RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550996.1

CS-222, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 718 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-222ENST00000550996 TMPRSS11BQ86T26 416 aa19.79■□□□□ 0.76
CS-222ENST00000550996 ANKRD53Q8N9V6 530 aa19.79■□□□□ 0.76
CS-222ENST00000550996 TEX19Q8NA77 164 aa19.79■□□□□ 0.76
CS-222ENST00000550996 CLEC1AQ8NC01 280 aa19.79■□□□□ 0.76
CS-222ENST00000550996 CAMKVQ8NCB2 501 aa19.79■□□□□ 0.76
CS-222ENST00000550996 KIF18AQ8NI77 898 aa19.79■□□□□ 0.76
CS-222ENST00000550996 IFT81Q8WYA0 676 aa19.79■□□□□ 0.76
CS-222ENST00000550996 C8orf44Q96CB5 159 aa19.79■□□□□ 0.76
CS-222ENST00000550996 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP19.79■□□□□ 0.76
CS-222ENST00000550996 YIPF2Q9BWQ6 316 aa19.79■□□□□ 0.76
CS-222ENST00000550996 TGIF2Q9GZN2 237 aa19.79■□□□□ 0.76
CS-222ENST00000550996 IGSF5Q9NSI5 407 aa19.79■□□□□ 0.76
CS-222ENST00000550996 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP19.78■□□□□ 0.76
CS-222ENST00000550996 IDSB3KWA1 339 aa19.78■□□□□ 0.76
CS-222ENST00000550996 SGK494L7N484 410 aa19.78■□□□□ 0.76
CS-222ENST00000550996 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP19.78■□□□□ 0.76
CS-222ENST00000550996 JRKO75564 520 aa19.78■□□□□ 0.76
CS-222ENST00000550996 NSA2O95478 260 aaKnown RBP19.78■□□□□ 0.76
CS-222ENST00000550996 VARSP26640 1264 aaKnown RBP19.78■□□□□ 0.76
CS-222ENST00000550996 GRK3P35626 688 aa19.78■□□□□ 0.76
CS-222ENST00000550996 SOX8P57073 446 aa19.78■□□□□ 0.76
CS-222ENST00000550996 ATP6V0D1P61421 351 aa19.78■□□□□ 0.76
CS-222ENST00000550996 Q0VFX4 171 aa19.78■□□□□ 0.76
CS-222ENST00000550996 MYBPC3Q14896 1274 aa19.78■□□□□ 0.76
CS-222ENST00000550996 ATG9BQ674R7 924 aa19.78■□□□□ 0.76
CS-222ENST00000550996 GPSM1Q86YR5 675 aa19.78■□□□□ 0.76
CS-222ENST00000550996 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa19.78■□□□□ 0.76
CS-222ENST00000550996 AMER2Q8N7J2 671 aa19.78■□□□□ 0.76
CS-222ENST00000550996 KIAA1191Q96A73 305 aa19.78■□□□□ 0.76
CS-222ENST00000550996 FAM129AQ9BZQ8 928 aa19.78■□□□□ 0.76
CS-222ENST00000550996 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP19.78■□□□□ 0.76
CS-222ENST00000550996 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP19.78■□□□□ 0.76
CS-222ENST00000550996 PELI2Q9HAT8 420 aa19.78■□□□□ 0.76
CS-222ENST00000550996 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP19.78■□□□□ 0.76
CS-222ENST00000550996 DYRK1BQ9Y463 629 aa19.78■□□□□ 0.76
CS-222ENST00000550996 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa19.78■□□□□ 0.76
CS-222ENST00000550996 H0YIG0 161 aa19.77■□□□□ 0.76
CS-222ENST00000550996 NDUFS4O43181 175 aa19.77■□□□□ 0.76
CS-222ENST00000550996 PRAMEF4O60810 478 aa19.77■□□□□ 0.76
CS-222ENST00000550996 WDR47O94967 919 aa19.77■□□□□ 0.76
CS-222ENST00000550996 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP19.77■□□□□ 0.76
CS-222ENST00000550996 B3GALT4O96024 378 aa19.77■□□□□ 0.76
CS-222ENST00000550996 IGHEP01854 428 aa19.77■□□□□ 0.76
CS-222ENST00000550996 AVPR1BP47901 424 aa19.77■□□□□ 0.76
CS-222ENST00000550996 CD97P48960 835 aa19.77■□□□□ 0.76
CS-222ENST00000550996 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP19.77■□□□□ 0.76
CS-222ENST00000550996 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa19.77■□□□□ 0.76
CS-222ENST00000550996 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa19.77■□□□□ 0.76
CS-222ENST00000550996 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa19.77■□□□□ 0.76
CS-222ENST00000550996 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP19.77■□□□□ 0.76
CS-222ENST00000550996 ESAMQ96AP7 390 aa19.77■□□□□ 0.76
CS-222ENST00000550996 FMO2Q99518 471 aa19.77■□□□□ 0.76
CS-222ENST00000550996 FUT8Q9BYC5 575 aa19.77■□□□□ 0.76
CS-222ENST00000550996 AICDAQ9GZX7 198 aa19.77■□□□□ 0.76
CS-222ENST00000550996 ACSS3Q9H6R3 686 aa19.77■□□□□ 0.76
CS-222ENST00000550996 ALG9Q9H6U8 611 aa19.77■□□□□ 0.76
CS-222ENST00000550996 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP19.77■□□□□ 0.76
CS-222ENST00000550996 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa19.77■□□□□ 0.76
CS-222ENST00000550996 C14orf105Q9NVL8 296 aa19.77■□□□□ 0.76
CS-222ENST00000550996 HCN3Q9P1Z3 774 aa19.77■□□□□ 0.76
CS-222ENST00000550996 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP19.77■□□□□ 0.76
CS-222ENST00000550996 ASB1Q9Y576 335 aa19.77■□□□□ 0.76
CS-222ENST00000550996 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa19.77■□□□□ 0.76
CS-222ENST00000550996 KCNE2Q9Y6J6 123 aa19.77■□□□□ 0.76
CS-222ENST00000550996 ZNF860A6NHJ4 632 aa19.76■□□□□ 0.75
CS-222ENST00000550996 DNAJB6O75190 326 aa19.76■□□□□ 0.75
CS-222ENST00000550996 RDH16O75452 317 aa19.76■□□□□ 0.75
CS-222ENST00000550996 KLHL18O94889 574 aa19.76■□□□□ 0.75
CS-222ENST00000550996 BMP10O95393 424 aa19.76■□□□□ 0.75
CS-222ENST00000550996 SLC35G6P0C7Q6 338 aa19.76■□□□□ 0.75
CS-222ENST00000550996 ACPPP15309 386 aa19.76■□□□□ 0.75
CS-222ENST00000550996 GGT5P36269 586 aa19.76■□□□□ 0.75
CS-222ENST00000550996 EMP2P54851 167 aa19.76■□□□□ 0.75
CS-222ENST00000550996 IRF9Q00978 393 aa19.76■□□□□ 0.75
CS-222ENST00000550996 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP19.76■□□□□ 0.75
CS-222ENST00000550996 IGFBP7Q16270 282 aa19.76■□□□□ 0.75
CS-222ENST00000550996 TUBB8Q3ZCM7 444 aa19.76■□□□□ 0.75
CS-222ENST00000550996 MROH9Q5TGP6 573 aa19.76■□□□□ 0.75
CS-222ENST00000550996 ISCA2Q86U28 154 aa19.76■□□□□ 0.75
CS-222ENST00000550996 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP19.76■□□□□ 0.75
CS-222ENST00000550996 LRRN4CLQ8ND94 238 aa19.76■□□□□ 0.75
CS-222ENST00000550996 CYTH2Q99418 400 aa19.76■□□□□ 0.75
CS-222ENST00000550996 ZFP69BQ9UJL9 534 aa19.76■□□□□ 0.75
CS-222ENST00000550996 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa19.76■□□□□ 0.75
CS-222ENST00000550996 SLC22A7Q9Y694 548 aa19.76■□□□□ 0.75
CS-222ENST00000550996 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa19.76■□□□□ 0.75
CS-222ENST00000550996 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP19.76■□□□□ 0.75
CS-222ENST00000550996 A0A1W2PQ72 361 aa19.75■□□□□ 0.75
CS-222ENST00000550996 OR2W5A6NFC9 320 aa19.75■□□□□ 0.75
CS-222ENST00000550996 C4orf51C9J302 202 aa19.75■□□□□ 0.75
CS-222ENST00000550996 WISP1O95388 367 aa19.75■□□□□ 0.75
CS-222ENST00000550996 ACSL3O95573 720 aa19.75■□□□□ 0.75
CS-222ENST00000550996 COX6A1P12074 109 aa19.75■□□□□ 0.75
CS-222ENST00000550996 TFEBP19484 476 aa19.75■□□□□ 0.75
CS-222ENST00000550996 ITGA3P26006 1051 aa19.75■□□□□ 0.75
CS-222ENST00000550996 CRABP2P29373 138 aa19.75■□□□□ 0.75
CS-222ENST00000550996 HSPA7P48741 367 aa19.75■□□□□ 0.75
CS-222ENST00000550996 MLLT10P55197 1068 aa19.75■□□□□ 0.75
CS-222ENST00000550996 HYAL2Q12891 473 aa19.75■□□□□ 0.75
CS-222ENST00000550996 PWP1Q13610 501 aa19.75■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.2 ms