RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504971.1

FBXO38-208, Transcript of F-box protein 38, human

TSL 3

Gene FBXO38, Length 492 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FBXO38-208	ENST00000504971	ETFDH	Q16134	617 aa		6.54	□□□□□ -1.36
FBXO38-208	ENST00000504971	GOLGA7B	Q2TAP0	167 aa		6.54	□□□□□ -1.36
FBXO38-208	ENST00000504971	GAB4	Q2WGN9	574 aa		6.54	□□□□□ -1.36
FBXO38-208	ENST00000504971	PAN2	Q504Q3	1202 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
FBXO38-208	ENST00000504971	TIGD5	Q53EQ6	642 aa		6.54	□□□□□ -1.36
FBXO38-208	ENST00000504971	CLLU1OS	Q5K130	101 aa		6.54	□□□□□ -1.36
FBXO38-208	ENST00000504971	CDKL4	Q5MAI5	379 aa		6.54	□□□□□ -1.36
FBXO38-208	ENST00000504971	DCAF12L1	Q5VU92	463 aa		6.54	□□□□□ -1.36
FBXO38-208	ENST00000504971	BROX	Q5VW32	411 aa		6.54	□□□□□ -1.36
FBXO38-208	ENST00000504971	MLIP	Q5VWP3	458 aa		6.54	□□□□□ -1.36
FBXO38-208	ENST00000504971	WSCD1	Q658N2	575 aa		6.54	□□□□□ -1.36
FBXO38-208	ENST00000504971	ELP2	Q6IA86	826 aa		6.54	□□□□□ -1.36
FBXO38-208	ENST00000504971	OVOS1	Q6IE37	1185 aa		6.54	□□□□□ -1.36
FBXO38-208	ENST00000504971	KIAA0408	Q6ZU52	694 aa		6.54	□□□□□ -1.36
FBXO38-208	ENST00000504971	KCTD9	Q7L273	389 aa		6.54	□□□□□ -1.36
FBXO38-208	ENST00000504971	SLC26A9	Q7LBE3	791 aa		6.54	□□□□□ -1.36
FBXO38-208	ENST00000504971	TRMT11	Q7Z4G4	463 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
FBXO38-208	ENST00000504971	ZSCAN2	Q7Z7L9	614 aa	Predicted RBP	6.54	□□□□□ -1.36
FBXO38-208	ENST00000504971	KLHL7	Q8IXQ5	586 aa		6.54	□□□□□ -1.36
FBXO38-208	ENST00000504971	ADGRG2	Q8IZP9	1017 aa		6.54	□□□□□ -1.36
FBXO38-208	ENST00000504971	PDIK1L	Q8N165	341 aa		6.54	□□□□□ -1.36
FBXO38-208	ENST00000504971	FAM58A	Q8N1B3	248 aa		6.54	□□□□□ -1.36
FBXO38-208	ENST00000504971	BATF2	Q8N1L9	274 aa		6.54	□□□□□ -1.36
FBXO38-208	ENST00000504971	FRMD1	Q8N878	549 aa		6.54	□□□□□ -1.36
FBXO38-208	ENST00000504971	FAM181A	Q8N9Y4	354 aa		6.54	□□□□□ -1.36
FBXO38-208	ENST00000504971	NOA1	Q8NC60	698 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
FBXO38-208	ENST00000504971	B3GALNT2	Q8NCR0	500 aa		6.54	□□□□□ -1.36
FBXO38-208	ENST00000504971	DBF4B	Q8NFT6	615 aa		6.54	□□□□□ -1.36
FBXO38-208	ENST00000504971	OR10H5	Q8NGA6	315 aa		6.54	□□□□□ -1.36
FBXO38-208	ENST00000504971	OR14C36	Q8NHC7	312 aa		6.54	□□□□□ -1.36
FBXO38-208	ENST00000504971	ALG3	Q92685	438 aa		6.54	□□□□□ -1.36
FBXO38-208	ENST00000504971	CORO2A	Q92828	525 aa		6.54	□□□□□ -1.36
FBXO38-208	ENST00000504971	CAPZA3	Q96KX2	299 aa		6.54	□□□□□ -1.36
FBXO38-208	ENST00000504971	C9orf72	Q96LT7	481 aa		6.54	□□□□□ -1.36
FBXO38-208	ENST00000504971	UBL7	Q96S82	380 aa	Predicted RBP	6.54	□□□□□ -1.36
FBXO38-208	ENST00000504971	CYP2S1	Q96SQ9	504 aa		6.54	□□□□□ -1.36
FBXO38-208	ENST00000504971	DPYSL5	Q9BPU6	564 aa		6.54	□□□□□ -1.36
FBXO38-208	ENST00000504971	DUSP16	Q9BY84	665 aa		6.54	□□□□□ -1.36
FBXO38-208	ENST00000504971	ZYG11B	Q9C0D3	744 aa		6.54	□□□□□ -1.36
FBXO38-208	ENST00000504971	SLC6A15	Q9H2J7	730 aa		6.54	□□□□□ -1.36
FBXO38-208	ENST00000504971	LRRN3	Q9H3W5	708 aa		6.54	□□□□□ -1.36
FBXO38-208	ENST00000504971	GOLPH3	Q9H4A6	298 aa		6.54	□□□□□ -1.36
FBXO38-208	ENST00000504971	C11orf49	Q9H6J7	331 aa		6.54	□□□□□ -1.36
FBXO38-208	ENST00000504971	ANKZF1	Q9H8Y5	726 aa		6.54	□□□□□ -1.36
FBXO38-208	ENST00000504971	FAM118A	Q9NWS6	357 aa		6.54	□□□□□ -1.36
FBXO38-208	ENST00000504971	GIN1	Q9NXP7	522 aa		6.54	□□□□□ -1.36
FBXO38-208	ENST00000504971	GRHL1	Q9NZI5	618 aa		6.54	□□□□□ -1.36
FBXO38-208	ENST00000504971	CLEC2D	Q9UHP7	191 aa		6.54	□□□□□ -1.36
FBXO38-208	ENST00000504971	RAPGEFL1	Q9UHV5	662 aa		6.54	□□□□□ -1.36
FBXO38-208	ENST00000504971	MAGEL2	Q9UJ55	1249 aa		6.54	□□□□□ -1.36
FBXO38-208	ENST00000504971	TBX21	Q9UL17	535 aa		6.54	□□□□□ -1.36
FBXO38-208	ENST00000504971	FZD10	Q9ULW2	581 aa		6.54	□□□□□ -1.36
FBXO38-208	ENST00000504971	ARL2BP	Q9Y2Y0	163 aa		6.54	□□□□□ -1.36
FBXO38-208	ENST00000504971	VWA7	Q9Y334	891 aa		6.54	□□□□□ -1.36
FBXO38-208	ENST00000504971	PCDHB14	Q9Y5E9	798 aa		6.54	□□□□□ -1.36
FBXO38-208	ENST00000504971	FKBP7	Q9Y680	259 aa		6.54	□□□□□ -1.36
FBXO38-208	ENST00000504971	KCNMB2	Q9Y691	235 aa		6.54	□□□□□ -1.36
FBXO38-208	ENST00000504971	OAS3	Q9Y6K5	1087 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
FBXO38-208	ENST00000504971	TSC2	P49815	1807 aa		6.53	□□□□□ -1.36
FBXO38-208	ENST00000504971	TRBV2	A0A0J9YWF9	115 aa		6.53	□□□□□ -1.36
FBXO38-208	ENST00000504971	MTMR11	A4FU01	709 aa		6.53	□□□□□ -1.36
FBXO38-208	ENST00000504971	CASTOR2	A6NHX0	329 aa		6.53	□□□□□ -1.36
FBXO38-208	ENST00000504971	ARHGAP42	A6NI28	874 aa		6.53	□□□□□ -1.36
FBXO38-208	ENST00000504971	C2CD4B	A6NLJ0	364 aa		6.53	□□□□□ -1.36
FBXO38-208	ENST00000504971	AQP12B	A6NM10	295 aa		6.53	□□□□□ -1.36
FBXO38-208	ENST00000504971		F8W036	122 aa		6.53	□□□□□ -1.36
FBXO38-208	ENST00000504971		H7C0C1	242 aa		6.53	□□□□□ -1.36
FBXO38-208	ENST00000504971	TRIM77	I1YAP6	450 aa		6.53	□□□□□ -1.36
FBXO38-208	ENST00000504971	TLR4	O00206	839 aa		6.53	□□□□□ -1.36
FBXO38-208	ENST00000504971	PHGDH	O43175	533 aa	Known RBP	6.53	□□□□□ -1.36
FBXO38-208	ENST00000504971	PSMD3	O43242	534 aa		6.53	□□□□□ -1.36
FBXO38-208	ENST00000504971	COCH	O43405	550 aa		6.53	□□□□□ -1.36
FBXO38-208	ENST00000504971	KCNAB3	O43448	404 aa		6.53	□□□□□ -1.36
FBXO38-208	ENST00000504971	TGM5	O43548	720 aa		6.53	□□□□□ -1.36
FBXO38-208	ENST00000504971	MMP20	O60882	483 aa		6.53	□□□□□ -1.36
FBXO38-208	ENST00000504971	B3GAT3	O94766	335 aa		6.53	□□□□□ -1.36
FBXO38-208	ENST00000504971	OAZ2	O95190	189 aa		6.53	□□□□□ -1.36
FBXO38-208	ENST00000504971	F9	P00740	461 aa		6.53	□□□□□ -1.36
FBXO38-208	ENST00000504971	F10	P00742	488 aa		6.53	□□□□□ -1.36
FBXO38-208	ENST00000504971	POMC	P01189	267 aa		6.53	□□□□□ -1.36
FBXO38-208	ENST00000504971	IFNA6	P05013	189 aa		6.53	□□□□□ -1.36
FBXO38-208	ENST00000504971	TFPT	P0C1Z6	253 aa		6.53	□□□□□ -1.36
FBXO38-208	ENST00000504971	JUP	P14923	745 aa		6.53	□□□□□ -1.36
FBXO38-208	ENST00000504971	MYF6	P23409	242 aa		6.53	□□□□□ -1.36
FBXO38-208	ENST00000504971	LMO2	P25791	158 aa		6.53	□□□□□ -1.36
FBXO38-208	ENST00000504971	MAOB	P27338	520 aa		6.53	□□□□□ -1.36
FBXO38-208	ENST00000504971	PIK3R1	P27986	724 aa		6.53	□□□□□ -1.36
FBXO38-208	ENST00000504971	POU1F1	P28069	291 aa		6.53	□□□□□ -1.36
FBXO38-208	ENST00000504971	TACR3	P29371	465 aa		6.53	□□□□□ -1.36
FBXO38-208	ENST00000504971	PCK1	P35558	622 aa		6.53	□□□□□ -1.36
FBXO38-208	ENST00000504971	SLC1A3	P43003	542 aa		6.53	□□□□□ -1.36
FBXO38-208	ENST00000504971	RIDA	P52758	137 aa	Known RBP	6.53	□□□□□ -1.36
FBXO38-208	ENST00000504971	SEC24C	P53992	1094 aa		6.53	□□□□□ -1.36
FBXO38-208	ENST00000504971	PRKAG1	P54619	331 aa		6.53	□□□□□ -1.36
FBXO38-208	ENST00000504971	ARF6	P62330	175 aa		6.53	□□□□□ -1.36
FBXO38-208	ENST00000504971	RPL7A	P62424	266 aa	Known RBP	6.53	□□□□□ -1.36
FBXO38-208	ENST00000504971	SLC6A3	Q01959	620 aa		6.53	□□□□□ -1.36
FBXO38-208	ENST00000504971	TSPAN31	Q12999	210 aa		6.53	□□□□□ -1.36
FBXO38-208	ENST00000504971	PRKAA1	Q13131	559 aa		6.53	□□□□□ -1.36
FBXO38-208	ENST00000504971	DCTN2	Q13561	401 aa	Known RBP	6.53	□□□□□ -1.36

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