RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551968.5

CS-230, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 542 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-230ENST00000551968 SYT5O00445 386 aa12.76□□□□□ -0.37
CS-230ENST00000551968 DNAJB6O75190 326 aa12.76□□□□□ -0.37
CS-230ENST00000551968 TACR1P25103 407 aa12.76□□□□□ -0.37
CS-230ENST00000551968 AVPR1BP47901 424 aa12.76□□□□□ -0.37
CS-230ENST00000551968 PPP2R2BQ00005 443 aa12.76□□□□□ -0.37
CS-230ENST00000551968 PTK6Q13882 451 aa12.76□□□□□ -0.37
CS-230ENST00000551968 NSDHLQ15738 373 aa12.76□□□□□ -0.37
CS-230ENST00000551968 CCDC38Q502W7 563 aa12.76□□□□□ -0.37
CS-230ENST00000551968 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP12.76□□□□□ -0.37
CS-230ENST00000551968 ARMC2Q8NEN0 867 aa12.76□□□□□ -0.37
CS-230ENST00000551968 STYXQ8WUJ0 223 aa12.76□□□□□ -0.37
CS-230ENST00000551968 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP12.76□□□□□ -0.37
CS-230ENST00000551968 Q96MF0 132 aa12.76□□□□□ -0.37
CS-230ENST00000551968 FAM118BQ9BPY3 351 aa12.76□□□□□ -0.37
CS-230ENST00000551968 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP12.76□□□□□ -0.37
CS-230ENST00000551968 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa12.76□□□□□ -0.37
CS-230ENST00000551968 H7C0C1 242 aa12.75□□□□□ -0.37
CS-230ENST00000551968 RDH16O75452 317 aa12.75□□□□□ -0.37
CS-230ENST00000551968 NSA2O95478 260 aaKnown RBP12.75□□□□□ -0.37
CS-230ENST00000551968 GOT2P00505 430 aaKnown RBP12.75□□□□□ -0.37
CS-230ENST00000551968 APOA4P06727 396 aa12.75□□□□□ -0.37
CS-230ENST00000551968 CYC1P08574 325 aa12.75□□□□□ -0.37
CS-230ENST00000551968 BCL6P41182 706 aa12.75□□□□□ -0.37
CS-230ENST00000551968 ATP5OP48047 213 aa12.75□□□□□ -0.37
CS-230ENST00000551968 MARCKSL1P49006 195 aa12.75□□□□□ -0.37
CS-230ENST00000551968 OR4D2P58180 307 aa12.75□□□□□ -0.37
CS-230ENST00000551968 POU4F3Q15319 338 aa12.75□□□□□ -0.37
CS-230ENST00000551968 ODF2Q5BJF6 829 aa12.75□□□□□ -0.37
CS-230ENST00000551968 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP12.75□□□□□ -0.37
CS-230ENST00000551968 KCTD11Q693B1 232 aa12.75□□□□□ -0.37
CS-230ENST00000551968 SEM1Q6ZVN7 128 aa12.75□□□□□ -0.37
CS-230ENST00000551968 ZNF534Q76KX8 674 aa12.75□□□□□ -0.37
CS-230ENST00000551968 VN1R4Q7Z5H5 301 aa12.75□□□□□ -0.37
CS-230ENST00000551968 SPNS2Q8IVW8 549 aa12.75□□□□□ -0.37
CS-230ENST00000551968 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa12.75□□□□□ -0.37
CS-230ENST00000551968 PPFIBP2Q8ND30 876 aa12.75□□□□□ -0.37
CS-230ENST00000551968 PLPP5Q8NEB5 264 aa12.75□□□□□ -0.37
CS-230ENST00000551968 OR5T3Q8NGG3 340 aa12.75□□□□□ -0.37
CS-230ENST00000551968 OR13J1Q8NGT2 312 aa12.75□□□□□ -0.37
CS-230ENST00000551968 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP12.75□□□□□ -0.37
CS-230ENST00000551968 SMC6Q96SB8 1091 aa12.75□□□□□ -0.37
CS-230ENST00000551968 CARD6Q9BX69 1037 aa12.75□□□□□ -0.37
CS-230ENST00000551968 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa12.75□□□□□ -0.37
CS-230ENST00000551968 ANO10Q9NW15 660 aa12.75□□□□□ -0.37
CS-230ENST00000551968 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP12.75□□□□□ -0.37
CS-230ENST00000551968 TAC3Q9UHF0 121 aa12.75□□□□□ -0.37
CS-230ENST00000551968 SONP18583 2426 aaKnown RBP12.74□□□□□ -0.37
CS-230ENST00000551968 ZNF860A6NHJ4 632 aa12.74□□□□□ -0.37
CS-230ENST00000551968 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP12.74□□□□□ -0.37
CS-230ENST00000551968 CELA3AP09093 270 aa12.74□□□□□ -0.37
CS-230ENST00000551968 ERGP11308 486 aa12.74□□□□□ -0.37
CS-230ENST00000551968 COMTP21964 271 aa12.74□□□□□ -0.37
CS-230ENST00000551968 PPIAP62937 165 aaKnown RBP12.74□□□□□ -0.37
CS-230ENST00000551968 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP12.74□□□□□ -0.37
CS-230ENST00000551968 PRPSAP1Q14558 356 aa12.74□□□□□ -0.37
CS-230ENST00000551968 NR1I3Q14994 352 aa12.74□□□□□ -0.37
CS-230ENST00000551968 STX1AQ16623 288 aa12.74□□□□□ -0.37
CS-230ENST00000551968 FBXW10Q5XX13 1052 aa12.74□□□□□ -0.37
CS-230ENST00000551968 ICE2Q659A1 982 aa12.74□□□□□ -0.37
CS-230ENST00000551968 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa12.74□□□□□ -0.37
CS-230ENST00000551968 NAXEQ8NCW5 288 aa12.74□□□□□ -0.37
CS-230ENST00000551968 SIMC1Q8NDZ2 872 aa12.74□□□□□ -0.37
CS-230ENST00000551968 LINC01560Q8TB33 94 aa12.74□□□□□ -0.37
CS-230ENST00000551968 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP12.74□□□□□ -0.37
CS-230ENST00000551968 KIAA1191Q96A73 305 aa12.74□□□□□ -0.37
CS-230ENST00000551968 PEX11GQ96HA9 241 aa12.74□□□□□ -0.37
CS-230ENST00000551968 HEMGNQ9BXL5 484 aa12.74□□□□□ -0.37
CS-230ENST00000551968 GOLPH3Q9H4A6 298 aa12.74□□□□□ -0.37
CS-230ENST00000551968 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa12.74□□□□□ -0.37
CS-230ENST00000551968 LCMT1Q9UIC8 334 aa12.74□□□□□ -0.37
CS-230ENST00000551968 MAGEB17A8MXT2 336 aa12.73□□□□□ -0.37
CS-230ENST00000551968 G3V3Y1 287 aa12.73□□□□□ -0.37
CS-230ENST00000551968 PHF2O75151 1096 aa12.73□□□□□ -0.37
CS-230ENST00000551968 CRLF1O75462 422 aa12.73□□□□□ -0.37
CS-230ENST00000551968 TMEM253P0C7T8 217 aa12.73□□□□□ -0.37
CS-230ENST00000551968 EZRP15311 586 aaKnown RBP12.73□□□□□ -0.37
CS-230ENST00000551968 WNT3P56703 355 aa12.73□□□□□ -0.37
CS-230ENST00000551968 NDUFA9Q16795 377 aa12.73□□□□□ -0.37
CS-230ENST00000551968 C1orf185Q5T7R7 199 aa12.73□□□□□ -0.37
CS-230ENST00000551968 TTC23LQ6PF05 361 aa12.73□□□□□ -0.37
CS-230ENST00000551968 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP12.73□□□□□ -0.37
CS-230ENST00000551968 PCGF5Q86SE9 256 aa12.73□□□□□ -0.37
CS-230ENST00000551968 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP12.73□□□□□ -0.37
CS-230ENST00000551968 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa12.73□□□□□ -0.37
CS-230ENST00000551968 ZNF778Q96MU6 729 aa12.73□□□□□ -0.37
CS-230ENST00000551968 ABCF3Q9NUQ8 709 aa12.73□□□□□ -0.37
CS-230ENST00000551968 SPATA7Q9P0W8 599 aa12.73□□□□□ -0.37
CS-230ENST00000551968 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP12.73□□□□□ -0.37
CS-230ENST00000551968 DUSP10Q9Y6W6 482 aa12.73□□□□□ -0.37
CS-230ENST00000551968 ARID1AO14497 2285 aa12.73□□□□□ -0.37
CS-230ENST00000551968 NCKAP5O14513 1909 aa12.72□□□□□ -0.37
CS-230ENST00000551968 FIGNL2A6NMB9 653 aa12.72□□□□□ -0.37
CS-230ENST00000551968 METTL18O95568 372 aa12.72□□□□□ -0.37
CS-230ENST00000551968 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP12.72□□□□□ -0.37
CS-230ENST00000551968 ZBED6P86452 979 aa12.72□□□□□ -0.37
CS-230ENST00000551968 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP12.72□□□□□ -0.37
CS-230ENST00000551968 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP12.72□□□□□ -0.37
CS-230ENST00000551968 POMZP3Q6PJE2 187 aa12.72□□□□□ -0.37
CS-230ENST00000551968 SASS6Q6UVJ0 657 aa12.72□□□□□ -0.37
CS-230ENST00000551968 TRILQ7L0X0 811 aa12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.6 ms