RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496574.6

PKD1-222, Transcript of polycystin 1, transient receptor potential channel interacting, human

TSL 5

Gene PKD1, Length 4,419 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PKD1-222	ENST00000496574	FAM110B	Q8TC76	370 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PKD1-222	ENST00000496574	C3orf30	Q96M34	536 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PKD1-222	ENST00000496574	CAMK1G	Q96NX5	476 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PKD1-222	ENST00000496574	WDR83	Q9BRX9	315 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
PKD1-222	ENST00000496574	TSSK6	Q9BXA6	273 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PKD1-222	ENST00000496574	TNKS2	Q9H2K2	1166 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PKD1-222	ENST00000496574	ELAC1	Q9H777	363 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
PKD1-222	ENST00000496574	NLE1	Q9NVX2	485 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
PKD1-222	ENST00000496574	RHCG	Q9UBD6	479 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PKD1-222	ENST00000496574	NLK	Q9UBE8	527 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PKD1-222	ENST00000496574	EXTL2	Q9UBQ6	330 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PKD1-222	ENST00000496574	MAFK	O60675	156 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PKD1-222	ENST00000496574	HTR1B	P28222	390 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PKD1-222	ENST00000496574	SHMT2	P34897	504 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PKD1-222	ENST00000496574	FOXA1	P55317	472 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PKD1-222	ENST00000496574	TSPAN5	P62079	268 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PKD1-222	ENST00000496574	KCNC4	Q03721	635 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PKD1-222	ENST00000496574	PPIG	Q13427	754 aa	Known RBP eCLIP	13.72	□□□□□ -0.21	1e-6	■■□□□ 13
PKD1-222	ENST00000496574	SNAP47	Q5SQN1	464 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PKD1-222	ENST00000496574	CHCHD4	Q8N4Q1	142 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PKD1-222	ENST00000496574	C1orf216	Q8TAB5	229 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PKD1-222	ENST00000496574	SHKBP1	Q8TBC3	707 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PKD1-222	ENST00000496574	SLC35G5	Q96KT7	338 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PKD1-222	ENST00000496574	CRTAC1	Q9NQ79	661 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PKD1-222	ENST00000496574	APOL3	O95236	402 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PKD1-222	ENST00000496574	BMP4	P12644	408 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PKD1-222	ENST00000496574	DNASE1	P24855	282 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PKD1-222	ENST00000496574	GUCA1A	P43080	201 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
PKD1-222	ENST00000496574	CRISP3	P54108	245 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PKD1-222	ENST00000496574	CDH11	P55287	796 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PKD1-222	ENST00000496574	SPIN4	Q56A73	249 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PKD1-222	ENST00000496574	RANBP10	Q6VN20	620 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PKD1-222	ENST00000496574	VTCN1	Q7Z7D3	282 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PKD1-222	ENST00000496574	PPIL3	Q9H2H8	161 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
PKD1-222	ENST00000496574	BEX1	Q9HBH7	125 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PKD1-222	ENST00000496574	IL37	Q9NZH6	218 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PKD1-222	ENST00000496574	PIR	O00625	290 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PKD1-222	ENST00000496574	CELF2	O95319	508 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
PKD1-222	ENST00000496574	OR1D2	P34982	312 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PKD1-222	ENST00000496574	DGKG	P49619	791 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PKD1-222	ENST00000496574	ARL4D	P49703	201 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PKD1-222	ENST00000496574	HTR6	P50406	440 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PKD1-222	ENST00000496574	ZNHIT3	Q15649	155 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
PKD1-222	ENST00000496574	NDUFA9	Q16795	377 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PKD1-222	ENST00000496574	C22orf42	Q6IC83	251 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PKD1-222	ENST00000496574	CEP76	Q8TAP6	659 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PKD1-222	ENST00000496574	FUBP3	Q96I24	572 aa	Known RBP eCLIP	13.71	□□□□□ -0.21
PKD1-222	ENST00000496574	MAEL	Q96JY0	434 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
PKD1-222	ENST00000496574	SLC6A15	Q9H2J7	730 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PKD1-222	ENST00000496574	ZCCHC3	Q9NUD5	404 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
PKD1-222	ENST00000496574	IKZF2	Q9UKS7	526 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PKD1-222	ENST00000496574	PADI3	Q9ULW8	664 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PKD1-222	ENST00000496574	MGAT4B	Q9UQ53	548 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PKD1-222	ENST00000496574	PCDHB14	Q9Y5E9	798 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PKD1-222	ENST00000496574	FXYD6-FXYD2	A0A087WZ82	144 aa		13.71	□□□□□ -0.22
PKD1-222	ENST00000496574	ABHD14A-ACY1	A0A1B0GW23	586 aa		13.71	□□□□□ -0.22
PKD1-222	ENST00000496574	SAP18	O00422	153 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.22
PKD1-222	ENST00000496574	HIST1H2AB	P04908	130 aa		13.71	□□□□□ -0.22
PKD1-222	ENST00000496574	SLC35G4	P0C7Q5	338 aa		13.71	□□□□□ -0.22
PKD1-222	ENST00000496574	CEL	P19835	753 aa		13.71	□□□□□ -0.22
PKD1-222	ENST00000496574	RYK	P34925	604 aa		13.71	□□□□□ -0.22
PKD1-222	ENST00000496574	GSTM4	Q03013	218 aa		13.71	□□□□□ -0.22
PKD1-222	ENST00000496574	KHDRBS2	Q5VWX1	349 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.22
PKD1-222	ENST00000496574	NCEH1	Q6PIU2	408 aa		13.71	□□□□□ -0.22
PKD1-222	ENST00000496574	FRRS1	Q6ZNA5	592 aa		13.71	□□□□□ -0.22
PKD1-222	ENST00000496574	HIST3H2A	Q7L7L0	130 aa		13.71	□□□□□ -0.22
PKD1-222	ENST00000496574	GPC2	Q8N158	579 aa		13.71	□□□□□ -0.22
PKD1-222	ENST00000496574	LINC00471	Q8N535	108 aa		13.71	□□□□□ -0.22
PKD1-222	ENST00000496574	SETD6	Q8TBK2	473 aa		13.71	□□□□□ -0.22
PKD1-222	ENST00000496574	HIST1H2AC	Q93077	130 aa		13.71	□□□□□ -0.22
PKD1-222	ENST00000496574	FXYD6	Q9H0Q3	95 aa		13.71	□□□□□ -0.22
PKD1-222	ENST00000496574	ABCG5	Q9H222	651 aa		13.71	□□□□□ -0.22
PKD1-222	ENST00000496574	FOLH1B	Q9HBA9	442 aa		13.71	□□□□□ -0.22
PKD1-222	ENST00000496574	CD84	Q9UIB8	345 aa		13.71	□□□□□ -0.22
PKD1-222	ENST00000496574		H7C2Y5	167 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PKD1-222	ENST00000496574	BEST1	O76090	585 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PKD1-222	ENST00000496574	RAB36	O95755	333 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PKD1-222	ENST00000496574	ALPL	P05186	524 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PKD1-222	ENST00000496574	BCHE	P06276	602 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PKD1-222	ENST00000496574	GRSF1	Q12849	480 aa	Known RBP eCLIP	13.7	□□□□□ -0.22
PKD1-222	ENST00000496574	TUBB3	Q13509	450 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PKD1-222	ENST00000496574	KEAP1	Q14145	624 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PKD1-222	ENST00000496574	SLC9A5	Q14940	896 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PKD1-222	ENST00000496574	NOXRED1	Q6NXP6	359 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PKD1-222	ENST00000496574	RTL4	Q6ZR62	310 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PKD1-222	ENST00000496574	C14orf80	Q86SX3	495 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PKD1-222	ENST00000496574	GDPD1	Q8N9F7	314 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PKD1-222	ENST00000496574	POMGNT2	Q8NAT1	580 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PKD1-222	ENST00000496574	RFT1	Q96AA3	541 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PKD1-222	ENST00000496574	PTER	Q96BW5	349 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PKD1-222	ENST00000496574	TTPAL	Q9BTX7	342 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PKD1-222	ENST00000496574	BTBD1	Q9H0C5	482 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PKD1-222	ENST00000496574	STARD7	Q9NQZ5	370 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PKD1-222	ENST00000496574	MRPL17	Q9NRX2	175 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
PKD1-222	ENST00000496574	CALML5	Q9NZT1	146 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PKD1-222	ENST00000496574	MARK1	Q9P0L2	795 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PKD1-222	ENST00000496574	PCTP	Q9UKL6	214 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PKD1-222	ENST00000496574	MAU2	Q9Y6X3	613 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PKD1-222	ENST00000496574	ALPI	P09923	528 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PKD1-222	ENST00000496574	CXCR4	P61073	352 aa		13.7	□□□□□ -0.22

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