RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551253.5

CS-225, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 676 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-225ENST00000551253 SNX24Q9Y343 169 aa6.72□□□□□ -1.33
CS-225ENST00000551253 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
CS-225ENST00000551253 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa6.72□□□□□ -1.33
CS-225ENST00000551253 FAM169AQ9Y6X4 670 aa6.72□□□□□ -1.33
CS-225ENST00000551253 A0A1W2PPR1 153 aa6.71□□□□□ -1.34
CS-225ENST00000551253 SLC5A10A0PJK1 596 aa6.71□□□□□ -1.34
CS-225ENST00000551253 CLCA1A8K7I4 914 aa6.71□□□□□ -1.34
CS-225ENST00000551253 GOLGA8KD6RF30 607 aa6.71□□□□□ -1.34
CS-225ENST00000551253 GOLGA8TH3BQL2 631 aa6.71□□□□□ -1.34
CS-225ENST00000551253 NDUFS3O75489 264 aa6.71□□□□□ -1.34
CS-225ENST00000551253 BANF1O75531 89 aa6.71□□□□□ -1.34
CS-225ENST00000551253 STATHP02808 62 aa6.71□□□□□ -1.34
CS-225ENST00000551253 SLC35G4P0C7Q5 338 aa6.71□□□□□ -1.34
CS-225ENST00000551253 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
CS-225ENST00000551253 MMP11P24347 488 aa6.71□□□□□ -1.34
CS-225ENST00000551253 NDUFS1P28331 727 aa6.71□□□□□ -1.34
CS-225ENST00000551253 CD151P48509 253 aa6.71□□□□□ -1.34
CS-225ENST00000551253 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
CS-225ENST00000551253 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
CS-225ENST00000551253 ABRQ12979 859 aa6.71□□□□□ -1.34
CS-225ENST00000551253 CALCOCO2Q13137 446 aa6.71□□□□□ -1.34
CS-225ENST00000551253 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
CS-225ENST00000551253 CRYMQ14894 314 aa6.71□□□□□ -1.34
CS-225ENST00000551253 BBS9Q3SYG4 887 aa6.71□□□□□ -1.34
CS-225ENST00000551253 SPANXN3Q5MJ09 141 aa6.71□□□□□ -1.34
CS-225ENST00000551253 NEPROQ6NW34 567 aa6.71□□□□□ -1.34
CS-225ENST00000551253 ZNF449Q6P9G9 518 aa6.71□□□□□ -1.34
CS-225ENST00000551253 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
CS-225ENST00000551253 OOSP2Q86WS3 158 aa6.71□□□□□ -1.34
CS-225ENST00000551253 SIAH3Q8IW03 269 aa6.71□□□□□ -1.34
CS-225ENST00000551253 CNTN4Q8IWV2 1026 aa6.71□□□□□ -1.34
CS-225ENST00000551253 LGI4Q8N135 537 aa6.71□□□□□ -1.34
CS-225ENST00000551253 MMGT1Q8N4V1 131 aa6.71□□□□□ -1.34
CS-225ENST00000551253 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
CS-225ENST00000551253 OTUD6BQ8N6M0 293 aa6.71□□□□□ -1.34
CS-225ENST00000551253 MNS1Q8NEH6 495 aa6.71□□□□□ -1.34
CS-225ENST00000551253 ELMO1Q92556 727 aa6.71□□□□□ -1.34
CS-225ENST00000551253 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
CS-225ENST00000551253 C12orf66Q96MD2 445 aa6.71□□□□□ -1.34
CS-225ENST00000551253 PANX3Q96QZ0 392 aa6.71□□□□□ -1.34
CS-225ENST00000551253 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
CS-225ENST00000551253 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
CS-225ENST00000551253 TSSK1BQ9BXA7 367 aa6.71□□□□□ -1.34
CS-225ENST00000551253 PHACTR1Q9C0D0 580 aa6.71□□□□□ -1.34
CS-225ENST00000551253 SHARPINQ9H0F6 387 aa6.71□□□□□ -1.34
CS-225ENST00000551253 WWP1Q9H0M0 922 aa6.71□□□□□ -1.34
CS-225ENST00000551253 P2RY12Q9H244 342 aa6.71□□□□□ -1.34
CS-225ENST00000551253 DPH5Q9H2P9 285 aa6.71□□□□□ -1.34
CS-225ENST00000551253 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
CS-225ENST00000551253 HRASLS2Q9NWW9 162 aa6.71□□□□□ -1.34
CS-225ENST00000551253 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa6.71□□□□□ -1.34
CS-225ENST00000551253 FAM8A1Q9UBU6 413 aa6.71□□□□□ -1.34
CS-225ENST00000551253 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
CS-225ENST00000551253 PSMD13Q9UNM6 376 aa6.71□□□□□ -1.34
CS-225ENST00000551253 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa6.71□□□□□ -1.34
CS-225ENST00000551253 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa6.71□□□□□ -1.34
CS-225ENST00000551253 TEX264Q9Y6I9 313 aa6.71□□□□□ -1.34
CS-225ENST00000551253 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
CS-225ENST00000551253 HYDINQ4G0P3 5121 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-225ENST00000551253 CTAGE15A4D2H0 777 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-225ENST00000551253 OR6C74A6NCV1 312 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-225ENST00000551253 H3BMM5 538 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-225ENST00000551253 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
CS-225ENST00000551253 KPNA5O15131 536 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-225ENST00000551253 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP6.7□□□□□ -1.342e-6■■■■□ 21.8
CS-225ENST00000551253 CTIFO43310 598 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
CS-225ENST00000551253 GPC4O75487 556 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-225ENST00000551253 F10P00742 488 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-225ENST00000551253 ESR1P03372 595 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-225ENST00000551253 HRGP04196 525 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-225ENST00000551253 MSL3P1P0C860 447 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-225ENST00000551253 CTAGE8P0CG41 777 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-225ENST00000551253 SRD5A1P18405 259 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-225ENST00000551253 ACADLP28330 430 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-225ENST00000551253 PDHA2P29803 388 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-225ENST00000551253 UQCRC1P31930 480 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-225ENST00000551253 CCR7P32248 378 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-225ENST00000551253 PTGS2P35354 604 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-225ENST00000551253 SOX11P35716 441 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-225ENST00000551253 ELK3P41970 407 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-225ENST00000551253 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
CS-225ENST00000551253 PTH2RP49190 550 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-225ENST00000551253 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
CS-225ENST00000551253 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
CS-225ENST00000551253 NUP107P57740 925 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-225ENST00000551253 CAV1Q03135 178 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-225ENST00000551253 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
CS-225ENST00000551253 CTBP1Q13363 440 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-225ENST00000551253 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
CS-225ENST00000551253 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-225ENST00000551253 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-225ENST00000551253 CTSL3PQ5NE16 218 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-225ENST00000551253 STEAP4Q687X5 459 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-225ENST00000551253 ZNF470Q6ECI4 717 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-225ENST00000551253 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
CS-225ENST00000551253 ARMC6Q6NXE6 501 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-225ENST00000551253 C8orf74Q6P047 294 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-225ENST00000551253 UNC5AQ6ZN44 842 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-225ENST00000551253 CENPUQ71F23 418 aa6.7□□□□□ -1.34
CS-225ENST00000551253 GALNT7Q86SF2 657 aa6.7□□□□□ -1.34
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