RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588340.1

EFTUD2-210, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 4

Gene EFTUD2, Length 595 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-210ENST00000588340 SHBGP04278 402 aa6.53□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 SBK3P0C264 359 aa6.53□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 CCDC166P0CW27 439 aa6.53□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 NPPBP16860 134 aa6.53□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 EPORP19235 508 aa6.53□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 MMP11P24347 488 aa6.53□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 CCND1P24385 295 aa6.53□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 HRH2P25021 359 aa6.53□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 GMPRP36959 345 aa6.53□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 HSD17B3P37058 310 aa6.53□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 OR1D4P47884 311 aa6.53□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 HNMTP50135 292 aa6.53□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 SERPINB8P50452 374 aa6.53□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 SOX8P57073 446 aa6.53□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 BMPR2Q13873 1038 aa6.53□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 MYBPC3Q14896 1274 aa6.53□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 TGFBIQ15582 683 aa6.53□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 OR4D1Q15615 310 aa6.53□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 TSNQ15631 228 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 PRTGQ2VWP7 1150 aa6.53□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 TECRLQ5HYJ1 363 aa6.53□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa6.53□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 ICE2Q659A1 982 aa6.53□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 SLC6A19Q695T7 634 aa6.53□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 PRMT9Q6P2P2 845 aa6.53□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 AGTRAPQ6RW13 159 aa6.53□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 LCTLQ6UWM7 567 aa6.53□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 CLEC18BQ6UXF7 455 aa6.53□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa6.53□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa6.53□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 ATCAYQ86WG3 371 aa6.53□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 PAQR7Q86WK9 346 aa6.53□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 CTAGE3PQ8IX95 158 aa6.53□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 IQCKQ8N0W5 287 aa6.53□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 DTWD1Q8N5C7 304 aa6.53□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 Q8NA96 180 aa6.53□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 CLEC18CQ8NCF0 446 aa6.53□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 PPFIBP2Q8ND30 876 aa6.53□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 CPT1CQ8TCG5 803 aa6.53□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 ACMSDQ8TDX5 336 aa6.53□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 MTBPQ96DY7 904 aa6.53□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 WDR34Q96EX3 536 aa6.53□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 PLCD4Q9BRC7 762 aa6.53□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 TMEM79Q9BSE2 394 aa6.53□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa6.53□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 PCBD2Q9H0N5 130 aa6.53□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 ZNF304Q9HCX3 659 aa6.53□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa6.53□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 MKS1Q9NXB0 559 aa6.53□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 TXNDC16Q9P2K2 825 aa6.53□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 CTSFQ9UBX1 484 aa6.53□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 TAC3Q9UHF0 121 aa6.53□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 LGALS13Q9UHV8 139 aa6.53□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 ACOT9Q9Y305 439 aa6.53□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 MAU2Q9Y6X3 613 aa6.53□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa6.53□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 NAV2Q8IVL1 2488 aa6.53□□□□□ -1.36
EFTUD2-210ENST00000588340 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 A0A096LPK6 155 aa6.52□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa6.52□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa6.52□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 VSTM2BA6NLU5 285 aa6.52□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 SOCS6O14544 535 aa6.52□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 TAPBPO15533 448 aa6.52□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 KLHL41O60662 606 aa6.52□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 PRAMEF4O60810 478 aa6.52□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 VPS4BO75351 444 aa6.52□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 IPO13O94829 963 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 CCNDBP1O95273 360 aa6.52□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 SYF2O95926 243 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 ALPPP05187 535 aa6.52□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 INHBAP08476 426 aa6.52□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 CASP2P42575 452 aa6.52□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 TBPL1P62380 186 aa6.52□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 IRF9Q00978 393 aa6.52□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 SLC18A2Q05940 514 aa6.52□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP6.52□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 ACAP2Q15057 778 aa6.52□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 MUM1Q2TAK8 710 aa6.52□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 MROH9Q5TGP6 573 aa6.52□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa6.52□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 KIRREL2Q6UWL6 708 aa6.52□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 IGFL3Q6UXB1 125 aa6.52□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 VN1R4Q7Z5H5 301 aa6.52□□□□□ -1.37
EFTUD2-210ENST00000588340 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.2 ms