RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588552.5

PTPRS-206, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type S, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRS, Length 5,443 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRS-206ENST00000588552 NPPAP01160 153 aa15□□□□□ -0.01
PTPRS-206ENST00000588552 CXCR1P25024 350 aa15□□□□□ -0.01
PTPRS-206ENST00000588552 ECHS1P30084 290 aa15□□□□□ -0.01
PTPRS-206ENST00000588552 KCTD21Q4G0X4 260 aa15□□□□□ -0.01
PTPRS-206ENST00000588552 ATCAYQ86WG3 371 aa15□□□□□ -0.01
PTPRS-206ENST00000588552 ZDHHC12Q96GR4 267 aa15□□□□□ -0.01
PTPRS-206ENST00000588552 SLC17A9Q9BYT1 436 aa15□□□□□ -0.01
PTPRS-206ENST00000588552 FBRSQ9HAH7 460 aa15□□□□□ -0.01
PTPRS-206ENST00000588552 USP3Q9Y6I4 520 aa15□□□□□ -0.01
PTPRS-206ENST00000588552 BTN3A3O00478 584 aa15□□□□□ -0.01
PTPRS-206ENST00000588552 JUNDP17535 347 aa15□□□□□ -0.01
PTPRS-206ENST00000588552 MATN1P21941 496 aa15□□□□□ -0.01
PTPRS-206ENST00000588552 HRH2P25021 359 aa15□□□□□ -0.01
PTPRS-206ENST00000588552 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
PTPRS-206ENST00000588552 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
PTPRS-206ENST00000588552 FAM26DQ5JW98 314 aa15□□□□□ -0.01
PTPRS-206ENST00000588552 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
PTPRS-206ENST00000588552 IL17FQ96PD4 163 aa15□□□□□ -0.01
PTPRS-206ENST00000588552 PLGRKTQ9HBL7 147 aa15□□□□□ -0.01
PTPRS-206ENST00000588552 ACTR3BQ9P1U1 418 aa15□□□□□ -0.01
PTPRS-206ENST00000588552 SCDO00767 359 aa15□□□□□ -0.01
PTPRS-206ENST00000588552 SLC30A4O14863 429 aa15□□□□□ -0.01
PTPRS-206ENST00000588552 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
PTPRS-206ENST00000588552 PRSS56P0CW18 603 aa15□□□□□ -0.01
PTPRS-206ENST00000588552 ARSAP15289 507 aa15□□□□□ -0.01
PTPRS-206ENST00000588552 CKMT2P17540 419 aa15□□□□□ -0.01
PTPRS-206ENST00000588552 CASRP41180 1078 aa15□□□□□ -0.01
PTPRS-206ENST00000588552 DENND5AQ6IQ26 1287 aa15□□□□□ -0.01
PTPRS-206ENST00000588552 HTR3DQ70Z44 454 aa15□□□□□ -0.01
PTPRS-206ENST00000588552 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
PTPRS-206ENST00000588552 SLC25A36Q96CQ1 311 aa15□□□□□ -0.01
PTPRS-206ENST00000588552 MTG2Q9H4K7 406 aa15□□□□□ -0.01
PTPRS-206ENST00000588552 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
PTPRS-206ENST00000588552 GPR34Q9UPC5 381 aa15□□□□□ -0.01
PTPRS-206ENST00000588552 H3BNX3 289 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRS-206ENST00000588552 H1F0P07305 194 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
PTPRS-206ENST00000588552 ASGR2P07307 311 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRS-206ENST00000588552 OR2T5Q6IEZ7 315 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRS-206ENST00000588552 TMEM126BQ8IUX1 230 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRS-206ENST00000588552 OR4K1Q8NGD4 311 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRS-206ENST00000588552 OR2T29Q8NH02 315 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRS-206ENST00000588552 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
PTPRS-206ENST00000588552 SLC46A2Q9BY10 475 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRS-206ENST00000588552 OAZ3Q9UMX2 235 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRS-206ENST00000588552 OR1A2Q9Y585 309 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRS-206ENST00000588552 SPO11Q9Y5K1 396 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRS-206ENST00000588552 FAM92AA1XBS5 289 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRS-206ENST00000588552 ABLIM1O14639 778 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRS-206ENST00000588552 CREG1O75629 220 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRS-206ENST00000588552 RPS6KA3P51812 740 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRS-206ENST00000588552 GSTM4Q03013 218 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRS-206ENST00000588552 DECR1Q16698 335 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRS-206ENST00000588552 LAPTM4BQ86VI4 370 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRS-206ENST00000588552 OR10H4Q8NGA5 316 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRS-206ENST00000588552 FAM3CQ92520 227 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRS-206ENST00000588552 BOCQ9BWV1 1114 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRS-206ENST00000588552 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
PTPRS-206ENST00000588552 CD207Q9UJ71 328 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRS-206ENST00000588552 SCN7AQ01118 1682 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRS-206ENST00000588552 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRS-206ENST00000588552 ADAM12O43184 909 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRS-206ENST00000588552 XKP51811 444 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRS-206ENST00000588552 ID2Q02363 134 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRS-206ENST00000588552 RNF130Q86XS8 419 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRS-206ENST00000588552 GPER1Q99527 375 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRS-206ENST00000588552 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
PTPRS-206ENST00000588552 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRS-206ENST00000588552 WASH4PA8MWX3 477 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRS-206ENST00000588552 CAPN14A8MX76 684 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRS-206ENST00000588552 SDHDO14521 159 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRS-206ENST00000588552 ZNF823P16415 610 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRS-206ENST00000588552 ATF6P18850 670 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRS-206ENST00000588552 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
PTPRS-206ENST00000588552 OR4D1Q15615 310 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRS-206ENST00000588552 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
PTPRS-206ENST00000588552 USP30Q70CQ3 517 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRS-206ENST00000588552 ASPGQ86U10 573 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRS-206ENST00000588552 CPXM2Q8N436 756 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRS-206ENST00000588552 TMBIM1Q969X1 311 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRS-206ENST00000588552 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
PTPRS-206ENST00000588552 SERINC1Q9NRX5 453 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRS-206ENST00000588552 ATXN10Q9UBB4 475 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRS-206ENST00000588552 PCDHGA12O60330 932 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRS-206ENST00000588552 MERTKQ12866 999 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRS-206ENST00000588552 CCNIQ14094 377 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRS-206ENST00000588552 ZNF846Q147U1 533 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRS-206ENST00000588552 FBXO43Q4G163 708 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRS-206ENST00000588552 ZNF542PQ5EBM4 170 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRS-206ENST00000588552 PYURFQ96I23 114 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRS-206ENST00000588552 FAM221BA6H8Z2 402 aa14.98□□□□□ -0.01
PTPRS-206ENST00000588552 LAMTOR5O43504 91 aa14.98□□□□□ -0.01
PTPRS-206ENST00000588552 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
PTPRS-206ENST00000588552 ACADLP28330 430 aa14.98□□□□□ -0.01
PTPRS-206ENST00000588552 MOCOSQ96EN8 888 aa14.98□□□□□ -0.01
PTPRS-206ENST00000588552 RNF31Q96EP0 1072 aa14.98□□□□□ -0.01
PTPRS-206ENST00000588552 CCDC182A6NF36 153 aa14.98□□□□□ -0.01
PTPRS-206ENST00000588552 TRMUO75648 421 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
PTPRS-206ENST00000588552 JUPP14923 745 aa14.98□□□□□ -0.01
PTPRS-206ENST00000588552 ACVR2AP27037 513 aa14.98□□□□□ -0.01
PTPRS-206ENST00000588552 ABATP80404 500 aa14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.2 ms