RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558534.5

RABGGTA-205, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTA, Length 753 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-205ENST00000558534 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP15.03■□□□□ -0
RABGGTA-205ENST00000558534 C10orf90Q96M02 699 aa15.03■□□□□ -0
RABGGTA-205ENST00000558534 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP15.03■□□□□ -0
RABGGTA-205ENST00000558534 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP15.03■□□□□ -0
RABGGTA-205ENST00000558534 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa15.03■□□□□ -0
RABGGTA-205ENST00000558534 NUP210LQ5VU65 1888 aa15.02■□□□□ -0
RABGGTA-205ENST00000558534 FEZF1A0PJY2 475 aa15.02■□□□□ -0
RABGGTA-205ENST00000558534 ANKDD1BA6NHY2 528 aa15.02■□□□□ -0
RABGGTA-205ENST00000558534 NRP2O60462 931 aa15.02■□□□□ -0
RABGGTA-205ENST00000558534 CTSBP07858 339 aa15.02■□□□□ -0
RABGGTA-205ENST00000558534 GSTA1P08263 222 aa15.02■□□□□ -0
RABGGTA-205ENST00000558534 FAM153BP0C7A2 387 aa15.02■□□□□ -0
RABGGTA-205ENST00000558534 TAC1P20366 129 aa15.02■□□□□ -0
RABGGTA-205ENST00000558534 BCL6P41182 706 aa15.02■□□□□ -0
RABGGTA-205ENST00000558534 HSPA7P48741 367 aa15.02■□□□□ -0
RABGGTA-205ENST00000558534 POLE2P56282 527 aa15.02■□□□□ -0
RABGGTA-205ENST00000558534 RPS18P62269 152 aaKnown RBP15.02■□□□□ -0
RABGGTA-205ENST00000558534 CYP4F2P78329 520 aa15.02■□□□□ -0
RABGGTA-205ENST00000558534 TGM3Q08188 693 aa15.02■□□□□ -0
RABGGTA-205ENST00000558534 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP15.02■□□□□ -0
RABGGTA-205ENST00000558534 TBCCQ15814 346 aa15.02■□□□□ -0
RABGGTA-205ENST00000558534 FAM153CQ494X1 144 aa15.02■□□□□ -0
RABGGTA-205ENST00000558534 CATSPEREQ5SY80 951 aa15.02■□□□□ -0
RABGGTA-205ENST00000558534 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP15.02■□□□□ -0
RABGGTA-205ENST00000558534 VN1R4Q7Z5H5 301 aa15.02■□□□□ -0
RABGGTA-205ENST00000558534 PLD3Q8IV08 490 aa15.02■□□□□ -0
RABGGTA-205ENST00000558534 NT5CQ8TCD5 201 aa15.02■□□□□ -0
RABGGTA-205ENST00000558534 TMEM79Q9BSE2 394 aa15.02■□□□□ -0
RABGGTA-205ENST00000558534 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa15.02■□□□□ -0
RABGGTA-205ENST00000558534 PRM3Q9NNZ6 103 aa15.02■□□□□ -0
RABGGTA-205ENST00000558534 ACSS2Q9NR19 701 aa15.02■□□□□ -0
RABGGTA-205ENST00000558534 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP15.02■□□□□ -0
RABGGTA-205ENST00000558534 COPG2Q9UBF2 871 aa15.02■□□□□ -0
RABGGTA-205ENST00000558534 ADGRE2Q9UHX3 823 aa15.02■□□□□ -0
RABGGTA-205ENST00000558534 LOC400499M0QZD8 3231 aa15.01□□□□□ -0.01
RABGGTA-205ENST00000558534 CCDC88CQ9P219 2028 aa15.01□□□□□ -0.01
RABGGTA-205ENST00000558534 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa15.01□□□□□ -0.01
RABGGTA-205ENST00000558534 UBXN8O00124 270 aa15.01□□□□□ -0.01
RABGGTA-205ENST00000558534 MAP2K7O14733 419 aa15.01□□□□□ -0.01
RABGGTA-205ENST00000558534 TAPBPO15533 448 aa15.01□□□□□ -0.01
RABGGTA-205ENST00000558534 UGDHO60701 494 aa15.01□□□□□ -0.01
RABGGTA-205ENST00000558534 CDH16O75309 829 aa15.01□□□□□ -0.01
RABGGTA-205ENST00000558534 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
RABGGTA-205ENST00000558534 SERPIND1P05546 499 aa15.01□□□□□ -0.01
RABGGTA-205ENST00000558534 SERPINA6P08185 405 aa15.01□□□□□ -0.01
RABGGTA-205ENST00000558534 MMP11P24347 488 aa15.01□□□□□ -0.01
RABGGTA-205ENST00000558534 OR1D4P47884 311 aa15.01□□□□□ -0.01
RABGGTA-205ENST00000558534 GLRBP48167 497 aa15.01□□□□□ -0.01
RABGGTA-205ENST00000558534 AP2B1P63010 937 aa15.01□□□□□ -0.01
RABGGTA-205ENST00000558534 PHEXP78562 749 aa15.01□□□□□ -0.01
RABGGTA-205ENST00000558534 IRF9Q00978 393 aa15.01□□□□□ -0.01
RABGGTA-205ENST00000558534 IRF8Q02556 426 aa15.01□□□□□ -0.01
RABGGTA-205ENST00000558534 DLG1Q12959 904 aa15.01□□□□□ -0.01
RABGGTA-205ENST00000558534 KCNAB2Q13303 367 aa15.01□□□□□ -0.01
RABGGTA-205ENST00000558534 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP15.01□□□□□ -0.01
RABGGTA-205ENST00000558534 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
RABGGTA-205ENST00000558534 SLC9A5Q14940 896 aa15.01□□□□□ -0.01
RABGGTA-205ENST00000558534 SETDB1Q15047 1291 aa15.01□□□□□ -0.01
RABGGTA-205ENST00000558534 RASA2Q15283 850 aa15.01□□□□□ -0.01
RABGGTA-205ENST00000558534 NKG7Q16617 165 aa15.01□□□□□ -0.01
RABGGTA-205ENST00000558534 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
RABGGTA-205ENST00000558534 XKR6Q5GH73 641 aa15.01□□□□□ -0.01
RABGGTA-205ENST00000558534 TECRLQ5HYJ1 363 aa15.01□□□□□ -0.01
RABGGTA-205ENST00000558534 LCN10Q6JVE6 187 aa15.01□□□□□ -0.01
RABGGTA-205ENST00000558534 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa15.01□□□□□ -0.01
RABGGTA-205ENST00000558534 TDRPQ86YL5 185 aa15.01□□□□□ -0.01
RABGGTA-205ENST00000558534 SPNS2Q8IVW8 549 aa15.01□□□□□ -0.01
RABGGTA-205ENST00000558534 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
RABGGTA-205ENST00000558534 CLEC1AQ8NC01 280 aa15.01□□□□□ -0.01
RABGGTA-205ENST00000558534 LRRN4CLQ8ND94 238 aa15.01□□□□□ -0.01
RABGGTA-205ENST00000558534 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
RABGGTA-205ENST00000558534 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa15.01□□□□□ -0.01
RABGGTA-205ENST00000558534 REPS1Q96D71 796 aa15.01□□□□□ -0.01
RABGGTA-205ENST00000558534 WDR34Q96EX3 536 aa15.01□□□□□ -0.01
RABGGTA-205ENST00000558534 YIPF2Q9BWQ6 316 aa15.01□□□□□ -0.01
RABGGTA-205ENST00000558534 TGIF2Q9GZN2 237 aa15.01□□□□□ -0.01
RABGGTA-205ENST00000558534 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
RABGGTA-205ENST00000558534 TRPC4Q9UBN4 977 aa15.01□□□□□ -0.01
RABGGTA-205ENST00000558534 SH2B3Q9UQQ2 575 aa15.01□□□□□ -0.01
RABGGTA-205ENST00000558534 KCNMB2Q9Y691 235 aa15.01□□□□□ -0.01
RABGGTA-205ENST00000558534 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa15□□□□□ -0.01
RABGGTA-205ENST00000558534 VSTM2BA6NLU5 285 aa15□□□□□ -0.01
RABGGTA-205ENST00000558534 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa15□□□□□ -0.01
RABGGTA-205ENST00000558534 STX16O14662 325 aa15□□□□□ -0.01
RABGGTA-205ENST00000558534 P2RX6O15547 441 aa15□□□□□ -0.01
RABGGTA-205ENST00000558534 KLK8O60259 260 aa15□□□□□ -0.01
RABGGTA-205ENST00000558534 CLEC3AO75596 197 aa15□□□□□ -0.01
RABGGTA-205ENST00000558534 OTX2P32243 289 aa15□□□□□ -0.01
RABGGTA-205ENST00000558534 HNF4AP41235 474 aa15□□□□□ -0.01
RABGGTA-205ENST00000558534 CASP2P42575 452 aa15□□□□□ -0.01
RABGGTA-205ENST00000558534 GDF5P43026 501 aa15□□□□□ -0.01
RABGGTA-205ENST00000558534 PCDH1Q08174 1060 aa15□□□□□ -0.01
RABGGTA-205ENST00000558534 IL10RAQ13651 578 aa15□□□□□ -0.01
RABGGTA-205ENST00000558534 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP15□□□□□ -0.01
RABGGTA-205ENST00000558534 RBBP7Q16576 425 aa15□□□□□ -0.01
RABGGTA-205ENST00000558534 PFKFB4Q16877 469 aa15□□□□□ -0.01
RABGGTA-205ENST00000558534 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa15□□□□□ -0.01
RABGGTA-205ENST00000558534 HPS6Q86YV9 775 aa15□□□□□ -0.01
RABGGTA-205ENST00000558534 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
RABGGTA-205ENST00000558534 STT3BQ8TCJ2 826 aa15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.5 ms