RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000565975.5

SPNS1-207, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS1, Length 1,979 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-207ENST00000565975 THAP11Q96EK4 314 aa21.5■■□□□ 1.03
SPNS1-207ENST00000565975 LRRC3BQ96PB8 259 aa21.5■■□□□ 1.03
SPNS1-207ENST00000565975 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
SPNS1-207ENST00000565975 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
SPNS1-207ENST00000565975 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa21.5■■□□□ 1.03
SPNS1-207ENST00000565975 NPPBP16860 134 aa21.5■■□□□ 1.03
SPNS1-207ENST00000565975 AGXTP21549 392 aa21.5■■□□□ 1.03
SPNS1-207ENST00000565975 DPTQ07507 201 aa21.5■■□□□ 1.03
SPNS1-207ENST00000565975 TCEAL5Q5H9L2 206 aa21.5■■□□□ 1.03
SPNS1-207ENST00000565975 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
SPNS1-207ENST00000565975 OR8D1Q8WZ84 308 aa21.5■■□□□ 1.03
SPNS1-207ENST00000565975 ARRDC3Q96B67 414 aa21.5■■□□□ 1.03
SPNS1-207ENST00000565975 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
SPNS1-207ENST00000565975 REEP4Q9H6H4 257 aa21.5■■□□□ 1.03
SPNS1-207ENST00000565975 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa21.49■■□□□ 1.03
SPNS1-207ENST00000565975 JRKO75564 520 aa21.49■■□□□ 1.03
SPNS1-207ENST00000565975 RPL3P39023 403 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
SPNS1-207ENST00000565975 STT3AP46977 705 aa21.49■■□□□ 1.03
SPNS1-207ENST00000565975 CXCR4P61073 352 aa21.49■■□□□ 1.03
SPNS1-207ENST00000565975 ZNF763Q0D2J5 394 aa21.49■■□□□ 1.03
SPNS1-207ENST00000565975 NFATC3Q12968 1075 aa21.49■■□□□ 1.03
SPNS1-207ENST00000565975 RAPSNQ13702 412 aa21.49■■□□□ 1.03
SPNS1-207ENST00000565975 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP21.49■■□□□ 1.03
SPNS1-207ENST00000565975 RGNQ15493 299 aa21.49■■□□□ 1.03
SPNS1-207ENST00000565975 TEAD4Q15561 434 aa21.49■■□□□ 1.03
SPNS1-207ENST00000565975 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
SPNS1-207ENST00000565975 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa21.49■■□□□ 1.03
SPNS1-207ENST00000565975 VTCN1Q7Z7D3 282 aa21.49■■□□□ 1.03
SPNS1-207ENST00000565975 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa21.49■■□□□ 1.03
SPNS1-207ENST00000565975 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP21.49■■□□□ 1.03
SPNS1-207ENST00000565975 NODALQ96S42 347 aa21.49■■□□□ 1.03
SPNS1-207ENST00000565975 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
SPNS1-207ENST00000565975 TRIM39Q9HCM9 518 aa21.49■■□□□ 1.03
SPNS1-207ENST00000565975 RWDD3Q9Y3V2 267 aa21.49■■□□□ 1.03
SPNS1-207ENST00000565975 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa21.49■■□□□ 1.03
SPNS1-207ENST00000565975 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa21.48■■□□□ 1.03
SPNS1-207ENST00000565975 hCG_2039718K7EN88 272 aa21.48■■□□□ 1.03
SPNS1-207ENST00000565975 MITFO75030 526 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
SPNS1-207ENST00000565975 FKBP9O95302 570 aa21.48■■□□□ 1.03
SPNS1-207ENST00000565975 GPR1P46091 355 aa21.48■■□□□ 1.03
SPNS1-207ENST00000565975 RXRGP48443 463 aa21.48■■□□□ 1.03
SPNS1-207ENST00000565975 FGD3Q5JSP0 725 aa21.48■■□□□ 1.03
SPNS1-207ENST00000565975 XKR5Q6UX68 686 aa21.48■■□□□ 1.03
SPNS1-207ENST00000565975 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa21.48■■□□□ 1.03
SPNS1-207ENST00000565975 GPR156Q8NFN8 814 aa21.48■■□□□ 1.03
SPNS1-207ENST00000565975 SGCDQ92629 289 aa21.48■■□□□ 1.03
SPNS1-207ENST00000565975 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
SPNS1-207ENST00000565975 OR2AG1Q9H205 316 aa21.48■■□□□ 1.03
SPNS1-207ENST00000565975 REEP1Q9H902 201 aa21.48■■□□□ 1.03
SPNS1-207ENST00000565975 DMRT3Q9NQL9 472 aa21.48■■□□□ 1.03
SPNS1-207ENST00000565975 ATAD3AQ9NVI7 634 aa21.48■■□□□ 1.03
SPNS1-207ENST00000565975 ADPRHL2Q9NX46 363 aa21.48■■□□□ 1.03
SPNS1-207ENST00000565975 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
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SPNS1-207ENST00000565975 COQ6Q9Y2Z9 468 aa21.48■■□□□ 1.03
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SPNS1-207ENST00000565975 C16orf72Q14CZ0 275 aa21.48■■□□□ 1.03
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SPNS1-207ENST00000565975 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
SPNS1-207ENST00000565975 OR4A15Q8NGL6 344 aa21.48■■□□□ 1.03
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SPNS1-207ENST00000565975 DPEP2Q9H4A9 486 aa21.48■■□□□ 1.03
SPNS1-207ENST00000565975 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
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SPNS1-207ENST00000565975 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa21.48■■□□□ 1.03
SPNS1-207ENST00000565975 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
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SPNS1-207ENST00000565975 TLL1O43897 1013 aa21.47■■□□□ 1.03
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SPNS1-207ENST00000565975 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
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SPNS1-207ENST00000565975 PLA2G16P53816 162 aa21.47■■□□□ 1.03
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SPNS1-207ENST00000565975 C9orf64Q5T6V5 341 aa21.47■■□□□ 1.03
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SPNS1-207ENST00000565975 C11orf65Q8NCR3 313 aa21.47■■□□□ 1.03
SPNS1-207ENST00000565975 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa21.47■■□□□ 1.03
SPNS1-207ENST00000565975 TBC1D15Q8TC07 691 aa21.47■■□□□ 1.03
SPNS1-207ENST00000565975 SLC5A11Q8WWX8 675 aa21.47■■□□□ 1.03
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SPNS1-207ENST00000565975 C7orf34Q96L11 122 aa21.47■■□□□ 1.03
SPNS1-207ENST00000565975 EPYCQ99645 322 aa21.47■■□□□ 1.03
SPNS1-207ENST00000565975 APOL4Q9BPW4 351 aa21.47■■□□□ 1.03
SPNS1-207ENST00000565975 RIBC2Q9H4K1 309 aa21.47■■□□□ 1.03
SPNS1-207ENST00000565975 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
SPNS1-207ENST00000565975 SH3BP4Q9P0V3 963 aa21.47■■□□□ 1.03
SPNS1-207ENST00000565975 DPP7Q9UHL4 492 aa21.47■■□□□ 1.03
SPNS1-207ENST00000565975 PSME2Q9UL46 239 aa21.47■■□□□ 1.03
SPNS1-207ENST00000565975 VEGFDO43915 354 aa21.47■■□□□ 1.03
SPNS1-207ENST00000565975 ANGPTL1O95841 491 aa21.47■■□□□ 1.03
SPNS1-207ENST00000565975 C9P02748 559 aa21.47■■□□□ 1.03
SPNS1-207ENST00000565975 C6P13671 934 aa21.47■■□□□ 1.03
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