RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544584.1

CLSTN3-215, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 4

Gene CLSTN3, Length 546 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-215ENST00000544584 SPACA6W5XKT8 324 aa5.34□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 PCM1Q15154 2024 aa5.34□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 CENPEQ02224 2701 aa5.34□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa5.34□□□□□ -1.56
CLSTN3-215ENST00000544584 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa5.34□□□□□ -1.56
CLSTN3-215ENST00000544584 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa5.33□□□□□ -1.56
CLSTN3-215ENST00000544584 A0A1W2PPV9 198 aa5.33□□□□□ -1.56
CLSTN3-215ENST00000544584 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa5.33□□□□□ -1.56
CLSTN3-215ENST00000544584 TRBC2A0A5B9 178 aa5.33□□□□□ -1.56
CLSTN3-215ENST00000544584 BLACEA4D250 179 aa5.33□□□□□ -1.56
CLSTN3-215ENST00000544584 FAM159BA6NKW6 160 aa5.33□□□□□ -1.56
CLSTN3-215ENST00000544584 A6NL46 340 aa5.33□□□□□ -1.56
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CLSTN3-215ENST00000544584 H3BMH7 237 aa5.33□□□□□ -1.56
CLSTN3-215ENST00000544584 HAT1O14929 419 aa5.33□□□□□ -1.56
CLSTN3-215ENST00000544584 NDUFS4O43181 175 aa5.33□□□□□ -1.56
CLSTN3-215ENST00000544584 DYRK3O43781 588 aa5.33□□□□□ -1.56
CLSTN3-215ENST00000544584 CTSVO60911 334 aa5.33□□□□□ -1.56
CLSTN3-215ENST00000544584 BANF1O75531 89 aa5.33□□□□□ -1.56
CLSTN3-215ENST00000544584 CEACAM4O75871 244 aa5.33□□□□□ -1.56
CLSTN3-215ENST00000544584 WDR47O94967 919 aa5.33□□□□□ -1.56
CLSTN3-215ENST00000544584 SERPIND1P05546 499 aa5.33□□□□□ -1.56
CLSTN3-215ENST00000544584 SERPINA6P08185 405 aa5.33□□□□□ -1.56
CLSTN3-215ENST00000544584 RBP1P09455 135 aa5.33□□□□□ -1.56
CLSTN3-215ENST00000544584 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP5.33□□□□□ -1.56
CLSTN3-215ENST00000544584 CCDC166P0CW27 439 aa5.33□□□□□ -1.56
CLSTN3-215ENST00000544584 C8orf89P0DMQ9 161 aa5.33□□□□□ -1.56
CLSTN3-215ENST00000544584 CDH1P12830 882 aa5.33□□□□□ -1.56
CLSTN3-215ENST00000544584 NPPBP16860 134 aa5.33□□□□□ -1.56
CLSTN3-215ENST00000544584 WT1P19544 449 aaPredicted RBP5.33□□□□□ -1.56
CLSTN3-215ENST00000544584 TYK2P29597 1187 aa5.33□□□□□ -1.56
CLSTN3-215ENST00000544584 MSH2P43246 934 aa5.33□□□□□ -1.56
CLSTN3-215ENST00000544584 OR1D4P47884 311 aa5.33□□□□□ -1.56
CLSTN3-215ENST00000544584 RPS18P62269 152 aaKnown RBP5.33□□□□□ -1.56
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CLSTN3-215ENST00000544584 CDC16Q13042 620 aa5.33□□□□□ -1.56
CLSTN3-215ENST00000544584 BIKQ13323 160 aa5.33□□□□□ -1.56
CLSTN3-215ENST00000544584 IL10RAQ13651 578 aa5.33□□□□□ -1.56
CLSTN3-215ENST00000544584 ACAP2Q15057 778 aa5.33□□□□□ -1.56
CLSTN3-215ENST00000544584 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP5.33□□□□□ -1.56
CLSTN3-215ENST00000544584 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP5.33□□□□□ -1.56
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CLSTN3-215ENST00000544584 PRTGQ2VWP7 1150 aa5.33□□□□□ -1.56
CLSTN3-215ENST00000544584 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa5.33□□□□□ -1.56
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CLSTN3-215ENST00000544584 CCSMST1Q4G0I0 132 aa5.33□□□□□ -1.56
CLSTN3-215ENST00000544584 CRB2Q5IJ48 1285 aa5.33□□□□□ -1.56
CLSTN3-215ENST00000544584 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP5.33□□□□□ -1.56
CLSTN3-215ENST00000544584 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP5.33□□□□□ -1.56
CLSTN3-215ENST00000544584 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa5.33□□□□□ -1.56
CLSTN3-215ENST00000544584 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa5.33□□□□□ -1.56
CLSTN3-215ENST00000544584 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP5.33□□□□□ -1.56
CLSTN3-215ENST00000544584 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa5.33□□□□□ -1.56
CLSTN3-215ENST00000544584 FRMPD2BQ6IN97 320 aa5.33□□□□□ -1.56
CLSTN3-215ENST00000544584 CHSY3Q70JA7 882 aa5.33□□□□□ -1.56
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CLSTN3-215ENST00000544584 PPM1NQ8N819 430 aa5.33□□□□□ -1.56
CLSTN3-215ENST00000544584 SNX31Q8N9S9 440 aa5.33□□□□□ -1.56
CLSTN3-215ENST00000544584 MFSD9Q8NBP5 474 aa5.33□□□□□ -1.56
CLSTN3-215ENST00000544584 PPFIBP2Q8ND30 876 aa5.33□□□□□ -1.56
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CLSTN3-215ENST00000544584 STT3BQ8TCJ2 826 aa5.33□□□□□ -1.56
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CLSTN3-215ENST00000544584 KIAA1191Q96A73 305 aa5.33□□□□□ -1.56
CLSTN3-215ENST00000544584 PNPLA2Q96AD5 504 aa5.33□□□□□ -1.56
CLSTN3-215ENST00000544584 MTBPQ96DY7 904 aa5.33□□□□□ -1.56
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CLSTN3-215ENST00000544584 OR2A5Q96R48 311 aa5.33□□□□□ -1.56
CLSTN3-215ENST00000544584 LMF1Q96S06 567 aa5.33□□□□□ -1.56
CLSTN3-215ENST00000544584 RBBP8Q99708 897 aa5.33□□□□□ -1.56
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CLSTN3-215ENST00000544584 SLC30A3Q99726 388 aa5.33□□□□□ -1.56
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CLSTN3-215ENST00000544584 SARGQ9BW04 601 aa5.33□□□□□ -1.56
CLSTN3-215ENST00000544584 EHD1Q9H4M9 534 aa5.33□□□□□ -1.56
CLSTN3-215ENST00000544584 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP5.33□□□□□ -1.56
CLSTN3-215ENST00000544584 PPCSQ9HAB8 311 aa5.33□□□□□ -1.56
CLSTN3-215ENST00000544584 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP5.33□□□□□ -1.56
CLSTN3-215ENST00000544584 DNAJC11Q9NVH1 559 aa5.33□□□□□ -1.56
CLSTN3-215ENST00000544584 MAP10Q9P2G4 905 aa5.33□□□□□ -1.56
CLSTN3-215ENST00000544584 GALPQ9UBC7 116 aa5.33□□□□□ -1.56
CLSTN3-215ENST00000544584 FBXL4Q9UKA2 621 aa5.33□□□□□ -1.56
CLSTN3-215ENST00000544584 MKL2Q9ULH7 1088 aa5.33□□□□□ -1.56
CLSTN3-215ENST00000544584 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP5.33□□□□□ -1.56
CLSTN3-215ENST00000544584 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa5.33□□□□□ -1.56
CLSTN3-215ENST00000544584 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa5.33□□□□□ -1.56
CLSTN3-215ENST00000544584 KLHL20Q9Y2M5 609 aa5.33□□□□□ -1.56
CLSTN3-215ENST00000544584 MAU2Q9Y6X3 613 aa5.33□□□□□ -1.56
CLSTN3-215ENST00000544584 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP5.33□□□□□ -1.56
CLSTN3-215ENST00000544584 NF1P21359 2839 aa5.32□□□□□ -1.56
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