RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489621.1

PDCL3P4-201, Transcript of phosducin-like 3 pseudogene 4, humanhuman

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Gene PDCL3P4, Length 720 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL3P4-201ENST00000489621 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
PDCL3P4-201ENST00000489621 FGF18O76093 207 aa5.69□□□□□ -1.5
PDCL3P4-201ENST00000489621 SLCO2B1O94956 709 aa5.69□□□□□ -1.5
PDCL3P4-201ENST00000489621 PRSS23O95084 383 aa5.69□□□□□ -1.5
PDCL3P4-201ENST00000489621 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
PDCL3P4-201ENST00000489621 CLDN9O95484 217 aa5.69□□□□□ -1.5
PDCL3P4-201ENST00000489621 RB1P06400 928 aa5.69□□□□□ -1.5
PDCL3P4-201ENST00000489621 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
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PDCL3P4-201ENST00000489621 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
PDCL3P4-201ENST00000489621 LINC00032P0C843 101 aa5.69□□□□□ -1.5
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PDCL3P4-201ENST00000489621 SRCP12931 536 aa5.69□□□□□ -1.5
PDCL3P4-201ENST00000489621 BPIP17213 487 aa5.69□□□□□ -1.5
PDCL3P4-201ENST00000489621 PTPN2P17706 415 aa5.69□□□□□ -1.5
PDCL3P4-201ENST00000489621 PSMC3P17980 439 aa5.69□□□□□ -1.5
PDCL3P4-201ENST00000489621 RPL17P18621 184 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
PDCL3P4-201ENST00000489621 HIST1H2ADP20671 130 aa5.69□□□□□ -1.5
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PDCL3P4-201ENST00000489621 HNF1BP35680 557 aa5.69□□□□□ -1.5
PDCL3P4-201ENST00000489621 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
PDCL3P4-201ENST00000489621 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
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PDCL3P4-201ENST00000489621 FOXA1P55317 472 aa5.69□□□□□ -1.5
PDCL3P4-201ENST00000489621 NME5P56597 212 aa5.69□□□□□ -1.5
PDCL3P4-201ENST00000489621 CLDN8P56748 225 aa5.69□□□□□ -1.5
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PDCL3P4-201ENST00000489621 TRAF3Q13114 568 aa5.69□□□□□ -1.5
PDCL3P4-201ENST00000489621 GPM6BQ13491 265 aa5.69□□□□□ -1.5
PDCL3P4-201ENST00000489621 NFYCQ13952 458 aa5.69□□□□□ -1.5
PDCL3P4-201ENST00000489621 E2F2Q14209 437 aa5.69□□□□□ -1.5
PDCL3P4-201ENST00000489621 PTPRCAPQ14761 206 aa5.69□□□□□ -1.5
PDCL3P4-201ENST00000489621 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
PDCL3P4-201ENST00000489621 KCTD21Q4G0X4 260 aa5.69□□□□□ -1.5
PDCL3P4-201ENST00000489621 PITRM1Q5JRX3 1037 aa5.69□□□□□ -1.5
PDCL3P4-201ENST00000489621 CACHD1Q5VU97 1274 aa5.69□□□□□ -1.5
PDCL3P4-201ENST00000489621 LIPJQ5W064 366 aa5.69□□□□□ -1.5
PDCL3P4-201ENST00000489621 LPCAT4Q643R3 524 aa5.69□□□□□ -1.5
PDCL3P4-201ENST00000489621 ATG9BQ674R7 924 aa5.69□□□□□ -1.5
PDCL3P4-201ENST00000489621 TXNDC8Q6A555 127 aa5.69□□□□□ -1.5
PDCL3P4-201ENST00000489621 NANOGP8Q6NSW7 305 aa5.69□□□□□ -1.5
PDCL3P4-201ENST00000489621 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa5.69□□□□□ -1.5
PDCL3P4-201ENST00000489621 CPNE9Q8IYJ1 553 aa5.69□□□□□ -1.5
PDCL3P4-201ENST00000489621 NRSN1Q8IZ57 195 aa5.69□□□□□ -1.5
PDCL3P4-201ENST00000489621 CMTM8Q8IZV2 173 aa5.69□□□□□ -1.5
PDCL3P4-201ENST00000489621 L3MBTL4Q8NA19 623 aa5.69□□□□□ -1.5
PDCL3P4-201ENST00000489621 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
PDCL3P4-201ENST00000489621 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
PDCL3P4-201ENST00000489621 MCOLN3Q8TDD5 553 aa5.69□□□□□ -1.5
PDCL3P4-201ENST00000489621 OSCP1Q8WVF1 389 aa5.69□□□□□ -1.5
PDCL3P4-201ENST00000489621 UCMAQ8WVF2 138 aa5.69□□□□□ -1.5
PDCL3P4-201ENST00000489621 ASZ1Q8WWH4 475 aa5.69□□□□□ -1.5
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PDCL3P4-201ENST00000489621 TESCQ96BS2 214 aa5.69□□□□□ -1.5
PDCL3P4-201ENST00000489621 MOCOSQ96EN8 888 aa5.69□□□□□ -1.5
PDCL3P4-201ENST00000489621 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa5.69□□□□□ -1.5
PDCL3P4-201ENST00000489621 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
PDCL3P4-201ENST00000489621 MARK4Q96L34 752 aa5.69□□□□□ -1.5
PDCL3P4-201ENST00000489621 RIPOR3Q96MK2 946 aa5.69□□□□□ -1.5
PDCL3P4-201ENST00000489621 KLHL32Q96NJ5 620 aa5.69□□□□□ -1.5
PDCL3P4-201ENST00000489621 VPS35Q96QK1 796 aa5.69□□□□□ -1.5
PDCL3P4-201ENST00000489621 TSC22D3Q99576 134 aa5.69□□□□□ -1.5
PDCL3P4-201ENST00000489621 ZBTB18Q99592 522 aa5.69□□□□□ -1.5
PDCL3P4-201ENST00000489621 HIST1H2AJQ99878 128 aa5.69□□□□□ -1.5
PDCL3P4-201ENST00000489621 PKP2Q99959 881 aa5.69□□□□□ -1.5
PDCL3P4-201ENST00000489621 H2AFJQ9BTM1 129 aa5.69□□□□□ -1.5
PDCL3P4-201ENST00000489621 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa5.69□□□□□ -1.5
PDCL3P4-201ENST00000489621 SPATA9Q9BWV2 254 aa5.69□□□□□ -1.5
PDCL3P4-201ENST00000489621 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
PDCL3P4-201ENST00000489621 UGT2B28Q9BY64 529 aa5.69□□□□□ -1.5
PDCL3P4-201ENST00000489621 MAGIXQ9H6Y5 334 aa5.69□□□□□ -1.5
PDCL3P4-201ENST00000489621 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
PDCL3P4-201ENST00000489621 IPPKQ9H8X2 491 aa5.69□□□□□ -1.5
PDCL3P4-201ENST00000489621 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
PDCL3P4-201ENST00000489621 NANOGQ9H9S0 305 aa5.69□□□□□ -1.5
PDCL3P4-201ENST00000489621 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
PDCL3P4-201ENST00000489621 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
PDCL3P4-201ENST00000489621 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa5.69□□□□□ -1.5
PDCL3P4-201ENST00000489621 PNPLA3Q9NST1 481 aa5.69□□□□□ -1.5
PDCL3P4-201ENST00000489621 OLAHQ9NV23 265 aa5.69□□□□□ -1.5
PDCL3P4-201ENST00000489621 CFAP97Q9P2B7 532 aa5.69□□□□□ -1.5
PDCL3P4-201ENST00000489621 OPTCQ9UBM4 332 aa5.69□□□□□ -1.5
PDCL3P4-201ENST00000489621 CRLS1Q9UJA2 301 aa5.69□□□□□ -1.5
PDCL3P4-201ENST00000489621 SNX6Q9UNH7 406 aa5.69□□□□□ -1.5
PDCL3P4-201ENST00000489621 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa5.69□□□□□ -1.5
PDCL3P4-201ENST00000489621 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa5.69□□□□□ -1.5
PDCL3P4-201ENST00000489621 CCL27Q9Y4X3 112 aa5.69□□□□□ -1.5
PDCL3P4-201ENST00000489621 AP4B1Q9Y6B7 739 aa5.69□□□□□ -1.5
PDCL3P4-201ENST00000489621 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
PDCL3P4-201ENST00000489621 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa5.68□□□□□ -1.5
PDCL3P4-201ENST00000489621 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
PDCL3P4-201ENST00000489621 C5orf67F2Z3F1 127 aa5.68□□□□□ -1.5
PDCL3P4-201ENST00000489621 OR7A17O14581 309 aa5.68□□□□□ -1.5
PDCL3P4-201ENST00000489621 PER2O15055 1255 aa5.68□□□□□ -1.5
PDCL3P4-201ENST00000489621 TAPBPO15533 448 aa5.68□□□□□ -1.5
PDCL3P4-201ENST00000489621 OR1I1O60431 355 aa5.68□□□□□ -1.5
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