RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486261.5

KRIT1-222, Transcript of KRIT1, ankyrin repeat containing, human

TSL 1 (best)

Gene KRIT1, Length 4,057 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KRIT1-222	ENST00000486261	PSMB7	Q99436	277 aa		4.68	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	COPS8	Q99627	209 aa		4.68	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	CIB1	Q99828	191 aa		4.68	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	RSRP1	Q9BUV0	290 aa		4.68	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	ITPA	Q9BY32	194 aa		4.68	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	PRRG3	Q9BZD7	231 aa		4.68	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	REXO4	Q9GZR2	422 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	NHEJ1	Q9H9Q4	299 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	GLOD4	Q9HC38	313 aa		4.68	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	TRIM39	Q9HCM9	518 aa		4.68	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	VCX3A	Q9NNX9	186 aa		4.68	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	PLSCR4	Q9NRQ2	329 aa		4.68	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	TMPRSS4	Q9NRS4	437 aa		4.68	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	POT1	Q9NUX5	634 aa		4.68	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	C2orf42	Q9NWW7	574 aa		4.68	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	TXNDC16	Q9P2K2	825 aa		4.68	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	DRG1	Q9Y295	367 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	PRSS38	A1L453	326 aa		4.67	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	C5orf51	A6NDU8	294 aa		4.67	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	ZSCAN5B	A6NJL1	495 aa		4.67	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261		K7ERQ8	282 aa		4.67	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	ARHGAP6	O43182	974 aa		4.67	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	SMAD6	O43541	496 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	CST8	O60676	142 aa		4.67	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	ZMPSTE24	O75844	475 aa		4.67	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	SPDEF	O95238	335 aa		4.67	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	FES	P07332	822 aa		4.67	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	ERVK-10	P10266	1014 aa		4.67	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	TNNI3	P19429	210 aa		4.67	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	DRD3	P35462	400 aa		4.67	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	MMP12	P39900	470 aa		4.67	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	BMX	P51813	675 aa		4.67	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	CORO7	P57737	925 aa		4.67	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	EIF3E	P60228	445 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	PFN3	P60673	137 aa		4.67	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	EEF1A1	P68104	462 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	EEF1A2	Q05639	463 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	GPS1	Q13098	491 aa		4.67	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	C2CD6	Q53TS8	623 aa		4.67	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	TFDP3	Q5H9I0	405 aa		4.67	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	EEF1A1P5	Q5VTE0	462 aa		4.67	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	ZNF551	Q7Z340	670 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	NUDCD3	Q8IVD9	361 aa		4.67	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	UNC5B	Q8IZJ1	945 aa		4.67	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	NKAIN3	Q8N8D7	197 aa		4.67	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	BLOC1S5	Q8TDH9	187 aa		4.67	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	RASSF5	Q8WWW0	418 aa		4.67	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	TSACC	Q96A04	125 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	TP53INP1	Q96A56	240 aa		4.67	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	RFT1	Q96AA3	541 aa		4.67	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	SGF29	Q96ES7	293 aa		4.67	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	DPH2	Q9BQC3	489 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	DDX47	Q9H0S4	455 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	EPB41L4B	Q9H329	900 aa		4.67	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	C12orf65	Q9H3J6	166 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	C10orf88	Q9H8K7	445 aa		4.67	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	CENPM	Q9NSP4	180 aa		4.67	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	TAS2R3	Q9NYW6	316 aa		4.67	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	IL20	Q9NYY1	176 aa		4.67	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	VPS4A	Q9UN37	437 aa		4.67	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	OR51B4	Q9Y5P0	310 aa		4.67	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	SNX10	Q9Y5X0	201 aa		4.67	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	ATG2B	Q96BY7	2078 aa		4.67	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261		A0A0J9YYE9	177 aa		4.67	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	CCDC154	A6NI56	674 aa		4.67	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	TXNDC9	O14530	226 aa		4.67	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	YY2	O15391	372 aa		4.67	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	ZNF208	O43345	1280 aa		4.67	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	MFAP3L	O75121	409 aa		4.67	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	TGM6	O95932	706 aa		4.67	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	TRBC1	P01850	177 aa		4.67	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	RD3L	P0DJH9	198 aa		4.67	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	KDELR1	P24390	212 aa		4.67	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	MC5R	P33032	325 aa		4.67	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	SGSH	P51688	502 aa		4.67	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	HTD2	P86397	168 aa		4.67	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	HHEX	Q03014	270 aa		4.67	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	SRSF11	Q05519	484 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	DPT	Q07507	201 aa		4.67	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	FZD2	Q14332	565 aa		4.67	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	MPEG1	Q2M385	716 aa		4.67	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	FASTKD1	Q53R41	847 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	ZNF542P	Q5EBM4	170 aa		4.67	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	ALS2CL	Q60I27	953 aa		4.67	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	CHST15	Q7LFX5	561 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	BHLHA9	Q7RTU4	235 aa		4.67	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	ZNF571	Q7Z3V5	609 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	VSTM4	Q8IW00	320 aa		4.67	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	CACNA2D3	Q8IZS8	1091 aa		4.67	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	DCBLD1	Q8N8Z6	715 aa		4.67	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	TEX47	Q8TBZ9	253 aa		4.67	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	GATAD2B	Q8WXI9	593 aa		4.67	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	SLC39A7	Q92504	469 aa		4.67	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	FCGR1B	Q92637	280 aa		4.67	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	HSH2D	Q96JZ2	352 aa		4.67	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	OLFM3	Q96PB7	478 aa		4.67	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	RBM15	Q96T37	977 aa	Known RBP eCLIP	4.67	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	MGME1	Q9BQP7	344 aa		4.67	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	ZSWIM1	Q9BR11	485 aa		4.67	□□□□□ -1.66
KRIT1-222	ENST00000486261	SMPD3	Q9NY59	655 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66

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