RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586792.5

ZNF540-204, Transcript of zinc finger protein 540, human

TSL 3 BASIC

Gene ZNF540, Length 564 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ZNF540-204	ENST00000586792	MTRF1	O75570	445 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
ZNF540-204	ENST00000586792	PIGN	O95427	931 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ZNF540-204	ENST00000586792	ITGA5	P08648	1049 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ZNF540-204	ENST00000586792	CSF1	P09603	554 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ZNF540-204	ENST00000586792	ALPPL2	P10696	532 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ZNF540-204	ENST00000586792	ZFX	P17010	805 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
ZNF540-204	ENST00000586792	DRD4	P21917	467 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ZNF540-204	ENST00000586792	CTNNA2	P26232	953 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ZNF540-204	ENST00000586792	IL1R2	P27930	398 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ZNF540-204	ENST00000586792	GK	P32189	559 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ZNF540-204	ENST00000586792	CETN2	P41208	172 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ZNF540-204	ENST00000586792	SLC1A1	P43005	524 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ZNF540-204	ENST00000586792	MAGEA1	P43355	309 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ZNF540-204	ENST00000586792	RABIF	P47224	123 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ZNF540-204	ENST00000586792	ZNF75D	P51815	510 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ZNF540-204	ENST00000586792	METAP1	P53582	386 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ZNF540-204	ENST00000586792	IL9R	Q01113	521 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ZNF540-204	ENST00000586792	SLC25A11	Q02978	314 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
ZNF540-204	ENST00000586792	KHDRBS1	Q07666	443 aa	Known RBP eCLIP	4.59	□□□□□ -1.67
ZNF540-204	ENST00000586792	ACTN3	Q08043	901 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
ZNF540-204	ENST00000586792	TP53BP1	Q12888	1972 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
ZNF540-204	ENST00000586792	CBX3	Q13185	183 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ZNF540-204	ENST00000586792	DYRK1A	Q13627	763 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ZNF540-204	ENST00000586792	DPYS	Q14117	519 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ZNF540-204	ENST00000586792	GPR68	Q15743	365 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ZNF540-204	ENST00000586792	ZSCAN26	Q16670	478 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ZNF540-204	ENST00000586792	PLAC9	Q5JTB6	97 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ZNF540-204	ENST00000586792	LRRC73	Q5JTD7	316 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ZNF540-204	ENST00000586792	MARC1	Q5VT66	337 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ZNF540-204	ENST00000586792	SEL1L3	Q68CR1	1132 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ZNF540-204	ENST00000586792	BRAT1	Q6PJG6	821 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ZNF540-204	ENST00000586792	PIWIL3	Q7Z3Z3	882 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
ZNF540-204	ENST00000586792	KIAA1328	Q86T90	577 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ZNF540-204	ENST00000586792	LRRC49	Q8IUZ0	686 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ZNF540-204	ENST00000586792	RHOT1	Q8IXI2	618 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ZNF540-204	ENST00000586792	ARFGAP1	Q8N6T3	406 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ZNF540-204	ENST00000586792	NPW	Q8N729	165 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ZNF540-204	ENST00000586792	POMGNT2	Q8NAT1	580 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ZNF540-204	ENST00000586792	CCNY	Q8ND76	341 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ZNF540-204	ENST00000586792	NLGN4Y	Q8NFZ3	816 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
ZNF540-204	ENST00000586792	MIPOL1	Q8TD10	442 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ZNF540-204	ENST00000586792	HCAR2	Q8TDS4	363 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ZNF540-204	ENST00000586792	STYX	Q8WUJ0	223 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ZNF540-204	ENST00000586792	C17orf50	Q8WW18	174 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ZNF540-204	ENST00000586792	KLK6	Q92876	244 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ZNF540-204	ENST00000586792	PTP4A1	Q93096	173 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ZNF540-204	ENST00000586792	FAM162A	Q96A26	154 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ZNF540-204	ENST00000586792	FAM131C	Q96AQ9	280 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ZNF540-204	ENST00000586792	EID2B	Q96D98	161 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ZNF540-204	ENST00000586792	ZNF641	Q96N77	438 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
ZNF540-204	ENST00000586792	PSKH2	Q96QS6	385 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ZNF540-204	ENST00000586792	PCDH15	Q96QU1	1955 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ZNF540-204	ENST00000586792	ATP6V0B	Q99437	205 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ZNF540-204	ENST00000586792	CHP1	Q99653	195 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ZNF540-204	ENST00000586792	SH3GL3	Q99963	347 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ZNF540-204	ENST00000586792	FERMT1	Q9BQL6	677 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ZNF540-204	ENST00000586792	WRAP53	Q9BUR4	548 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
ZNF540-204	ENST00000586792	PACSIN1	Q9BY11	444 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ZNF540-204	ENST00000586792	SLC17A9	Q9BYT1	436 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ZNF540-204	ENST00000586792	ZFHX2	Q9C0A1	2572 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
ZNF540-204	ENST00000586792	POLR1E	Q9GZS1	481 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
ZNF540-204	ENST00000586792	FAM107B	Q9H098	131 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ZNF540-204	ENST00000586792	PDF	Q9HBH1	243 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ZNF540-204	ENST00000586792	NOD2	Q9HC29	1040 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ZNF540-204	ENST00000586792	FZD3	Q9NPG1	666 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ZNF540-204	ENST00000586792	ACTR3B	Q9P1U1	418 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ZNF540-204	ENST00000586792	LHX3	Q9UBR4	397 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ZNF540-204	ENST00000586792	ANGPTL2	Q9UKU9	493 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ZNF540-204	ENST00000586792	EDAR	Q9UNE0	448 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ZNF540-204	ENST00000586792	CAMK2A	Q9UQM7	478 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ZNF540-204	ENST00000586792	MAN2B2	Q9Y2E5	1009 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ZNF540-204	ENST00000586792	KLHL20	Q9Y2M5	609 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ZNF540-204	ENST00000586792	MFHAS1	Q9Y4C4	1052 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ZNF540-204	ENST00000586792	FADS3	Q9Y5Q0	445 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ZNF540-204	ENST00000586792	LYVE1	Q9Y5Y7	322 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ZNF540-204	ENST00000586792	ACTL7A	Q9Y615	435 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ZNF540-204	ENST00000586792	CFAP20	Q9Y6A4	193 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
ZNF540-204	ENST00000586792		V9GYY5	206 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
ZNF540-204	ENST00000586792	MYO18A	Q92614	2054 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
ZNF540-204	ENST00000586792	UQCRHL	A0A096LP55	91 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ZNF540-204	ENST00000586792	ARPC4-TTLL3	A0A0A6YYG9	625 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ZNF540-204	ENST00000586792		A0A0G2JPF8	293 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ZNF540-204	ENST00000586792	RNF103-CHMP3	A0A140T963	221 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ZNF540-204	ENST00000586792		A0A1B0GTQ1	180 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ZNF540-204	ENST00000586792	SPAAR	A0A1B0GVQ0	90 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ZNF540-204	ENST00000586792	MACROD2	A1Z1Q3	448 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ZNF540-204	ENST00000586792	CDHR4	A6H8M9	788 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ZNF540-204	ENST00000586792	NEMP2	A6NFY4	417 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ZNF540-204	ENST00000586792	HNRNPCL3	B7ZW38	293 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ZNF540-204	ENST00000586792		F8W8V4	182 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ZNF540-204	ENST00000586792	RNF103	O00237	685 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ZNF540-204	ENST00000586792	PGRMC2	O15173	223 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ZNF540-204	ENST00000586792	POLR3G	O15318	223 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
ZNF540-204	ENST00000586792	PSTPIP1	O43586	416 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ZNF540-204	ENST00000586792	MFSD11	O43934	449 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ZNF540-204	ENST00000586792	ZNF821	O75541	412 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
ZNF540-204	ENST00000586792	PAK4	O96013	591 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
ZNF540-204	ENST00000586792	TK1	P04183	234 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ZNF540-204	ENST00000586792	UQCRH	P07919	91 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ZNF540-204	ENST00000586792	HNRNPCL4	P0DMR1	293 aa		4.58	□□□□□ -1.68

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