RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577468.2

PTPRM-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-204ENST00000577468 FGL2Q14314 439 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 MVPQ14764 893 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 PCLAFQ15004 111 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 EMC2Q15006 297 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 LTB4RQ15722 352 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 SGCBQ16585 318 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 TAZQ16635 292 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 PHKG1Q16816 387 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 CRY2Q49AN0 593 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP2.95□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 BEND3Q5T5X7 828 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 ALS2CLQ60I27 953 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 PLCXD3Q63HM9 321 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 LRRC66Q68CR7 880 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 WBP2NLQ6ICG8 309 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 JADE1Q6IE81 842 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 OR52E8Q6IFG1 317 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 OR6B2Q6IFH4 312 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP2.95□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 LRRC8BQ6P9F7 803 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 BHLHB9Q6PI77 547 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 KCTD8Q6ZWB6 473 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 USP43Q70EL4 1123 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 OTOP1Q7RTM1 612 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 TAS1R1Q7RTX1 841 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 ADCK2Q7Z695 626 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP2.95□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP2.95□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 TMC8Q8IU68 726 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 FAM185AQ8N0U4 392 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 CLYBLQ8N0X4 340 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 THEM5Q8N1Q8 247 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 UBE2J2Q8N2K1 259 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 LNX2Q8N448 690 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 SLC15A4Q8N697 577 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 CNBD1Q8NA66 436 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 SLC37A3Q8NCC5 494 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 OR4C15Q8NGM1 316 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 OR5M3Q8NGP4 307 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 OR10T2Q8NGX3 314 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 OR6Y1Q8NGX8 325 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 OR10J5Q8NHC4 309 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP2.95□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 DNAJB14Q8TBM8 379 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 MAFIPQ8WZ33 124 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 TRIB2Q92519 343 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 ELMO1Q92556 727 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP2.95□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 MCUR1Q96AQ8 359 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 S100PBPQ96BU1 408 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 HAVCR1Q96D42 359 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 TMCO6Q96DC7 493 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 LINGO1Q96FE5 620 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 C5orf30Q96GV9 206 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 FBXL20Q96IG2 436 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 BOD1Q96IK1 185 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 PBKQ96KB5 322 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP2.95□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF285Q96NJ3 590 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 DGAT2Q96PD7 388 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 PCYT2Q99447 389 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 CHP1Q99653 195 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 C17orf62Q9BQA9 187 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 BOCQ9BWV1 1114 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 DGCR6LQ9BY27 220 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 ANGPTL4Q9BY76 406 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 PRRG3Q9BZD7 231 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP2.95□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP2.95□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 METTL9Q9H1A3 318 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 LRRN3Q9H3W5 708 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 C11orf49Q9H6J7 331 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 AUNIPQ9H7T9 357 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 KAT14Q9H8E8 782 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 COG4Q9H9E3 785 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 SMURF2Q9HAU4 748 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP2.95□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP2.95□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF302Q9NR11 478 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 ACSS2Q9NR19 701 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 SLC6A13Q9NSD5 602 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 TREX1Q9NSU2 369 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 ZFP57Q9NU63 452 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 LRIT1Q9P2V4 623 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 SERGEFQ9UGK8 458 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 SCOCQ9UIL1 159 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 OSGIN1Q9UJX0 560 aa2.95□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.7 ms