RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558831.5

USP3-AS1-201, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP3-AS1, Length 1,784 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-201ENST00000558831 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP16.51■□□□□ 0.23
USP3-AS1-201ENST00000558831 PARP9Q8IXQ6 854 aa16.51■□□□□ 0.23
USP3-AS1-201ENST00000558831 TTLQ8NG68 377 aa16.51■□□□□ 0.23
USP3-AS1-201ENST00000558831 KLHL29Q96CT2 875 aa16.51■□□□□ 0.23
USP3-AS1-201ENST00000558831 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP16.51■□□□□ 0.23
USP3-AS1-201ENST00000558831 SLC22A3O75751 556 aa16.5■□□□□ 0.23
USP3-AS1-201ENST00000558831 SERPINB1P30740 379 aa16.5■□□□□ 0.23
USP3-AS1-201ENST00000558831 BCL6P41182 706 aa16.5■□□□□ 0.23
USP3-AS1-201ENST00000558831 GPR3P46089 330 aa16.5■□□□□ 0.23
USP3-AS1-201ENST00000558831 MNAT1P51948 309 aa16.5■□□□□ 0.23
USP3-AS1-201ENST00000558831 UFM1P61960 85 aa16.5■□□□□ 0.23
USP3-AS1-201ENST00000558831 CYP4F3Q08477 520 aa16.5■□□□□ 0.23
USP3-AS1-201ENST00000558831 SLC5A12Q1EHB4 618 aa16.5■□□□□ 0.23
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZNF425Q6IV72 752 aa16.5■□□□□ 0.23
USP3-AS1-201ENST00000558831 FIGLAQ6QHK4 219 aa16.5■□□□□ 0.23
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZNF438Q7Z4V0 828 aa16.5■□□□□ 0.23
USP3-AS1-201ENST00000558831 VN1R5Q7Z5H4 357 aa16.5■□□□□ 0.23
USP3-AS1-201ENST00000558831 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP16.5■□□□□ 0.23
USP3-AS1-201ENST00000558831 PPM1MQ96MI6 270 aa16.5■□□□□ 0.23
USP3-AS1-201ENST00000558831 EBPLQ9BY08 206 aa16.5■□□□□ 0.23
USP3-AS1-201ENST00000558831 SEMA4GQ9NTN9 838 aa16.5■□□□□ 0.23
USP3-AS1-201ENST00000558831 EVA1BQ9NVM1 165 aa16.5■□□□□ 0.23
USP3-AS1-201ENST00000558831 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa16.5■□□□□ 0.23
USP3-AS1-201ENST00000558831 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP16.5■□□□□ 0.23
USP3-AS1-201ENST00000558831 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP16.5■□□□□ 0.23
USP3-AS1-201ENST00000558831 A0A0J9YY10 115 aa16.49■□□□□ 0.23
USP3-AS1-201ENST00000558831 C9JVG2 144 aa16.49■□□□□ 0.23
USP3-AS1-201ENST00000558831 NPIPB8E9PQR5 432 aa16.49■□□□□ 0.23
USP3-AS1-201ENST00000558831 NR5A2O00482 541 aa16.49■□□□□ 0.23
USP3-AS1-201ENST00000558831 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
USP3-AS1-201ENST00000558831 PRPS2P11908 318 aa16.49■□□□□ 0.23
USP3-AS1-201ENST00000558831 BCKDHAP12694 445 aa16.49■□□□□ 0.23
USP3-AS1-201ENST00000558831 MYF5P13349 255 aa16.49■□□□□ 0.23
USP3-AS1-201ENST00000558831 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP16.49■□□□□ 0.23
USP3-AS1-201ENST00000558831 PTPN4P29074 926 aa16.49■□□□□ 0.23
USP3-AS1-201ENST00000558831 GRK6P43250 576 aa16.49■□□□□ 0.23
USP3-AS1-201ENST00000558831 ACADVLP49748 655 aa16.49■□□□□ 0.23
USP3-AS1-201ENST00000558831 PPP1CAP62136 330 aa16.49■□□□□ 0.23
USP3-AS1-201ENST00000558831 CUL3Q13618 768 aa16.49■□□□□ 0.23
USP3-AS1-201ENST00000558831 HERC3Q15034 1050 aa16.49■□□□□ 0.23
USP3-AS1-201ENST00000558831 MMEL1Q495T6 779 aa16.49■□□□□ 0.23
USP3-AS1-201ENST00000558831 SPIN4Q56A73 249 aa16.49■□□□□ 0.23
USP3-AS1-201ENST00000558831 NOXRED1Q6NXP6 359 aa16.49■□□□□ 0.23
USP3-AS1-201ENST00000558831 IRGCQ6NXR0 463 aa16.49■□□□□ 0.23
USP3-AS1-201ENST00000558831 RINLQ6ZS11 566 aa16.49■□□□□ 0.23
USP3-AS1-201ENST00000558831 PAQR7Q86WK9 346 aa16.49■□□□□ 0.23
USP3-AS1-201ENST00000558831 CHTF18Q8WVB6 975 aa16.49■□□□□ 0.23
USP3-AS1-201ENST00000558831 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP16.49■□□□□ 0.23
USP3-AS1-201ENST00000558831 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
USP3-AS1-201ENST00000558831 SLC45A3Q96JT2 553 aa16.49■□□□□ 0.23
USP3-AS1-201ENST00000558831 TWSG1Q9GZX9 223 aa16.49■□□□□ 0.23
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZMYND15Q9H091 742 aa16.49■□□□□ 0.23
USP3-AS1-201ENST00000558831 EPB41L1Q9H4G0 881 aa16.49■□□□□ 0.23
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZIM2Q9NZV7 527 aa16.49■□□□□ 0.23
USP3-AS1-201ENST00000558831 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa16.49■□□□□ 0.23
USP3-AS1-201ENST00000558831 LAMA1P25391 3075 aa16.49■□□□□ 0.23
USP3-AS1-201ENST00000558831 FKBP9O95302 570 aa16.49■□□□□ 0.23
USP3-AS1-201ENST00000558831 STATHP02808 62 aa16.49■□□□□ 0.23
USP3-AS1-201ENST00000558831 PVRP15151 417 aa16.49■□□□□ 0.23
USP3-AS1-201ENST00000558831 PNLIPP16233 465 aa16.49■□□□□ 0.23
USP3-AS1-201ENST00000558831 CDH3P22223 829 aa16.49■□□□□ 0.23
USP3-AS1-201ENST00000558831 CAPZBP47756 277 aa16.49■□□□□ 0.23
USP3-AS1-201ENST00000558831 RAP1GDS1P52306 607 aa16.49■□□□□ 0.23
USP3-AS1-201ENST00000558831 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
USP3-AS1-201ENST00000558831 PTGR1Q14914 329 aa16.49■□□□□ 0.23
USP3-AS1-201ENST00000558831 CSRP2Q16527 193 aa16.49■□□□□ 0.23
USP3-AS1-201ENST00000558831 FUNDC1Q8IVP5 155 aa16.49■□□□□ 0.23
USP3-AS1-201ENST00000558831 CLHC1Q8NHS4 586 aa16.49■□□□□ 0.23
USP3-AS1-201ENST00000558831 NAT6Q93015 286 aa16.49■□□□□ 0.23
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZUFSPQ96AP4 578 aa16.49■□□□□ 0.23
USP3-AS1-201ENST00000558831 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
USP3-AS1-201ENST00000558831 TEX37Q96LM6 180 aa16.49■□□□□ 0.23
USP3-AS1-201ENST00000558831 TSSK3Q96PN8 268 aa16.49■□□□□ 0.23
USP3-AS1-201ENST00000558831 CENPKQ9BS16 269 aa16.49■□□□□ 0.23
USP3-AS1-201ENST00000558831 EDEM2Q9BV94 578 aa16.49■□□□□ 0.23
USP3-AS1-201ENST00000558831 DPY30Q9C005 99 aa16.49■□□□□ 0.23
USP3-AS1-201ENST00000558831 ASIC5Q9NY37 505 aa16.49■□□□□ 0.23
USP3-AS1-201ENST00000558831 AHSPQ9NZD4 102 aa16.49■□□□□ 0.23
USP3-AS1-201ENST00000558831 AIM2O14862 343 aa16.48■□□□□ 0.23
USP3-AS1-201ENST00000558831 GYG2O15488 501 aa16.48■□□□□ 0.23
USP3-AS1-201ENST00000558831 FLRT2O43155 660 aa16.48■□□□□ 0.23
USP3-AS1-201ENST00000558831 TNFSF14O43557 240 aa16.48■□□□□ 0.23
USP3-AS1-201ENST00000558831 LSSP48449 732 aa16.48■□□□□ 0.23
USP3-AS1-201ENST00000558831 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
USP3-AS1-201ENST00000558831 KCNK10P57789 538 aa16.48■□□□□ 0.23
USP3-AS1-201ENST00000558831 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
USP3-AS1-201ENST00000558831 DAB2P98082 770 aa16.48■□□□□ 0.23
USP3-AS1-201ENST00000558831 STX5Q13190 355 aa16.48■□□□□ 0.23
USP3-AS1-201ENST00000558831 SLC14A1Q13336 389 aa16.48■□□□□ 0.23
USP3-AS1-201ENST00000558831 NR1D2Q14995 579 aa16.48■□□□□ 0.23
USP3-AS1-201ENST00000558831 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
USP3-AS1-201ENST00000558831 FCRL6Q6DN72 434 aa16.48■□□□□ 0.23
USP3-AS1-201ENST00000558831 KIF2BQ8N4N8 673 aa16.48■□□□□ 0.23
USP3-AS1-201ENST00000558831 MFSD9Q8NBP5 474 aa16.48■□□□□ 0.23
USP3-AS1-201ENST00000558831 TRPV3Q8NET8 790 aa16.48■□□□□ 0.23
USP3-AS1-201ENST00000558831 CDC26Q8NHZ8 85 aa16.48■□□□□ 0.23
USP3-AS1-201ENST00000558831 PROKR1Q8TCW9 393 aa16.48■□□□□ 0.23
USP3-AS1-201ENST00000558831 NCSTNQ92542 709 aa16.48■□□□□ 0.23
USP3-AS1-201ENST00000558831 F2RL3Q96RI0 385 aa16.48■□□□□ 0.23
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZBTB18Q99592 522 aa16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.1 ms