RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494297.5

SRPRB-205, Transcript of SRP receptor subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene SRPRB, Length 555 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRB-205ENST00000494297 KATNA1O75449 491 aa5.12□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 SUPT3HO75486 399 aa5.12□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 CREG1O75629 220 aa5.12□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 MED26O95402 600 aa5.12□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 SMIM10L1P0DMW3 83 aa5.12□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 GFAPP14136 432 aa5.12□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 EPB42P16452 691 aa5.12□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 KRT15P19012 456 aa5.12□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 KRT4P19013 534 aa5.12□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 WT1P19544 449 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 TAC1P20366 129 aa5.12□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 ALAS2P22557 587 aa5.12□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 CRHR1P34998 444 aa5.12□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 DLSTP36957 453 aa5.12□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 BCL6P41182 706 aa5.12□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 SLCO1A2P46721 670 aa5.12□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 CCT5P48643 541 aa5.12□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 GSK3AP49840 483 aa5.12□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 AGTR2P50052 363 aa5.12□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 RPS15P62841 145 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 NFKB2Q00653 900 aa5.12□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 REEP5Q00765 189 aa5.12□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 MC1RQ01726 317 aa5.12□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 IFFO1Q0D2I5 559 aa5.12□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 DNASE1L3Q13609 305 aa5.12□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 PWP1Q13610 501 aa5.12□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 DOC2AQ14183 400 aa5.12□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 SSPNQ14714 243 aa5.12□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 PDK4Q16654 411 aa5.12□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 NDUFA9Q16795 377 aa5.12□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 HKDC1Q2TB90 917 aa5.12□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 COL28A1Q2UY09 1125 aa5.12□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 CCDC153Q494R4 210 aa5.12□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa5.12□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 FBXO48Q5FWF7 155 aa5.12□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa5.12□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa5.12□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 LIPJQ5W064 366 aa5.12□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 NIPAL1Q6NVV3 410 aa5.12□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 PRMT9Q6P2P2 845 aa5.12□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa5.12□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 TTLL10Q6ZVT0 673 aa5.12□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 OVCH1Q7RTY7 1134 aa5.12□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 GPR155Q7Z3F1 870 aa5.12□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 VN1R4Q7Z5H5 301 aa5.12□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 TMPRSS11BQ86T26 416 aa5.12□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 SYVN1Q86TM6 617 aa5.12□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 ASPGQ86U10 573 aa5.12□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 TRABD2AQ86V40 505 aa5.12□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 PLD3Q8IV08 490 aa5.12□□□□□ -1.59
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SRPRB-205ENST00000494297 CSNK1A1LQ8N752 337 aa5.12□□□□□ -1.59
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SRPRB-205ENST00000494297 ZNF740Q8NDX6 193 aa5.12□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 TRPV3Q8NET8 790 aa5.12□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 TTLQ8NG68 377 aa5.12□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 NT5CQ8TCD5 201 aa5.12□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 CREB3L4Q8TEY5 395 aa5.12□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 MR1Q95460 341 aa5.12□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 FKBP10Q96AY3 582 aa5.12□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 NACC2Q96BF6 587 aa5.12□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 SMIM10Q96HG1 83 aa5.12□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 SCYL1Q96KG9 808 aa5.12□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 C10orf90Q96M02 699 aa5.12□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 EFCAB11Q9BUY7 163 aa5.12□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 NTMT1Q9BV86 223 aa5.12□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa5.12□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 CHST8Q9H2A9 424 aa5.12□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 SLC26A1Q9H2B4 701 aa5.12□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 SPNS1Q9H2V7 528 aa5.12□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 RHBGQ9H310 441 aa5.12□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 CPNE5Q9HCH3 593 aa5.12□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 ZNF304Q9HCX3 659 aa5.12□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 SLC22A11Q9NSA0 550 aa5.12□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 TXLNGQ9NUQ3 528 aa5.12□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 IRAK4Q9NWZ3 460 aa5.12□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 MKS1Q9NXB0 559 aa5.12□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 PSD3Q9NYI0 1048 aa5.12□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 XPR1Q9UBH6 696 aa5.12□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 OPTCQ9UBM4 332 aa5.12□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 GRID1Q9ULK0 1009 aa5.12□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 CDC14AQ9UNH5 594 aa5.12□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 PLAAQ9Y263 795 aa5.12□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa5.12□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 ASB1Q9Y576 335 aa5.12□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 SLC22A7Q9Y694 548 aa5.12□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 ADAMTS20P59510 1910 aa5.12□□□□□ -1.59
SRPRB-205ENST00000494297 UNC13CQ8NB66 2214 aa5.11□□□□□ -1.59
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