RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591833.5

SEPT9-240, Transcript of septin 9, human

TSL 4

Gene SEPT9, Length 576 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SEPT9-240	ENST00000591833	DNAJB8	Q8NHS0	232 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SEPT9-240	ENST00000591833	SUN3	Q8TAQ9	357 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SEPT9-240	ENST00000591833	SLCO2A1	Q92959	643 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SEPT9-240	ENST00000591833	HAUS8	Q9BT25	410 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SEPT9-240	ENST00000591833	SARG	Q9BW04	601 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SEPT9-240	ENST00000591833	SGPP1	Q9BX95	441 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SEPT9-240	ENST00000591833	VN1R1	Q9GZP7	353 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SEPT9-240	ENST00000591833	ANKH	Q9HCJ1	492 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SEPT9-240	ENST00000591833	CORO1C	Q9ULV4	474 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
SEPT9-240	ENST00000591833	OSGIN2	Q9Y236	505 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SEPT9-240	ENST00000591833	SLC22A7	Q9Y694	548 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SEPT9-240	ENST00000591833	ITPR2	Q14571	2701 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SEPT9-240	ENST00000591833	PABPN1L	A6NDY0	278 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
SEPT9-240	ENST00000591833	DNALI1	O14645	258 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
SEPT9-240	ENST00000591833	JRK	O75564	520 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SEPT9-240	ENST00000591833	AHSG	P02765	367 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SEPT9-240	ENST00000591833	SLC35G6	P0C7Q6	338 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SEPT9-240	ENST00000591833	ITGAM	P11215	1152 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SEPT9-240	ENST00000591833	NPPB	P16860	134 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SEPT9-240	ENST00000591833	DCT	P40126	519 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SEPT9-240	ENST00000591833	AP1S2	P56377	157 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SEPT9-240	ENST00000591833	IL2	P60568	153 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SEPT9-240	ENST00000591833	MAT1A	Q00266	395 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
SEPT9-240	ENST00000591833	C2orf54	Q08AI8	447 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SEPT9-240	ENST00000591833	NAE1	Q13564	534 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SEPT9-240	ENST00000591833	PLAG1	Q6DJT9	500 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SEPT9-240	ENST00000591833	CAPN13	Q6MZZ7	669 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
SEPT9-240	ENST00000591833	NIPAL1	Q6NVV3	410 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SEPT9-240	ENST00000591833	C8orf74	Q6P047	294 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SEPT9-240	ENST00000591833	PAQR3	Q6TCH7	311 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SEPT9-240	ENST00000591833	CPEB2	Q7Z5Q1	589 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
SEPT9-240	ENST00000591833	ASPG	Q86U10	573 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SEPT9-240	ENST00000591833	LURAP1L	Q8IV03	231 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SEPT9-240	ENST00000591833	ABHD11	Q8NFV4	315 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SEPT9-240	ENST00000591833	SLC13A3	Q8WWT9	602 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SEPT9-240	ENST00000591833	NR4A3	Q92570	626 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SEPT9-240	ENST00000591833	NDN	Q99608	321 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SEPT9-240	ENST00000591833	TRIM54	Q9BYV2	358 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SEPT9-240	ENST00000591833	CSTF2T	Q9H0L4	616 aa	Known RBP eCLIP	13.48	□□□□□ -0.25	3e-7	■■■■■ 27.8
SEPT9-240	ENST00000591833	PLA2G3	Q9NZ20	509 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SEPT9-240	ENST00000591833	STMN3	Q9NZ72	180 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SEPT9-240	ENST00000591833	ASIC3	Q9UHC3	531 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SEPT9-240	ENST00000591833	ADAMTS6	Q9UKP5	1117 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SEPT9-240	ENST00000591833	SVIL	O95425	2214 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SEPT9-240	ENST00000591833	CPAMD8	Q8IZJ3	1885 aa		13.48	□□□□□ -0.25
SEPT9-240	ENST00000591833	DIDO1	Q9BTC0	2240 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
SEPT9-240	ENST00000591833	OR5H15	A6NDH6	313 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SEPT9-240	ENST00000591833	WDPCP	O95876	746 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SEPT9-240	ENST00000591833	CRYAB	P02511	175 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
SEPT9-240	ENST00000591833	GABRB3	P28472	473 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SEPT9-240	ENST00000591833	XCR1	P46094	333 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SEPT9-240	ENST00000591833	SKP1	P63208	163 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SEPT9-240	ENST00000591833	DHX9	Q08211	1270 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
SEPT9-240	ENST00000591833	EXT1	Q16394	746 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SEPT9-240	ENST00000591833	MINDY4	Q4G0A6	757 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SEPT9-240	ENST00000591833	DUPD1	Q68J44	220 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SEPT9-240	ENST00000591833	HIBCH	Q6NVY1	386 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
SEPT9-240	ENST00000591833	H3F3C	Q6NXT2	135 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SEPT9-240	ENST00000591833	MAATS1	Q7Z4T9	603 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SEPT9-240	ENST00000591833	TBC1D19	Q8N5T2	526 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SEPT9-240	ENST00000591833	NOA1	Q8NC60	698 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
SEPT9-240	ENST00000591833	OR4K1	Q8NGD4	311 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SEPT9-240	ENST00000591833	ATL1	Q8WXF7	558 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SEPT9-240	ENST00000591833	LRRC39	Q96DD0	335 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SEPT9-240	ENST00000591833	CERS2	Q96G23	380 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SEPT9-240	ENST00000591833	PDLIM5	Q96HC4	596 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
SEPT9-240	ENST00000591833	ZNF354B	Q96LW1	612 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SEPT9-240	ENST00000591833	MAGEB10	Q96LZ2	347 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
SEPT9-240	ENST00000591833	TAAR6	Q96RI8	345 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SEPT9-240	ENST00000591833	ATG10	Q9H0Y0	220 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SEPT9-240	ENST00000591833	ABI3	Q9P2A4	366 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SEPT9-240	ENST00000591833	PCDHGB6	Q9Y5F9	930 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SEPT9-240	ENST00000591833	SCN2A	Q99250	2005 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SEPT9-240	ENST00000591833	CACNA1D	Q01668	2161 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SEPT9-240	ENST00000591833	CDK2AP1	O14519	115 aa		13.46	□□□□□ -0.25
SEPT9-240	ENST00000591833	LCMT2	O60294	686 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.25
SEPT9-240	ENST00000591833	PRAMEF2	O60811	474 aa		13.46	□□□□□ -0.25
SEPT9-240	ENST00000591833	ERLIN1	O75477	346 aa		13.46	□□□□□ -0.25
SEPT9-240	ENST00000591833	RASAL1	O95294	804 aa		13.46	□□□□□ -0.25
SEPT9-240	ENST00000591833	ENO2	P09104	434 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.25
SEPT9-240	ENST00000591833	IL1RN	P18510	177 aa		13.46	□□□□□ -0.25
SEPT9-240	ENST00000591833	COL8A1	P27658	744 aa		13.46	□□□□□ -0.25
SEPT9-240	ENST00000591833	CCR8	P51685	355 aa		13.46	□□□□□ -0.25
SEPT9-240	ENST00000591833	TDGF1P3	P51864	188 aa		13.46	□□□□□ -0.25
SEPT9-240	ENST00000591833	EFNA3	P52797	238 aa		13.46	□□□□□ -0.25
SEPT9-240	ENST00000591833	CDKN2D	P55273	166 aa		13.46	□□□□□ -0.25
SEPT9-240	ENST00000591833	PDAP1	Q13442	181 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.25
SEPT9-240	ENST00000591833	PWP1	Q13610	501 aa		13.46	□□□□□ -0.25
SEPT9-240	ENST00000591833	MORF4L2	Q15014	288 aa		13.46	□□□□□ -0.25
SEPT9-240	ENST00000591833	HERC3	Q15034	1050 aa		13.46	□□□□□ -0.25
SEPT9-240	ENST00000591833	ZRSR2	Q15696	482 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.25
SEPT9-240	ENST00000591833	ZNF800	Q2TB10	664 aa	Predicted RBP eCLIP	13.46	□□□□□ -0.25
SEPT9-240	ENST00000591833	TEDDM1	Q5T9Z0	273 aa		13.46	□□□□□ -0.25
SEPT9-240	ENST00000591833	MFSD4B	Q5TF39	518 aa		13.46	□□□□□ -0.25
SEPT9-240	ENST00000591833	WDR93	Q6P2C0	686 aa		13.46	□□□□□ -0.25
SEPT9-240	ENST00000591833	SYDE1	Q6ZW31	735 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.25
SEPT9-240	ENST00000591833	PRSS41	Q7RTY9	318 aa		13.46	□□□□□ -0.25
SEPT9-240	ENST00000591833	STRA8	Q7Z7C7	330 aa		13.46	□□□□□ -0.25
SEPT9-240	ENST00000591833	SLC26A11	Q86WA9	606 aa		13.46	□□□□□ -0.25
SEPT9-240	ENST00000591833	PDIK1L	Q8N165	341 aa		13.46	□□□□□ -0.25

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.3 ms