RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000582955.5

SMARCE1-218, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 5

Gene SMARCE1, Length 621 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-218ENST00000582955 MIEF2Q96C03 454 aa11.98□□□□□ -0.49
SMARCE1-218ENST00000582955 TM4SF19Q96DZ7 209 aa11.98□□□□□ -0.49
SMARCE1-218ENST00000582955 ATOH8Q96SQ7 321 aa11.98□□□□□ -0.49
SMARCE1-218ENST00000582955 SPSB2Q99619 263 aa11.98□□□□□ -0.49
SMARCE1-218ENST00000582955 CAPS2Q9BXY5 557 aa11.98□□□□□ -0.49
SMARCE1-218ENST00000582955 ING2Q9H160 280 aa11.98□□□□□ -0.49
SMARCE1-218ENST00000582955 SLC26A1Q9H2B4 701 aa11.98□□□□□ -0.49
SMARCE1-218ENST00000582955 SPNS1Q9H2V7 528 aa11.98□□□□□ -0.49
SMARCE1-218ENST00000582955 TRPC4Q9UBN4 977 aa11.98□□□□□ -0.49
SMARCE1-218ENST00000582955 TUBD1Q9UJT1 453 aa11.98□□□□□ -0.49
SMARCE1-218ENST00000582955 ZNF180Q9UJW8 692 aa11.98□□□□□ -0.49
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SMARCE1-218ENST00000582955 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
SMARCE1-218ENST00000582955 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa11.97□□□□□ -0.49
SMARCE1-218ENST00000582955 TRIM49D1C9J1S8 452 aa11.97□□□□□ -0.49
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SMARCE1-218ENST00000582955 FOXS1O43638 330 aa11.97□□□□□ -0.49
SMARCE1-218ENST00000582955 KLHL2O95198 593 aa11.97□□□□□ -0.49
SMARCE1-218ENST00000582955 ZGLP1P0C6A0 271 aa11.97□□□□□ -0.49
SMARCE1-218ENST00000582955 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa11.97□□□□□ -0.49
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SMARCE1-218ENST00000582955 SCTRP47872 440 aa11.97□□□□□ -0.49
SMARCE1-218ENST00000582955 CSRP3P50461 194 aa11.97□□□□□ -0.49
SMARCE1-218ENST00000582955 CCL11P51671 97 aa11.97□□□□□ -0.49
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SMARCE1-218ENST00000582955 C19orf57Q0VDD7 668 aa11.97□□□□□ -0.49
SMARCE1-218ENST00000582955 FAM53BQ14153 422 aa11.97□□□□□ -0.49
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SMARCE1-218ENST00000582955 ACAP2Q15057 778 aa11.97□□□□□ -0.49
SMARCE1-218ENST00000582955 PDK4Q16654 411 aa11.97□□□□□ -0.49
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SMARCE1-218ENST00000582955 LGSNQ5TDP6 509 aa11.97□□□□□ -0.49
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SMARCE1-218ENST00000582955 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa11.97□□□□□ -0.49
SMARCE1-218ENST00000582955 PRSS41Q7RTY9 318 aa11.97□□□□□ -0.49
SMARCE1-218ENST00000582955 ZNF843Q8N446 348 aa11.97□□□□□ -0.49
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SMARCE1-218ENST00000582955 STT3BQ8TCJ2 826 aa11.97□□□□□ -0.49
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SMARCE1-218ENST00000582955 ABHD17AQ96GS6 310 aa11.97□□□□□ -0.49
SMARCE1-218ENST00000582955 IP6K3Q96PC2 410 aa11.97□□□□□ -0.49
SMARCE1-218ENST00000582955 CRB3Q9BUF7 120 aa11.97□□□□□ -0.49
SMARCE1-218ENST00000582955 SARGQ9BW04 601 aa11.97□□□□□ -0.49
SMARCE1-218ENST00000582955 TRIM55Q9BYV6 548 aa11.97□□□□□ -0.49
SMARCE1-218ENST00000582955 TXLNGYQ9BZA5 131 aa11.97□□□□□ -0.49
SMARCE1-218ENST00000582955 SLC25A18Q9H1K4 315 aa11.97□□□□□ -0.49
SMARCE1-218ENST00000582955 ANKHQ9HCJ1 492 aa11.97□□□□□ -0.49
SMARCE1-218ENST00000582955 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP11.97□□□□□ -0.49
SMARCE1-218ENST00000582955 GPRC5BQ9NZH0 403 aa11.97□□□□□ -0.49
SMARCE1-218ENST00000582955 ZFP69BQ9UJL9 534 aa11.97□□□□□ -0.49
SMARCE1-218ENST00000582955 CCDC88CQ9P219 2028 aa11.96□□□□□ -0.49
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SMARCE1-218ENST00000582955 GFAPP14136 432 aa11.96□□□□□ -0.49
SMARCE1-218ENST00000582955 MMP11P24347 488 aa11.96□□□□□ -0.49
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SMARCE1-218ENST00000582955 AHRP35869 848 aa11.96□□□□□ -0.49
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SMARCE1-218ENST00000582955 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.49
SMARCE1-218ENST00000582955 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.49
SMARCE1-218ENST00000582955 KLC1Q07866 573 aa11.96□□□□□ -0.49
SMARCE1-218ENST00000582955 PWP1Q13610 501 aa11.96□□□□□ -0.49
SMARCE1-218ENST00000582955 SLC29A2Q14542 456 aa11.96□□□□□ -0.49
SMARCE1-218ENST00000582955 RBBP7Q16576 425 aa11.96□□□□□ -0.49
SMARCE1-218ENST00000582955 XKR6Q5GH73 641 aa11.96□□□□□ -0.49
SMARCE1-218ENST00000582955 ATG9BQ674R7 924 aa11.96□□□□□ -0.49
SMARCE1-218ENST00000582955 MED25Q71SY5 747 aa11.96□□□□□ -0.49
SMARCE1-218ENST00000582955 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa11.96□□□□□ -0.49
SMARCE1-218ENST00000582955 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa11.96□□□□□ -0.49
SMARCE1-218ENST00000582955 KRT78Q8N1N4 520 aa11.96□□□□□ -0.49
SMARCE1-218ENST00000582955 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.49
SMARCE1-218ENST00000582955 AMER3Q8N944 861 aa11.96□□□□□ -0.49
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SMARCE1-218ENST00000582955 ANKRD53Q8N9V6 530 aa11.96□□□□□ -0.49
SMARCE1-218ENST00000582955 TRPV3Q8NET8 790 aa11.96□□□□□ -0.49
SMARCE1-218ENST00000582955 RHEBL1Q8TAI7 183 aa11.96□□□□□ -0.49
SMARCE1-218ENST00000582955 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.49
SMARCE1-218ENST00000582955 ISL2Q96A47 359 aa11.96□□□□□ -0.49
SMARCE1-218ENST00000582955 SCYL1Q96KG9 808 aa11.96□□□□□ -0.49
SMARCE1-218ENST00000582955 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa11.96□□□□□ -0.49
SMARCE1-218ENST00000582955 CD244Q9BZW8 370 aa11.96□□□□□ -0.49
SMARCE1-218ENST00000582955 PRM3Q9NNZ6 103 aa11.96□□□□□ -0.49
SMARCE1-218ENST00000582955 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.49
SMARCE1-218ENST00000582955 SEMA3GQ9NS98 782 aa11.96□□□□□ -0.49
SMARCE1-218ENST00000582955 P4HTMQ9NXG6 502 aa11.96□□□□□ -0.49
SMARCE1-218ENST00000582955 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.49
SMARCE1-218ENST00000582955 OPTCQ9UBM4 332 aa11.96□□□□□ -0.49
SMARCE1-218ENST00000582955 C3orf18Q9UK00 162 aa11.96□□□□□ -0.49
SMARCE1-218ENST00000582955 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa11.96□□□□□ -0.49
SMARCE1-218ENST00000582955 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa11.95□□□□□ -0.5
SMARCE1-218ENST00000582955 CCDC189A1A4V9 331 aa11.95□□□□□ -0.5
SMARCE1-218ENST00000582955 A6NL46 340 aa11.95□□□□□ -0.5
SMARCE1-218ENST00000582955 K7EPI3 171 aa11.95□□□□□ -0.5
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