RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590422.1

CTIF-208, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, human

TSL 3

Gene CTIF, Length 412 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTIF-208	ENST00000590422	PLAG1	Q6DJT9	500 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CTIF-208	ENST00000590422	TMEM207	Q6UWW9	146 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CTIF-208	ENST00000590422	ANKRD37	Q7Z713	158 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CTIF-208	ENST00000590422	CREG2	Q8IUH2	290 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CTIF-208	ENST00000590422	MCEMP1	Q8IX19	187 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CTIF-208	ENST00000590422	MCU	Q8NE86	351 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CTIF-208	ENST00000590422	OR51Q1	Q8NH59	317 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CTIF-208	ENST00000590422	ACTRT1	Q8TDG2	376 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CTIF-208	ENST00000590422	METTL21A	Q8WXB1	218 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CTIF-208	ENST00000590422	SIGLEC12	Q96PQ1	595 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CTIF-208	ENST00000590422	CYTH2	Q99418	400 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CTIF-208	ENST00000590422	EBNA1BP2	Q99848	306 aa	Known RBP	11.42	□□□□□ -0.58
CTIF-208	ENST00000590422	AARSD1	Q9BTE6	412 aa	Known RBP	11.42	□□□□□ -0.58
CTIF-208	ENST00000590422	CCDC68	Q9H2F9	335 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CTIF-208	ENST00000590422	XAB2	Q9HCS7	855 aa	Known RBP	11.42	□□□□□ -0.58
CTIF-208	ENST00000590422	C20orf96	Q9NUD7	363 aa	Predicted RBP	11.42	□□□□□ -0.58
CTIF-208	ENST00000590422	TMEM184C	Q9NVA4	438 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CTIF-208	ENST00000590422	ANKRD10	Q9NXR5	420 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CTIF-208	ENST00000590422	STMN3	Q9NZ72	180 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CTIF-208	ENST00000590422	SEC14L3	Q9UDX4	400 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CTIF-208	ENST00000590422	FBXO5	Q9UKT4	447 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CTIF-208	ENST00000590422	PDE10A	Q9Y233	779 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CTIF-208	ENST00000590422	ADGRG4	Q8IZF6	3080 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CTIF-208	ENST00000590422	F8	P00451	2351 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CTIF-208	ENST00000590422	PDZD2	O15018	2839 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CTIF-208	ENST00000590422	GTF3C1	Q12789	2109 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CTIF-208	ENST00000590422	KCNE1B	A0A087WTH5	132 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CTIF-208	ENST00000590422	PGRMC1	O00264	195 aa	Known RBP	11.41	□□□□□ -0.58
CTIF-208	ENST00000590422	CCL21	O00585	134 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CTIF-208	ENST00000590422	ZBTB14	O43829	449 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CTIF-208	ENST00000590422	LCMT2	O60294	686 aa	Known RBP	11.41	□□□□□ -0.58
CTIF-208	ENST00000590422	CDC123	O75794	336 aa	Predicted RBP	11.41	□□□□□ -0.58
CTIF-208	ENST00000590422	CRYAB	P02511	175 aa	Known RBP	11.41	□□□□□ -0.58
CTIF-208	ENST00000590422	CDH1	P12830	882 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CTIF-208	ENST00000590422	ICAM2	P13598	275 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CTIF-208	ENST00000590422	PGGT1B	P53609	377 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CTIF-208	ENST00000590422	ART3	Q13508	389 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CTIF-208	ENST00000590422	PHKG1	Q16816	387 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CTIF-208	ENST00000590422	ZXDC	Q2QGD7	858 aa	Predicted RBP	11.41	□□□□□ -0.58
CTIF-208	ENST00000590422	HSP90AA5P	Q58FG0	334 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CTIF-208	ENST00000590422	ZNF766	Q5HY98	468 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CTIF-208	ENST00000590422	ACER2	Q5QJU3	275 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CTIF-208	ENST00000590422	H3F3C	Q6NXT2	135 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CTIF-208	ENST00000590422	CRLF3	Q8IUI8	442 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CTIF-208	ENST00000590422	MDS2	Q8NDY4	140 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CTIF-208	ENST00000590422	OR5T3	Q8NGG3	340 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CTIF-208	ENST00000590422	EEF1AKMT1	Q8WVE0	214 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CTIF-208	ENST00000590422	TSLP	Q969D9	159 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CTIF-208	ENST00000590422	MAGOHB	Q96A72	148 aa	Known RBP	11.41	□□□□□ -0.58
CTIF-208	ENST00000590422	TM4SF19	Q96DZ7	209 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CTIF-208	ENST00000590422	CAPZA3	Q96KX2	299 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CTIF-208	ENST00000590422	SIGLEC10	Q96LC7	697 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CTIF-208	ENST00000590422	ATG10	Q9H0Y0	220 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CTIF-208	ENST00000590422	TSPAN10	Q9H1Z9	355 aa	Predicted RBP	11.41	□□□□□ -0.58
CTIF-208	ENST00000590422	SLC17A6	Q9P2U8	582 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CTIF-208	ENST00000590422	RNF14	Q9UBS8	474 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CTIF-208	ENST00000590422	TINAG	Q9UJW2	476 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CTIF-208	ENST00000590422	MAD1L1	Q9Y6D9	718 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CTIF-208	ENST00000590422	POLQ	O75417	2590 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CTIF-208	ENST00000590422	CCDC168	Q8NDH2	2452 aa		11.4	□□□□□ -0.58
CTIF-208	ENST00000590422	SLC19A2	O60779	497 aa		11.4	□□□□□ -0.58
CTIF-208	ENST00000590422	DNAJB6	O75190	326 aa		11.4	□□□□□ -0.58
CTIF-208	ENST00000590422	BANF1	O75531	89 aa		11.4	□□□□□ -0.58
CTIF-208	ENST00000590422	B3GALT4	O96024	378 aa		11.4	□□□□□ -0.58
CTIF-208	ENST00000590422	CYC1	P08574	325 aa		11.4	□□□□□ -0.58
CTIF-208	ENST00000590422	SNRPB2	P08579	225 aa	Known RBP	11.4	□□□□□ -0.58
CTIF-208	ENST00000590422	GABRB3	P28472	473 aa		11.4	□□□□□ -0.58
CTIF-208	ENST00000590422	CDKN2D	P55273	166 aa		11.4	□□□□□ -0.58
CTIF-208	ENST00000590422	AP2B1	P63010	937 aa		11.4	□□□□□ -0.58
CTIF-208	ENST00000590422	ADORA2A-AS1	P86434	159 aa		11.4	□□□□□ -0.58
CTIF-208	ENST00000590422	MEF2A	Q02078	507 aa	Predicted RBP	11.4	□□□□□ -0.58
CTIF-208	ENST00000590422	RHAG	Q02094	409 aa		11.4	□□□□□ -0.58
CTIF-208	ENST00000590422	TUBA3C	Q13748	450 aa		11.4	□□□□□ -0.58
CTIF-208	ENST00000590422	PTK6	Q13882	451 aa		11.4	□□□□□ -0.58
CTIF-208	ENST00000590422	ABRAXAS2	Q15018	415 aa		11.4	□□□□□ -0.58
CTIF-208	ENST00000590422	CDSN	Q15517	529 aa		11.4	□□□□□ -0.58
CTIF-208	ENST00000590422	C3AR1	Q16581	482 aa		11.4	□□□□□ -0.58
CTIF-208	ENST00000590422	SFT2D3	Q587I9	215 aa		11.4	□□□□□ -0.58
CTIF-208	ENST00000590422	RBM20	Q5T481	1227 aa	Known RBP	11.4	□□□□□ -0.58
CTIF-208	ENST00000590422	TUBA3E	Q6PEY2	450 aa		11.4	□□□□□ -0.58
CTIF-208	ENST00000590422	PAPD4	Q6PIY7	484 aa	Known RBP	11.4	□□□□□ -0.58
CTIF-208	ENST00000590422	AGTRAP	Q6RW13	159 aa		11.4	□□□□□ -0.58
CTIF-208	ENST00000590422	BNC2	Q6ZN30	1099 aa	Predicted RBP	11.4	□□□□□ -0.58
CTIF-208	ENST00000590422	MRGPRG	Q86SM5	289 aa		11.4	□□□□□ -0.58
CTIF-208	ENST00000590422	ASPG	Q86U10	573 aa		11.4	□□□□□ -0.58
CTIF-208	ENST00000590422	SLC26A11	Q86WA9	606 aa		11.4	□□□□□ -0.58
CTIF-208	ENST00000590422	NAT8L	Q8N9F0	302 aa		11.4	□□□□□ -0.58
CTIF-208	ENST00000590422	DNAJB8	Q8NHS0	232 aa		11.4	□□□□□ -0.58
CTIF-208	ENST00000590422	SUN3	Q8TAQ9	357 aa		11.4	□□□□□ -0.58
CTIF-208	ENST00000590422	ALKBH8	Q96BT7	664 aa	Known RBP	11.4	□□□□□ -0.58
CTIF-208	ENST00000590422	MOCOS	Q96EN8	888 aa		11.4	□□□□□ -0.58
CTIF-208	ENST00000590422	PEX11G	Q96HA9	241 aa		11.4	□□□□□ -0.58
CTIF-208	ENST00000590422	NAP1L3	Q99457	506 aa	Predicted RBP	11.4	□□□□□ -0.58
CTIF-208	ENST00000590422	SGPP1	Q9BX95	441 aa		11.4	□□□□□ -0.58
CTIF-208	ENST00000590422	KCNK13	Q9HB14	408 aa		11.4	□□□□□ -0.58
CTIF-208	ENST00000590422	ANKH	Q9HCJ1	492 aa		11.4	□□□□□ -0.58
CTIF-208	ENST00000590422	KLHL1	Q9NR64	748 aa		11.4	□□□□□ -0.58
CTIF-208	ENST00000590422	LANCL2	Q9NS86	450 aa		11.4	□□□□□ -0.58
CTIF-208	ENST00000590422	IARS2	Q9NSE4	1012 aa	Known RBP	11.4	□□□□□ -0.58
CTIF-208	ENST00000590422	SUCO	Q9UBS9	1254 aa	Known RBP	11.4	□□□□□ -0.58

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