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 COMMD6Q7Z4G1 85 aa11.35□□□□□ -0.59
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa11.35□□□□□ -0.59
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NLRP8Q86W28 1048 aa11.35□□□□□ -0.59
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LILRB5O75023 590 aa11.34□□□□□ -0.59
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 C6orf47O95873 294 aa11.34□□□□□ -0.59
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 C6P13671 934 aa11.34□□□□□ -0.59
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP11.34□□□□□ -0.59
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TAP2Q03519 686 aa11.34□□□□□ -0.59
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 AQP6Q13520 282 aa11.34□□□□□ -0.59
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PRSS53Q2L4Q9 553 aa11.34□□□□□ -0.59
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 OR52J3Q8NH60 311 aa11.34□□□□□ -0.59
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ZFP90Q8TF47 636 aa11.34□□□□□ -0.59
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NRBF2Q96F24 287 aa11.34□□□□□ -0.59
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 COQ10AQ96MF6 247 aa11.34□□□□□ -0.59
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 BRF2Q9HAW0 419 aa11.34□□□□□ -0.59
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RPS6KA6Q9UK32 745 aa11.34□□□□□ -0.59
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 J3QRK9 145 aa11.34□□□□□ -0.59
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 POP7O75817 140 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SEMG1P04279 462 aa11.34□□□□□ -0.59
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