RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538616.1

CD27-AS1-208, CD27 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene CD27-AS1, Length 657 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD27-AS1-208ENST00000538616 FAM180AQ6UWF9 173 aa18.3■□□□□ 0.52
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CD27-AS1-208ENST00000538616 PYCR2Q96C36 320 aa18.3■□□□□ 0.52
CD27-AS1-208ENST00000538616 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa18.3■□□□□ 0.52
CD27-AS1-208ENST00000538616 HIST1H2AJQ99878 128 aa18.3■□□□□ 0.52
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CD27-AS1-208ENST00000538616 CTAGE3PQ8IX95 158 aa18.29■□□□□ 0.52
CD27-AS1-208ENST00000538616 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP18.29■□□□□ 0.52
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CD27-AS1-208ENST00000538616 CDKL2Q92772 493 aa18.29■□□□□ 0.52
CD27-AS1-208ENST00000538616 PTERQ96BW5 349 aa18.29■□□□□ 0.52
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CD27-AS1-208ENST00000538616 C10orf90Q96M02 699 aa18.29■□□□□ 0.52
CD27-AS1-208ENST00000538616 OR2A5Q96R48 311 aa18.29■□□□□ 0.52
CD27-AS1-208ENST00000538616 TRIM8Q9BZR9 551 aa18.29■□□□□ 0.52
CD27-AS1-208ENST00000538616 P2RX6O15547 441 aa18.28■□□□□ 0.52
CD27-AS1-208ENST00000538616 JRKO75564 520 aa18.28■□□□□ 0.52
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CD27-AS1-208ENST00000538616 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa18.28■□□□□ 0.52
CD27-AS1-208ENST00000538616 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa18.28■□□□□ 0.52
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CD27-AS1-208ENST00000538616 CSNK1A1LQ8N752 337 aa18.28■□□□□ 0.52
CD27-AS1-208ENST00000538616 CABS1Q96KC9 395 aa18.28■□□□□ 0.52
CD27-AS1-208ENST00000538616 AGAP4Q96P64 663 aa18.28■□□□□ 0.52
CD27-AS1-208ENST00000538616 SGPP1Q9BX95 441 aa18.28■□□□□ 0.52
CD27-AS1-208ENST00000538616 GPAMQ9HCL2 828 aa18.28■□□□□ 0.52
CD27-AS1-208ENST00000538616 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa18.28■□□□□ 0.52
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CD27-AS1-208ENST00000538616 GSTA2P09210 222 aa18.27■□□□□ 0.52
CD27-AS1-208ENST00000538616 CDH1P12830 882 aa18.27■□□□□ 0.52
CD27-AS1-208ENST00000538616 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.52
CD27-AS1-208ENST00000538616 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.52
CD27-AS1-208ENST00000538616 RPTNQ6XPR3 784 aa18.27■□□□□ 0.52
CD27-AS1-208ENST00000538616 CYS1Q717R9 158 aa18.27■□□□□ 0.52
CD27-AS1-208ENST00000538616 OVCH1Q7RTY7 1134 aa18.27■□□□□ 0.52
CD27-AS1-208ENST00000538616 MRGPRGQ86SM5 289 aa18.27■□□□□ 0.52
CD27-AS1-208ENST00000538616 MMGT1Q8N4V1 131 aa18.27■□□□□ 0.52
CD27-AS1-208ENST00000538616 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.52
CD27-AS1-208ENST00000538616 PPM1NQ8N819 430 aa18.27■□□□□ 0.52
CD27-AS1-208ENST00000538616 FBF1Q8TES7 1133 aa18.27■□□□□ 0.52
CD27-AS1-208ENST00000538616 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP18.27■□□□□ 0.52
CD27-AS1-208ENST00000538616 RBBP8Q99708 897 aa18.27■□□□□ 0.52
CD27-AS1-208ENST00000538616 CPNE1Q99829 537 aa18.27■□□□□ 0.52
CD27-AS1-208ENST00000538616 MACROD1Q9BQ69 325 aa18.27■□□□□ 0.52
CD27-AS1-208ENST00000538616 TRIM54Q9BYV2 358 aa18.27■□□□□ 0.52
CD27-AS1-208ENST00000538616 PHACTR1Q9C0D0 580 aa18.27■□□□□ 0.52
CD27-AS1-208ENST00000538616 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP18.27■□□□□ 0.52
CD27-AS1-208ENST00000538616 EPS8L2Q9H6S3 715 aa18.27■□□□□ 0.52
CD27-AS1-208ENST00000538616 TMEM184CQ9NVA4 438 aa18.27■□□□□ 0.52
CD27-AS1-208ENST00000538616 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.52
CD27-AS1-208ENST00000538616 DCHS2Q6V1P9 2916 aa18.27■□□□□ 0.52
CD27-AS1-208ENST00000538616 NUP210LQ5VU65 1888 aa18.26■□□□□ 0.51
CD27-AS1-208ENST00000538616 ONECUT2O95948 504 aa18.26■□□□□ 0.51
CD27-AS1-208ENST00000538616 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
CD27-AS1-208ENST00000538616 NPPBP16860 134 aa18.26■□□□□ 0.51
CD27-AS1-208ENST00000538616 GMPRP36959 345 aa18.26■□□□□ 0.51
CD27-AS1-208ENST00000538616 GP5P40197 560 aa18.26■□□□□ 0.51
CD27-AS1-208ENST00000538616 SLC12A2P55011 1212 aa18.26■□□□□ 0.51
CD27-AS1-208ENST00000538616 AP1S2P56377 157 aa18.26■□□□□ 0.51
CD27-AS1-208ENST00000538616 CSNK1G2P78368 415 aa18.26■□□□□ 0.51
CD27-AS1-208ENST00000538616 POU4F1Q01851 419 aa18.26■□□□□ 0.51
CD27-AS1-208ENST00000538616 USP10Q14694 798 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
CD27-AS1-208ENST00000538616 NKG7Q16617 165 aa18.26■□□□□ 0.51
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